Sistemática filogenética dos bagres Auchenipteridae (Ostariophysi: Siluriformes) : uma abordagem combinando dados morfológicos e moleculares.
Autor(a) principal: | |
---|---|
Data de Publicação: | 2015 |
Tipo de documento: | Tese |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da PUC_RS |
Texto Completo: | http://tede2.pucrs.br/tede2/handle/tede/6497 |
Resumo: | The Auchenipteridae have an extensive and confusing taxonomic and phylogenetic history. Several studies developed since 1766 involving descriptions of species generated controversial results about the composition of the family and their interrelationships. The weakness of the systematic knowledge and diversity of the family hinders the understanding about the evolutionary history since the informative potential of morphology, molecules and biogeography was not yet fully explored. A comprehensive and densely sampled phylogenetic study of the species relationships of the Auchenipteridae, a Neotropical family of inseminating catfishes, is here documented based on combined datasets, morphological and molecular. The present study aimed to include most species of Auchenipteridae (109 species), as well as several members of other siluriform families representing the outgroup (28 species comprising Mochokidae, Aspredinidae, Doradidae, Ariidae, Pimelodidae, Cetopsidae, and Diplomystidae) to embrace the greater diversity of forms existing within Siluriformes, providing a robust comparison between the taxa and providing therefore a series of information from different sources including morphology (261 characters) and molecular data (2814 characters based on four genes: COI, 16S, RAG2, and MyH6). The parsimony analysis based on combined data yielded 1691 maximally parsimonious trees and the strict consensus corroborated the monophyly of the superfamily Doradoidea, the family Auchenipteridae and its two subfamilies, Centromochlinae and Auchenipterinae as well. The new classificatory proposal also raises the number of tribes within Auchenipteridae from two to nine, evidencing the following major groups within Auchenipterinae: Liosomadoradini, Trachelyopterini, Asterophysini, Auchenipterini, and Ageneiosini; and in Centromochlinae: Gelanoglanini, Gephyromochlini, Centromochlini, and Glanidini. Additionally, most of auchenipterid genera were recovered as monophyletic, except for Centromochlus and Tatia. Centromochlus is restricted to only three species while Tatia is recovered as the most specious centromochline genus including the currently Centromochlus simplex, C. reticulatus and Pseudotatia parva, herein reallocated. To address the paraphyly of Centromochlus and Tatia, two new genera of Centromochlinae were proposed and a nomenclatural reorganization of the species in these genera was conducted. Furthermore, Glanidium and Trachycorystes resulted as paraphyletic, and a new combination for Glanidium leopardum, resurrecting Gephyromochlus, to allocate this taxa and a new genus of Auchenipterinae to allocate Trachycorystes menezesi were proposed. Notwithstanding, Ageneiosus was recovered as paraphyletic since Ageneiosus militaris was recovered as sister group to Ageneiosus and Tympanopleura. The paraphyly of Ageneiosus seems to be an artifact of morphological missing data for A. militaris and until these data are included in the analysis to readily test the position of this species, both genera are maintained as valid. A synapomorphy list and the diagnosis for each clade are presented under a new classification proposal. Furthermore, the interrelationship and monophyly of the genera and major groups are discussed and compared to previous propositions. |
id |
P_RS_3056f3e6ae827957bd04a73fa518f81b |
---|---|
oai_identifier_str |
oai:tede2.pucrs.br:tede/6497 |
network_acronym_str |
P_RS |
network_name_str |
Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da PUC_RS |
repository_id_str |
|
spelling |
Reis, Roberto Esser dos394.331.290-91http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4788604Y3010.126.640-58http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4138169J1Calegari, Bárbara Borges2016-02-12T10:25:45Z2015-08-27http://tede2.pucrs.br/tede2/handle/tede/6497The Auchenipteridae have an extensive and confusing taxonomic and phylogenetic history. Several studies developed since 1766 involving descriptions of species generated controversial results about the composition of the family and their interrelationships. The weakness of the systematic knowledge and diversity of the family hinders the understanding about the evolutionary history since the informative potential of morphology, molecules and biogeography was not yet fully explored. A comprehensive and densely sampled phylogenetic study of the species relationships of the Auchenipteridae, a Neotropical family of inseminating catfishes, is here documented based on combined datasets, morphological and molecular. The present study aimed to include most species of Auchenipteridae (109 species), as well as several members of other siluriform families representing the outgroup (28 species comprising Mochokidae, Aspredinidae, Doradidae, Ariidae, Pimelodidae, Cetopsidae, and Diplomystidae) to embrace the greater diversity of forms existing within Siluriformes, providing a robust comparison between the taxa and providing therefore a series of information from different sources including morphology (261 characters) and molecular data (2814 characters based on four genes: COI, 16S, RAG2, and MyH6). The parsimony analysis based on combined data yielded 1691 maximally parsimonious trees and the strict consensus corroborated the monophyly of the superfamily Doradoidea, the family Auchenipteridae and its two subfamilies, Centromochlinae and Auchenipterinae as well. The new classificatory proposal also raises the number of tribes within Auchenipteridae from two to nine, evidencing the following major groups within Auchenipterinae: Liosomadoradini, Trachelyopterini, Asterophysini, Auchenipterini, and Ageneiosini; and in Centromochlinae: Gelanoglanini, Gephyromochlini, Centromochlini, and Glanidini. Additionally, most of auchenipterid genera were recovered as monophyletic, except for Centromochlus and Tatia. Centromochlus is restricted to only three species while Tatia is recovered as the most specious centromochline genus including the currently Centromochlus simplex, C. reticulatus and Pseudotatia parva, herein reallocated. To address the paraphyly of Centromochlus and Tatia, two new genera of Centromochlinae were proposed and a nomenclatural reorganization of the species in these genera was conducted. Furthermore, Glanidium and Trachycorystes resulted as paraphyletic, and a new combination for Glanidium leopardum, resurrecting Gephyromochlus, to allocate this taxa and a new genus of Auchenipterinae to allocate Trachycorystes menezesi were proposed. Notwithstanding, Ageneiosus was recovered as paraphyletic since Ageneiosus militaris was recovered as sister group to Ageneiosus and Tympanopleura. The paraphyly of Ageneiosus seems to be an artifact of morphological missing data for A. militaris and until these data are included in the analysis to readily test the position of this species, both genera are maintained as valid. A synapomorphy list and the diagnosis for each clade are presented under a new classification proposal. Furthermore, the interrelationship and monophyly of the genera and major groups are discussed and compared to previous propositions.Auchenipteridae possui uma extensa e confusa história taxonômica e filogenética. Diversos estudos desenvolvidos desde 1766 envolvendo descrições de espécies geraram resultados controversos a cerca da composição da família e suas relações de parentesco. A deficiência no conhecimento da sistemática e diversidade da família tem dificultado a compreensão sobre a história evolutiva, uma vez que o potencial informativo morfológico, molecular, e biogeográfico ainda não foi totalmente explorado. Um estudo filogenético compreensivo e densamente amostrado das relações de parentesco das espécies de Auchenipteridae, uma família de bagres Neotropical inseminadores, é aqui documentado através de um conjunto de dados combinados, morfológicos e moleculares. O presente estudo objetivou incluir a maioria das espécies de Auchenipteridae (109 espécies), bem como diversos membros de outras famílias de Siluriformes representando o grupo externo (28 espécies de Mochokidae, Aspredinidae, Doradidae, Ariidae, Pimelodidae, Cetopsidae, e Diplomystidae) para contemplar a grande diversidade de formas existente dentro de Siluriformes, fornecendo uma robusta comparação entre os táxons além de uma série de informações de diferentes fontes incluindo dados morfológicos (261 caracteres) e moleculares (2814 caracteres de quatro genes: COI, 16S, RAG2 e MYh6). A análise de parcimônia baseada em dados combinados produziu 1691 árvores maximamente parcimoniosas e o consenso estrito corroborou a monofilia da superfamília Doradoidea e de Auchenipteridae e, também, de suas duas subfamílias Centromochlinae e Auchenipterinae. A nova proposta de classificação aumenta o número de tribos em Auchenipteridae, de duas para nove, evidenciando os seguintes grandes grupos dentro de Auchenipterinae: Liosomadoradini, Trachelyopterini, Asterophysini, Auchenipterini, and Ageneiosini; e quatro novas tribos em Centromochlinae: Gelanoglanini, Gephyromochlini, Centromochlini, e Glanidini. Adicionalmente, a maioria dos gêneros de auchenipterídeos foi recuperada como monofilética, exceto por Centromochlus e Tatia. Centromochlus é restringido a somente três espécies, enquanto que Tatia é recuperado como gênero mais diverso incluindo as atuais espécies Centromochlus simplex, C. reticulatus e Pseudotatia parva, aqui realocadas. Para resolver a parafilia de Centromochlus e Tatia, dois novos gêneros de Centromochlinae são propostos e uma reorganização nomenclatural destes gêneros é feita. Adicionalmente, Glanidium e Trachycorystes resultaram como parafiléticos, e uma nova combinação é proposta para Glanidium leopardum, revalidando Gephyromochlus para alocar este táxon e também um novo gênero de Auchenipterinae para alocar Trachycorystes menezesi. Não obstante, Ageneiosus foi recuperado como parafilético, uma vez que A. militaris foi recuperado como grupo irmão do clado Ageneiosus e Tympanopleura. A parafilia de Ageneiosus parece ser um artefato de dados morfológicos faltantes para A. militaris e até os mesmos serem incluídos na análise para realmente testar a posição desta espécie, os dois gêneros são mantidos como válidos. Uma lista de sinapomorfias e as diagnoses dos clados são apresentadas sob uma nova proposta de classificação. Ainda, as relações de parentesco e a monofilia dos gêneros e grandes grupos são discutidas e comparadas à proposições prévias.Submitted by Setor de Tratamento da Informação - BC/PUCRS (tede2@pucrs.br) on 2016-02-12T10:25:45Z No. of bitstreams: 1 TES_BARBARA_BORGES_CALEGARI_PARCIAL.pdf: 201037 bytes, checksum: 842e14f9326d662b1b590ec126cc0e5f (MD5)Made available in DSpace on 2016-02-12T10:25:45Z (GMT). No. of bitstreams: 1 TES_BARBARA_BORGES_CALEGARI_PARCIAL.pdf: 201037 bytes, checksum: 842e14f9326d662b1b590ec126cc0e5f (MD5) Previous issue date: 2015-08-27Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPqCoordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPESapplication/pdfhttp://tede2.pucrs.br:80/tede2/retrieve/164105/TES_BARBARA_BORGES_CALEGARI_PARCIAL.pdf.jpgporPontifícia Universidade Católica do Rio Grande do SulPrograma de Pós-Graduação em ZoologiaPUCRSBrasilFaculdade de BiociênciasBIOLOGIAZOOLOGIAICTIOLOGIAEVOLUÇÃOANATOMIA ANIMALTELEÓSTEOSCIENCIAS BIOLOGICAS::ZOOLOGIASistemática filogenética dos bagres Auchenipteridae (Ostariophysi: Siluriformes) : uma abordagem combinando dados morfológicos e moleculares.info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesis200892523190274115160060060060060036528317262667714-6482652380601267558-25559114369857136592075167498588264571info:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da PUC_RSinstname:Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul (PUCRS)instacron:PUC_RSTHUMBNAILTES_BARBARA_BORGES_CALEGARI_PARCIAL.pdf.jpgTES_BARBARA_BORGES_CALEGARI_PARCIAL.pdf.jpgimage/jpeg2829http://tede2.pucrs.br/tede2/bitstream/tede/6497/4/TES_BARBARA_BORGES_CALEGARI_PARCIAL.pdf.jpgbaac0a30a7b044a457eaf73b971f3fcbMD54TEXTTES_BARBARA_BORGES_CALEGARI_PARCIAL.pdf.txtTES_BARBARA_BORGES_CALEGARI_PARCIAL.pdf.txttext/plain20306http://tede2.pucrs.br/tede2/bitstream/tede/6497/3/TES_BARBARA_BORGES_CALEGARI_PARCIAL.pdf.txtdf405cf73e4e3dcd4c4a58f146cdf6c4MD53ORIGINALTES_BARBARA_BORGES_CALEGARI_PARCIAL.pdfTES_BARBARA_BORGES_CALEGARI_PARCIAL.pdfapplication/pdf201037http://tede2.pucrs.br/tede2/bitstream/tede/6497/2/TES_BARBARA_BORGES_CALEGARI_PARCIAL.pdf842e14f9326d662b1b590ec126cc0e5fMD52LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-8610http://tede2.pucrs.br/tede2/bitstream/tede/6497/1/license.txt5a9d6006225b368ef605ba16b4f6d1beMD51tede/64972016-02-12 12:00:50.474oai:tede2.pucrs.br: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Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://tede2.pucrs.br/tede2/PRIhttps://tede2.pucrs.br/oai/requestbiblioteca.central@pucrs.br||opendoar:2016-02-12T14:00:50Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da PUC_RS - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul (PUCRS)false |
dc.title.por.fl_str_mv |
Sistemática filogenética dos bagres Auchenipteridae (Ostariophysi: Siluriformes) : uma abordagem combinando dados morfológicos e moleculares. |
title |
Sistemática filogenética dos bagres Auchenipteridae (Ostariophysi: Siluriformes) : uma abordagem combinando dados morfológicos e moleculares. |
spellingShingle |
Sistemática filogenética dos bagres Auchenipteridae (Ostariophysi: Siluriformes) : uma abordagem combinando dados morfológicos e moleculares. Calegari, Bárbara Borges BIOLOGIA ZOOLOGIA ICTIOLOGIA EVOLUÇÃO ANATOMIA ANIMAL TELEÓSTEOS CIENCIAS BIOLOGICAS::ZOOLOGIA |
title_short |
Sistemática filogenética dos bagres Auchenipteridae (Ostariophysi: Siluriformes) : uma abordagem combinando dados morfológicos e moleculares. |
title_full |
Sistemática filogenética dos bagres Auchenipteridae (Ostariophysi: Siluriformes) : uma abordagem combinando dados morfológicos e moleculares. |
title_fullStr |
Sistemática filogenética dos bagres Auchenipteridae (Ostariophysi: Siluriformes) : uma abordagem combinando dados morfológicos e moleculares. |
title_full_unstemmed |
Sistemática filogenética dos bagres Auchenipteridae (Ostariophysi: Siluriformes) : uma abordagem combinando dados morfológicos e moleculares. |
title_sort |
Sistemática filogenética dos bagres Auchenipteridae (Ostariophysi: Siluriformes) : uma abordagem combinando dados morfológicos e moleculares. |
author |
Calegari, Bárbara Borges |
author_facet |
Calegari, Bárbara Borges |
author_role |
author |
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv |
Reis, Roberto Esser dos |
dc.contributor.advisor1ID.fl_str_mv |
394.331.290-91 |
dc.contributor.advisor1Lattes.fl_str_mv |
http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4788604Y3 |
dc.contributor.authorID.fl_str_mv |
010.126.640-58 |
dc.contributor.authorLattes.fl_str_mv |
http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4138169J1 |
dc.contributor.author.fl_str_mv |
Calegari, Bárbara Borges |
contributor_str_mv |
Reis, Roberto Esser dos |
dc.subject.por.fl_str_mv |
BIOLOGIA ZOOLOGIA ICTIOLOGIA EVOLUÇÃO ANATOMIA ANIMAL TELEÓSTEOS |
topic |
BIOLOGIA ZOOLOGIA ICTIOLOGIA EVOLUÇÃO ANATOMIA ANIMAL TELEÓSTEOS CIENCIAS BIOLOGICAS::ZOOLOGIA |
dc.subject.cnpq.fl_str_mv |
CIENCIAS BIOLOGICAS::ZOOLOGIA |
description |
The Auchenipteridae have an extensive and confusing taxonomic and phylogenetic history. Several studies developed since 1766 involving descriptions of species generated controversial results about the composition of the family and their interrelationships. The weakness of the systematic knowledge and diversity of the family hinders the understanding about the evolutionary history since the informative potential of morphology, molecules and biogeography was not yet fully explored. A comprehensive and densely sampled phylogenetic study of the species relationships of the Auchenipteridae, a Neotropical family of inseminating catfishes, is here documented based on combined datasets, morphological and molecular. The present study aimed to include most species of Auchenipteridae (109 species), as well as several members of other siluriform families representing the outgroup (28 species comprising Mochokidae, Aspredinidae, Doradidae, Ariidae, Pimelodidae, Cetopsidae, and Diplomystidae) to embrace the greater diversity of forms existing within Siluriformes, providing a robust comparison between the taxa and providing therefore a series of information from different sources including morphology (261 characters) and molecular data (2814 characters based on four genes: COI, 16S, RAG2, and MyH6). The parsimony analysis based on combined data yielded 1691 maximally parsimonious trees and the strict consensus corroborated the monophyly of the superfamily Doradoidea, the family Auchenipteridae and its two subfamilies, Centromochlinae and Auchenipterinae as well. The new classificatory proposal also raises the number of tribes within Auchenipteridae from two to nine, evidencing the following major groups within Auchenipterinae: Liosomadoradini, Trachelyopterini, Asterophysini, Auchenipterini, and Ageneiosini; and in Centromochlinae: Gelanoglanini, Gephyromochlini, Centromochlini, and Glanidini. Additionally, most of auchenipterid genera were recovered as monophyletic, except for Centromochlus and Tatia. Centromochlus is restricted to only three species while Tatia is recovered as the most specious centromochline genus including the currently Centromochlus simplex, C. reticulatus and Pseudotatia parva, herein reallocated. To address the paraphyly of Centromochlus and Tatia, two new genera of Centromochlinae were proposed and a nomenclatural reorganization of the species in these genera was conducted. Furthermore, Glanidium and Trachycorystes resulted as paraphyletic, and a new combination for Glanidium leopardum, resurrecting Gephyromochlus, to allocate this taxa and a new genus of Auchenipterinae to allocate Trachycorystes menezesi were proposed. Notwithstanding, Ageneiosus was recovered as paraphyletic since Ageneiosus militaris was recovered as sister group to Ageneiosus and Tympanopleura. The paraphyly of Ageneiosus seems to be an artifact of morphological missing data for A. militaris and until these data are included in the analysis to readily test the position of this species, both genera are maintained as valid. A synapomorphy list and the diagnosis for each clade are presented under a new classification proposal. Furthermore, the interrelationship and monophyly of the genera and major groups are discussed and compared to previous propositions. |
publishDate |
2015 |
dc.date.issued.fl_str_mv |
2015-08-27 |
dc.date.accessioned.fl_str_mv |
2016-02-12T10:25:45Z |
dc.type.status.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/publishedVersion |
dc.type.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/doctoralThesis |
format |
doctoralThesis |
status_str |
publishedVersion |
dc.identifier.uri.fl_str_mv |
http://tede2.pucrs.br/tede2/handle/tede/6497 |
url |
http://tede2.pucrs.br/tede2/handle/tede/6497 |
dc.language.iso.fl_str_mv |
por |
language |
por |
dc.relation.program.fl_str_mv |
2008925231902741151 |
dc.relation.confidence.fl_str_mv |
600 600 600 600 600 |
dc.relation.department.fl_str_mv |
36528317262667714 |
dc.relation.cnpq.fl_str_mv |
-6482652380601267558 |
dc.relation.sponsorship.fl_str_mv |
-2555911436985713659 2075167498588264571 |
dc.rights.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/openAccess |
eu_rights_str_mv |
openAccess |
dc.format.none.fl_str_mv |
application/pdf |
dc.publisher.none.fl_str_mv |
Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul |
dc.publisher.program.fl_str_mv |
Programa de Pós-Graduação em Zoologia |
dc.publisher.initials.fl_str_mv |
PUCRS |
dc.publisher.country.fl_str_mv |
Brasil |
dc.publisher.department.fl_str_mv |
Faculdade de Biociências |
publisher.none.fl_str_mv |
Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul |
dc.source.none.fl_str_mv |
reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da PUC_RS instname:Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul (PUCRS) instacron:PUC_RS |
instname_str |
Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul (PUCRS) |
instacron_str |
PUC_RS |
institution |
PUC_RS |
reponame_str |
Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da PUC_RS |
collection |
Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da PUC_RS |
bitstream.url.fl_str_mv |
http://tede2.pucrs.br/tede2/bitstream/tede/6497/4/TES_BARBARA_BORGES_CALEGARI_PARCIAL.pdf.jpg http://tede2.pucrs.br/tede2/bitstream/tede/6497/3/TES_BARBARA_BORGES_CALEGARI_PARCIAL.pdf.txt http://tede2.pucrs.br/tede2/bitstream/tede/6497/2/TES_BARBARA_BORGES_CALEGARI_PARCIAL.pdf http://tede2.pucrs.br/tede2/bitstream/tede/6497/1/license.txt |
bitstream.checksum.fl_str_mv |
baac0a30a7b044a457eaf73b971f3fcb df405cf73e4e3dcd4c4a58f146cdf6c4 842e14f9326d662b1b590ec126cc0e5f 5a9d6006225b368ef605ba16b4f6d1be |
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv |
MD5 MD5 MD5 MD5 |
repository.name.fl_str_mv |
Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da PUC_RS - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul (PUCRS) |
repository.mail.fl_str_mv |
biblioteca.central@pucrs.br|| |
_version_ |
1799765317042307072 |