O alelo Trp3 do SNP rs61734651 do gene COL9A3 aumenta o risco relativo para a Hérnia de Disco Lombar em indivíduos de uma amostra populacional de Goiânia (Brasil)
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Data de Publicação: | 2018 |
Tipo de documento: | Dissertação |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da PUC_GOAIS (TEDE-PUC Goiás) |
Texto Completo: | http://tede2.pucgoias.edu.br:8080/handle/tede/4119 |
Resumo: | As dores nas costas estão presentes em 80% da população mundial, e um dos motivos mais comuns dessas dores são as hérnias de disco, sendo que elas podem ocorrer em qualquer parte da coluna vertebral, atingindo principalmente a região lombar. As Hérnias de Disco Lombar (HDL) podem surgir decorrentes de fatores ambientais como tabagismo, estilo de vida envelhecimento, ocupação, ou ainda por fatores genéticos. No Brasil existem poucos os estudos que relacionem as influências genéticas com o surgimento da HDL, não existindo ainda estudos que utilizem os SNPs para investigar o surgimento da enfermidade. Nosso estudo do tipo caso controle, teve como objetivo avaliar a associação entre a variação dos polimorfismos rs2294984 e rs61734651 do gene COL9A3 com a hérnia de disco lombar. Participaram da pesquisa 118 indivíduos residentes em Goiânia (Brasil), os participantes foram divididos em dois grupos, onde 40 indivíduos formaram o grupo caso e 78 o grupo controle. Foram coletados 4mL de sangue periférico com o anticoagulante EDTA. O procedimento de extração foi realizado utilizando o kit comercial seguindo as normas do fabricante, em seguida o DNA foi armazenado em freezer -20°C aguardando o procedimento de qPCR. Para a amplificação dos sítios polimórficos rs2294984 e rs61734651 do gene COL9A3 utilizamos 5ng de DNA genômico, 2,5μL de TaqMan® Universal Master Mix(R) concentrado a 2X e 0,25μL de sonda e primers concentrado a 20X. Após a realização dos testes estatísticos observou-se que não houve diferença significativa no estilo de vida, dados sociodemográficos e antropométricos. Os integrantes do grupo caso teve média de idade de 42,2 anos, sendo 17 mulheres e 23 homens, já o grupo controle teve média de idade de 42,6 anos, sendo 34 mulheres e 44 homens. Quando relacionamos a frequência alélica e genotípica do SNP rs2294984 entre o grupo caso e controle observamos que não houve diferenças estatísticas significativas. No entanto o SNP rs61734651 mostrou uma redução de cerca de 3x (2,8) na frequência do alelo C entre os casos, quando comparado ao grupo controle, foi observado um desvio entre os grupos para a distribuição alélica e para os genótipos C/T e T/T sendo estatisticamente significativo (p< 0,05), a presença do alelo T corresponde à troca de uma arginina por um triptofano no códon 103 da cadeia α3 (Trp3) da proteína colágeno IX, codificada pelo gene COL9A3. Portanto, nossos resultados demonstraram que a presença do alelo T do SNP rs61734651 em homozigose está envolvido com o desenvolvimento de HDL. Os indivíduos que possuíam o alelo Trp3 em seus genótipos apresentou uma chance aumentada de 11% de desenvolver a HDL, quando comparado com um grupo de pessoas saudáveis do estuado de Goiás. São necessárias outras pesquisas para investigar a potencial relação do alelo Trp3 com o desenvolvimento da HDL. |
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O alelo Trp3 do SNP rs61734651 do gene COL9A3 aumenta o risco relativo para a Hérnia de Disco Lombar em indivíduos de uma amostra populacional de Goiânia (Brasil)Polimorfismo. Lombalgias. HDL. SNP. qPCRPolymorphism. Lombalgias. HDL. SNP. qPCRCIENCIAS BIOLOGICAS::GENETICAAs dores nas costas estão presentes em 80% da população mundial, e um dos motivos mais comuns dessas dores são as hérnias de disco, sendo que elas podem ocorrer em qualquer parte da coluna vertebral, atingindo principalmente a região lombar. As Hérnias de Disco Lombar (HDL) podem surgir decorrentes de fatores ambientais como tabagismo, estilo de vida envelhecimento, ocupação, ou ainda por fatores genéticos. No Brasil existem poucos os estudos que relacionem as influências genéticas com o surgimento da HDL, não existindo ainda estudos que utilizem os SNPs para investigar o surgimento da enfermidade. Nosso estudo do tipo caso controle, teve como objetivo avaliar a associação entre a variação dos polimorfismos rs2294984 e rs61734651 do gene COL9A3 com a hérnia de disco lombar. Participaram da pesquisa 118 indivíduos residentes em Goiânia (Brasil), os participantes foram divididos em dois grupos, onde 40 indivíduos formaram o grupo caso e 78 o grupo controle. Foram coletados 4mL de sangue periférico com o anticoagulante EDTA. O procedimento de extração foi realizado utilizando o kit comercial seguindo as normas do fabricante, em seguida o DNA foi armazenado em freezer -20°C aguardando o procedimento de qPCR. Para a amplificação dos sítios polimórficos rs2294984 e rs61734651 do gene COL9A3 utilizamos 5ng de DNA genômico, 2,5μL de TaqMan® Universal Master Mix(R) concentrado a 2X e 0,25μL de sonda e primers concentrado a 20X. Após a realização dos testes estatísticos observou-se que não houve diferença significativa no estilo de vida, dados sociodemográficos e antropométricos. Os integrantes do grupo caso teve média de idade de 42,2 anos, sendo 17 mulheres e 23 homens, já o grupo controle teve média de idade de 42,6 anos, sendo 34 mulheres e 44 homens. Quando relacionamos a frequência alélica e genotípica do SNP rs2294984 entre o grupo caso e controle observamos que não houve diferenças estatísticas significativas. No entanto o SNP rs61734651 mostrou uma redução de cerca de 3x (2,8) na frequência do alelo C entre os casos, quando comparado ao grupo controle, foi observado um desvio entre os grupos para a distribuição alélica e para os genótipos C/T e T/T sendo estatisticamente significativo (p< 0,05), a presença do alelo T corresponde à troca de uma arginina por um triptofano no códon 103 da cadeia α3 (Trp3) da proteína colágeno IX, codificada pelo gene COL9A3. Portanto, nossos resultados demonstraram que a presença do alelo T do SNP rs61734651 em homozigose está envolvido com o desenvolvimento de HDL. Os indivíduos que possuíam o alelo Trp3 em seus genótipos apresentou uma chance aumentada de 11% de desenvolver a HDL, quando comparado com um grupo de pessoas saudáveis do estuado de Goiás. São necessárias outras pesquisas para investigar a potencial relação do alelo Trp3 com o desenvolvimento da HDL.About 80% of the world population suffer from back pain. The most common causes of this pain are spinal disc herniation, which could happen anywhere along the spine, but it is most frequent at the lumbar region, known as Herniated Lumbar Disc (HLD). They could be produced as consequence of environmental factors, such as chronic smoking, life style, aging, occupation. Genetic factors also contribute to the development of HLD. In Brazil, a very few studies have addressed the genetic influence on HLD occurrence, and no reports of the roll of SNPs in the susceptibility of this disease have been published for a Brazilian population. The current study investigated the potential association between polymorphic variants in rs2294984 and rs61734651 from the COL9A3 gene and HDL. The study included 118 residents from Goiânia-GO (Brazil) divided in two groups. A total of 40 people comprised the group of cases and 78 comprised the control group. From each participant, 4mL of peripheral blood was collected in EDTA. DNA was isolated from biological samples using the commercial kit IlustraBloodGenomicPrepMini Spin® (GE Healthcare, UK), following the manufacturer’s instructions. Isolated DNA was stored at -20oC. The SNPs were genotyped using TaqMan Real Time PCR® (SNP Genotyping kit, da AppliedBiosystems, EUA). Data was annotated in spreadsheets for the statistical analyses. Among cases, there were 17 women and 23 men whose average age was 42.2 years old. For controls, a total of 34 women and 44 men contributed to an average age of 42.6 years old. For SNP s2294984, no statistical defences were observed for either allelic and genotypic frequencies between cases and controls. However, for SNP rs61734651, a significant reduction (about 3x) in the frequency of the C allele was detected among cases. This reduction skewed the distribution of both allelic and genotypic frequencies from CC to CT and TT. The difference between cases and controls was statistically significant (p< 0,05) and the substitution of C for T caused the replacement of the aminoacid arginine by tryptophan in the codon 103 of the α3 chain (Trp3) of collagen IX. The results of the current study indicated the genotype TT was associated with HDL development in adults from central Brazil. The allele Trp3 increased 11% the chance of HDL among cases, when compare to controls. Thus, this study pointed out the need to further investigate the contribution of individual genetic makeup on the development of adult onset HDL.Pontifícia Universidade Católica de GoiásEscola de Ciências Agrárias e Biológicas::Curso de Biologia BachareladoBrasilPUC GoiásPrograma de Pós-Graduação STRICTO SENSU em GenéticaCruz, Aparecido Divino dahttp://lattes.cnpq.br/7868817504129985Teodoro, Lilian de Souza2019-02-19T12:19:18Z2018-03-15info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfTeodoro, Lilian de Souza. O alelo Trp3 do SNP rs61734651 do gene COL9A3 aumenta o risco relativo para a Hérnia de Disco Lombar em indivíduos de uma amostra populacional de Goiânia (Brasil). 2018. 55 fls. Dissertação (Programa de Pós-Graduação STRICTO SENSU em Genética) - Pontifícia Universidade Católica de Goiás, Goiânia-GO.http://tede2.pucgoias.edu.br:8080/handle/tede/4119porinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da PUC_GOAIS (TEDE-PUC Goiás)instname:Pontifícia Universidade Católica de Goiás (PUC-GO)instacron:PUC_GO2019-02-20T04:00:21Zoai:ambar:tede/4119Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://tede2.pucgoias.edu.br:8080/http://tede2.pucgoias.edu.br:8080/oai/requesttede@pucgoias.edu.br||tede@pucgoias.edu.bropendoar:65932019-02-20T04:00:21Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da PUC_GOAIS (TEDE-PUC Goiás) - Pontifícia Universidade Católica de Goiás (PUC-GO)false |
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