An??lise do perfil de express??o proteica da linhagem celular humana de adenocarcinoma renal, 786-O, submetida ?? radia????o ionizante
Autor(a) principal: | |
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Data de Publicação: | 2018 |
Tipo de documento: | Dissertação |
Título da fonte: | Repositório Institucional do IPEN |
Texto Completo: | http://repositorio.ipen.br/handle/123456789/30174 |
Resumo: | O carcinoma de c??lulas renais (CCR) representa 3% das neoplasias humanas e aproximadamente 90% das neoplasias renais e entre os tumores urol??gicos. O CCR ?? bastante resistente ?? radioterapia convencional. Entretanto, com o aparecimento de novas t??cnicas/equipamentos ?? possivel a aplica????o de doses com precis??o presevando-se os tecidos adjacentes. Para a verifica????o da express??o proteica em diferentes tecidos e fluidos corporais, foi utilizado o estudo prote??mico sob diferentes condi????es e / ou tempos. A espectrometria de massa permite a identifica????o e quantifica????o de milhares de prote??nas e pept??deos em fluidos biol??gicos ou c??lulas lisadas, sendo assim uma ferramenta poderosa para identifica????o de potenciais biomarcadores de doen??as. A finalidade deste trabalho foi analisar o perfil proteico das c??lulas de adenocarcinoma renal (786-0) ap??s a radia????o com doses que variaram de 2 a 10 Gy. Os dados foram tratados com o programa One-way ANOVA seguida do de Bonferroni. Pelo ensaio de clonogenicidade definiou-se a dose de 8 Gy como a ideal estudos. A extra????o das prote??nas citoplasm??ticas foi realizada com o kit de extra????o do proteoma subcelular PE e a quantifica????o das prote??nas feita pelo m??todo de Lowry. A integridade das prote??nas foi analisada por SDS-PAGE e a solu????o proteica foi verificada em LTQ Orbitrap. Os resultados gerados foram analisados pelo servidor MASCOT para a busca de pept??deos. A an??lise por espectrometria de massa foi poss??vel identificar 44 prote??nas nas amostras n??o irradiadas - e 87 das amostras irradiadas. Nas amostras n??o irradiadas a distribui????o dos grupos funcionais foi de s??ntese proteica 46,66%; Metabolismo energ??tico 16,66%; Migra????o e prolifera????o 16,66%; Antioxidantes 3,33%. No grupo irradiado s??ntese proteica 35,89%; Metabolismo energ??tico 20,51%; Migra????o e prolifera????o 20,51%; Antioxidantes 5,12%; Chaperonas moleculares 5,12% e Endopeptidases 5,12%. Em seguida, analisou-se o espetro de as sequ??ncias com escores acima de 40. Nas amostras irradiadas encontrou-se: ENO1 (47 kDa); A VIM (53 kDa)/ HEL113; PSMA1; TRAJ56; hCG; Cofilina-1 (19 kDa); HIST1H4H; PKM2; ANXA1; HSPB1/ HSP27. Deste grupo, entendemos que a subunidade alfa do proteassoma - tipo 1 (PSMA1), que possui uma atividade molecular de endopeptidase, seja um alvo interessante para estudos posteriores. |
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Maria Helena Bellini MarumoSILVA, EVELIN C.da20182019-10-03T17:15:25Z2019-10-03T17:15:25Zhttp://repositorio.ipen.br/handle/123456789/3017410.11606/D.85.2019.tde-10092019-115524O carcinoma de c??lulas renais (CCR) representa 3% das neoplasias humanas e aproximadamente 90% das neoplasias renais e entre os tumores urol??gicos. O CCR ?? bastante resistente ?? radioterapia convencional. Entretanto, com o aparecimento de novas t??cnicas/equipamentos ?? possivel a aplica????o de doses com precis??o presevando-se os tecidos adjacentes. Para a verifica????o da express??o proteica em diferentes tecidos e fluidos corporais, foi utilizado o estudo prote??mico sob diferentes condi????es e / ou tempos. A espectrometria de massa permite a identifica????o e quantifica????o de milhares de prote??nas e pept??deos em fluidos biol??gicos ou c??lulas lisadas, sendo assim uma ferramenta poderosa para identifica????o de potenciais biomarcadores de doen??as. A finalidade deste trabalho foi analisar o perfil proteico das c??lulas de adenocarcinoma renal (786-0) ap??s a radia????o com doses que variaram de 2 a 10 Gy. Os dados foram tratados com o programa One-way ANOVA seguida do de Bonferroni. Pelo ensaio de clonogenicidade definiou-se a dose de 8 Gy como a ideal estudos. A extra????o das prote??nas citoplasm??ticas foi realizada com o kit de extra????o do proteoma subcelular PE e a quantifica????o das prote??nas feita pelo m??todo de Lowry. A integridade das prote??nas foi analisada por SDS-PAGE e a solu????o proteica foi verificada em LTQ Orbitrap. Os resultados gerados foram analisados pelo servidor MASCOT para a busca de pept??deos. A an??lise por espectrometria de massa foi poss??vel identificar 44 prote??nas nas amostras n??o irradiadas - e 87 das amostras irradiadas. Nas amostras n??o irradiadas a distribui????o dos grupos funcionais foi de s??ntese proteica 46,66%; Metabolismo energ??tico 16,66%; Migra????o e prolifera????o 16,66%; Antioxidantes 3,33%. No grupo irradiado s??ntese proteica 35,89%; Metabolismo energ??tico 20,51%; Migra????o e prolifera????o 20,51%; Antioxidantes 5,12%; Chaperonas moleculares 5,12% e Endopeptidases 5,12%. Em seguida, analisou-se o espetro de as sequ??ncias com escores acima de 40. Nas amostras irradiadas encontrou-se: ENO1 (47 kDa); A VIM (53 kDa)/ HEL113; PSMA1; TRAJ56; hCG; Cofilina-1 (19 kDa); HIST1H4H; PKM2; ANXA1; HSPB1/ HSP27. Deste grupo, entendemos que a subunidade alfa do proteassoma - tipo 1 (PSMA1), que possui uma atividade molecular de endopeptidase, seja um alvo interessante para estudos posteriores.Submitted by Celia Satomi Uehara (celia.u-topservice@ipen.br) on 2019-10-03T17:15:25Z No. of bitstreams: 0Made available in DSpace on 2019-10-03T17:15:25Z (GMT). No. of bitstreams: 0Disserta????o (Mestrado em Tecnologia Nuclear)IPEN/DInstituto de Pesquisas Energ??ticas e Nucleares - IPEN-CNEN/SP52carcinomasneoplasmskidneysurogenital system diseasesgene recombination proteinsanimal cellscell culturesionizing radiationsmass spectroscopyradiation dose unitsbiological radiation effectsAn??lise do perfil de express??o proteica da linhagem celular humana de adenocarcinoma renal, 786-O, submetida ?? radia????o ionizanteProtein expression profile analysis of renal carcinoma cell, 786-0, submitted to ionizing irradiationinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisNS??o Paulo12129600info:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional do IPENinstname:Instituto de Pesquisas Energéticas e Nucleares (IPEN)instacron:IPEN25954SILVA, EVELIN C.da19-10http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/85/85131/tde-10092019-115524/pt-br.php12129SILVA, EVELIN C.da:12129:820:SLICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81748http://repositorio.ipen.br/bitstream/123456789/30174/1/license.txt8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD51123456789/301742020-03-23 20:13:54.539oai:repositorio.ipen.br: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Repositório InstitucionalPUBhttp://repositorio.ipen.br/oai/requestbibl@ipen.bropendoar:45102020-03-23T20:13:54Repositório Institucional do IPEN - Instituto de Pesquisas Energéticas e Nucleares (IPEN)false |
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