Transcriptômica e metatranscriptômica

• Autor(a) principal: Oliveira, Louisi
• Data de Publicação: 2020
• Outros Autores: Calegario, Gabriela, Cavalcanti, Giselle, Froés, Adriana
• Tipo de documento: Capítulo de livro
• Idioma: por
• Título da fonte: Repositório Institucional da Produção Científica da Marinha do Brasil (RI-MB)
• Texto Completo: https://www.repositorio.mar.mil.br/handle/ripcmb/845421
• topic: Ciência, Tecnologia e Inovação; Biotecnologia Marinha; Ciência, Tecnologia e Inovação

A transcriptômica e a metatranscriptômica adotam uma visão holística do perfil de expressão gênica de uma célula, tecido, organismo ou comunidade. Essas técnicas analíticas objetivam: (I) catalogar todos os possíveis tipos de transcritos, incluindo mRNAs, RNAs não codificantes e pequenos RNAs; (II) determinar a estrutura transcricional de genes; (III) quantificar alterações nos níveis de expressão dos transcritos durante o desenvolvimento e/ou em resposta a diferen-tes condições de estudo. Os transcriptomas fornecem informações essenciais sobre quando e quais genes estão sendo expressos em vários tipos de células e tecidos. No âmbito da biotecnologia marinha, o acesso a informações de transcriptomas possibilita conhecer genes de resistência a antibióticos ou defensivos agrícolas, bem como genes relacionados à síntese de metabólitos especializados com aplicações farmacológicas ou industriais. Ademais, o sequenciamento do metatranscriptoma em comunidades marinhas complexas possibilita conhecer o perfil genético de microorganismos não cultiváveis, a composição taxonômica e a função desempenhada pelo microbioma ativo em um determinado ambiente. A metatranscriptômica tem revelado uma diversidade inexplorada de genes e rotas metabólicas com grande potencial biotecnológico, especialmente para as áreas de bioenergia e farmacologia. Neste capítulo, exploraremos ainda as estratégias de análise da expressão gênica. Atualmente, o RNA-seq (sequenciamento de RNA) é a abordagem mais utilizada para o estudo da transcriptômica e/ou metatranscriptômica. Para o acesso a esse mundo de informações geradas pelo sequenciamento de alta performance, dispõe-se de ferramentas de bioinformática que vêm sendo desenvolvidas e atualizadas, de modo a superar o desafio da análise de grandes quantidades de dados.