Identificação genética e estudos populacionais utilizando microssatélites (STR) em equinos, bovinos e caninos domésticos provenientes do Uruguai, Paraguai e Brasil

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Gastaldo, André Zoratto
Data de Publicação: 2017
Tipo de documento: Tese
Idioma: por
Título da fonte: Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da PUC_RS
Texto Completo: http://tede2.pucrs.br/tede2/handle/tede/7534
Resumo: The evolution in human identification through the study of genetic markers STR (Short Tandem Repeats) induced and propitiated the growth also of animal genetic identification. However, contrary to what occurs in the human domain, animal molecular identification still lacks validation of analysis systems and population studies to be considered reliable to the degree required. Only recently the International Society for Animal Genetics (ISAG) has recommended STR markers suitable for individual discrimination in domestic animal species. Accurate animal genetic identification is sought to provide entities, associations, breeders and owners in general with assurances that their animals are in fact derived from reliable breeders. Only reliable and authentic genealogical records will ensure, for example, efficiency in genetic breeding processes. Even though it is a promising area, there are currently only two options in the market for commercial kits for animal genotyping. But its use has been deferred by specialized laboratories in the field, which end up preparing their own identification panels, using the recommended genetic markers to meet their local demands more specifically. However, if the frequencies of the alleles present in these genetic markers in the study population are not known and the real power of discrimination that they provide is not estimated, the analyzes performed and the results obtained may generate misleading or imprecise interpretations. In the present study, three panels of STR genetic markers were used with all loci recommended by ISAG, capable of identifying equine, bovine and canine individuals. Allelic frequencies and other parameters such as heterozygosity, polymorphism information content, power of exclusion and power of discrimination were obtained from significant samples in breeds present in Rio Grande do Sul (Southern Brazil), Uruguay and Paraguay, to be used in the practice of animal genetics for identification purposes. In addition, comparative population studies within and among breeds were also carried out, in order to evaluate the genetic diversity of the animal populations studied.
id P_RS_3bc81a3aac1fe900f822e2cf02af4be2
oai_identifier_str oai:tede2.pucrs.br:tede/7534
network_acronym_str P_RS
network_name_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da PUC_RS
repository_id_str
spelling Alho, Clarice Sampaio509.556.750-49http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4782703D1975.079.460-53http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4751956Y0Gastaldo, André Zoratto2017-06-30T18:31:34Z2017-03-21http://tede2.pucrs.br/tede2/handle/tede/7534The evolution in human identification through the study of genetic markers STR (Short Tandem Repeats) induced and propitiated the growth also of animal genetic identification. However, contrary to what occurs in the human domain, animal molecular identification still lacks validation of analysis systems and population studies to be considered reliable to the degree required. Only recently the International Society for Animal Genetics (ISAG) has recommended STR markers suitable for individual discrimination in domestic animal species. Accurate animal genetic identification is sought to provide entities, associations, breeders and owners in general with assurances that their animals are in fact derived from reliable breeders. Only reliable and authentic genealogical records will ensure, for example, efficiency in genetic breeding processes. Even though it is a promising area, there are currently only two options in the market for commercial kits for animal genotyping. But its use has been deferred by specialized laboratories in the field, which end up preparing their own identification panels, using the recommended genetic markers to meet their local demands more specifically. However, if the frequencies of the alleles present in these genetic markers in the study population are not known and the real power of discrimination that they provide is not estimated, the analyzes performed and the results obtained may generate misleading or imprecise interpretations. In the present study, three panels of STR genetic markers were used with all loci recommended by ISAG, capable of identifying equine, bovine and canine individuals. Allelic frequencies and other parameters such as heterozygosity, polymorphism information content, power of exclusion and power of discrimination were obtained from significant samples in breeds present in Rio Grande do Sul (Southern Brazil), Uruguay and Paraguay, to be used in the practice of animal genetics for identification purposes. In addition, comparative population studies within and among breeds were also carried out, in order to evaluate the genetic diversity of the animal populations studied.O avanço da identificação molecular humana pelo estudo dos marcadores genéticos STR (Short Tandem Repeats) induziu e propiciou o crescimento também da identificação genética animal. Contudo, ao contrário da área humana, a identificação molecular animal ainda carece de validações dos sistemas de análise e de estudos populacionais para que seja considerada fidedigna no grau que se necessita. Apenas recentemente a ISAG (International Society for Animal Genetics) recomendou marcadores STR adequados para discriminação individual em espécies de animais domésticos. A identificação genética animal exata e precisa é buscada para fornecer, a entidades, associações, criadores e proprietários em geral, garantias de que seus animais são, de fato, oriundos de reprodutores confiáveis. Apenas registros genealógicos fidedignos e autênticos garantirão, por exemplo, eficiência nos processos de melhoramento genético. Mesmo sendo uma área promissora, neste momento há somente duas opções no mercado de kits comerciais para genotipagem animal. Mas seu uso tem sido preterido por laboratórios do ramo, os quais acabam preparando seus próprios painéis (in house) de identificação, utilizando os marcadores genéticos recomendados para atender suas demandas locais de forma customizada. Contudo, se não forem conhecidas as frequências dos alelos presentes nestes marcadores genéticos na população em estudo e não for estimado o real poder de discriminação que estes fornecem, as análises realizadas e os resultados obtidos poderão gerar interpretações equivocadas ou imprecisas. No presente trabalho, foram utilizados três painéis de marcadores genéticos STR com todos os loci recomendados pela ISAG, capazes de identificar indivíduos equinos, bovinos e caninos. Frequências alélicas e outros parâmetros como heterozigosidade, conteúdo de informação de polimorfismo, poder de exclusão e de discriminação foram obtidos a partir de amostras significativas em raças presentes no Rio Grande do Sul/Brasil, no Uruguai e no Paraguai, para que sejam usados na prática da genética animal com fins de identificação. Além disso, estudos populacionais comparativos dentro e entre raças também foram realizados, com o intuito de avaliar a diversidade genética das populações animais estudadas.Submitted by Caroline Xavier (caroline.xavier@pucrs.br) on 2017-06-30T18:31:20Z No. of bitstreams: 1 TES_ANDRE_ZORATTO_GASTALDO_COMPLETO.pdf: 1361129 bytes, checksum: dbc7c8c4f5ab004118129ecf678044b8 (MD5)Approved for entry into archive by Caroline Xavier (caroline.xavier@pucrs.br) on 2017-06-30T18:31:27Z (GMT) No. of bitstreams: 1 TES_ANDRE_ZORATTO_GASTALDO_COMPLETO.pdf: 1361129 bytes, checksum: dbc7c8c4f5ab004118129ecf678044b8 (MD5)Made available in DSpace on 2017-06-30T18:31:34Z (GMT). No. of bitstreams: 1 TES_ANDRE_ZORATTO_GASTALDO_COMPLETO.pdf: 1361129 bytes, checksum: dbc7c8c4f5ab004118129ecf678044b8 (MD5) Previous issue date: 2017-03-21application/pdfhttp://tede2.pucrs.br:80/tede2/retrieve/169229/TES_ANDRE_ZORATTO_GASTALDO_COMPLETO.pdf.jpgporPontifícia Universidade Católica do Rio Grande do SulPrograma de Pós-Graduação em Biologia Celular e MolecularPUCRSBrasilFaculdade de BiociênciasIdentificação Genética AnimalISAGMarcadores STREstudos populacionaisCIENCIAS BIOLOGICAS::BIOLOGIA GERALIdentificação genética e estudos populacionais utilizando microssatélites (STR) em equinos, bovinos e caninos domésticos provenientes do Uruguai, Paraguai e Brasilinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisTrabalho não apresenta restrição para publicação34635943735524660966006006004699616958383316066-1634559385931244697info:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da PUC_RSinstname:Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul (PUCRS)instacron:PUC_RSTHUMBNAILTES_ANDRE_ZORATTO_GASTALDO_COMPLETO.pdf.jpgTES_ANDRE_ZORATTO_GASTALDO_COMPLETO.pdf.jpgimage/jpeg3651http://tede2.pucrs.br/tede2/bitstream/tede/7534/5/TES_ANDRE_ZORATTO_GASTALDO_COMPLETO.pdf.jpgd65ca4d5cdd4b16382c72124d42e04b1MD55TEXTTES_ANDRE_ZORATTO_GASTALDO_COMPLETO.pdf.txtTES_ANDRE_ZORATTO_GASTALDO_COMPLETO.pdf.txttext/plain251979http://tede2.pucrs.br/tede2/bitstream/tede/7534/4/TES_ANDRE_ZORATTO_GASTALDO_COMPLETO.pdf.txt8cb6479eb896d5f913651a4d6e917d6aMD54LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-8610http://tede2.pucrs.br/tede2/bitstream/tede/7534/3/license.txt5a9d6006225b368ef605ba16b4f6d1beMD53ORIGINALTES_ANDRE_ZORATTO_GASTALDO_COMPLETO.pdfTES_ANDRE_ZORATTO_GASTALDO_COMPLETO.pdfapplication/pdf1361129http://tede2.pucrs.br/tede2/bitstream/tede/7534/2/TES_ANDRE_ZORATTO_GASTALDO_COMPLETO.pdfdbc7c8c4f5ab004118129ecf678044b8MD52tede/75342017-06-30 20:01:43.589oai:tede2.pucrs.br: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Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://tede2.pucrs.br/tede2/PRIhttps://tede2.pucrs.br/oai/requestbiblioteca.central@pucrs.br||opendoar:2017-06-30T23:01:43Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da PUC_RS - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul (PUCRS)false
dc.title.por.fl_str_mv Identificação genética e estudos populacionais utilizando microssatélites (STR) em equinos, bovinos e caninos domésticos provenientes do Uruguai, Paraguai e Brasil
title Identificação genética e estudos populacionais utilizando microssatélites (STR) em equinos, bovinos e caninos domésticos provenientes do Uruguai, Paraguai e Brasil
spellingShingle Identificação genética e estudos populacionais utilizando microssatélites (STR) em equinos, bovinos e caninos domésticos provenientes do Uruguai, Paraguai e Brasil
Gastaldo, André Zoratto
Identificação Genética Animal
ISAG
Marcadores STR
Estudos populacionais
CIENCIAS BIOLOGICAS::BIOLOGIA GERAL
title_short Identificação genética e estudos populacionais utilizando microssatélites (STR) em equinos, bovinos e caninos domésticos provenientes do Uruguai, Paraguai e Brasil
title_full Identificação genética e estudos populacionais utilizando microssatélites (STR) em equinos, bovinos e caninos domésticos provenientes do Uruguai, Paraguai e Brasil
title_fullStr Identificação genética e estudos populacionais utilizando microssatélites (STR) em equinos, bovinos e caninos domésticos provenientes do Uruguai, Paraguai e Brasil
title_full_unstemmed Identificação genética e estudos populacionais utilizando microssatélites (STR) em equinos, bovinos e caninos domésticos provenientes do Uruguai, Paraguai e Brasil
title_sort Identificação genética e estudos populacionais utilizando microssatélites (STR) em equinos, bovinos e caninos domésticos provenientes do Uruguai, Paraguai e Brasil
author Gastaldo, André Zoratto
author_facet Gastaldo, André Zoratto
author_role author
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Alho, Clarice Sampaio
dc.contributor.advisor1ID.fl_str_mv 509.556.750-49
dc.contributor.advisor1Lattes.fl_str_mv http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4782703D1
dc.contributor.authorID.fl_str_mv 975.079.460-53
dc.contributor.authorLattes.fl_str_mv http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4751956Y0
dc.contributor.author.fl_str_mv Gastaldo, André Zoratto
contributor_str_mv Alho, Clarice Sampaio
dc.subject.por.fl_str_mv Identificação Genética Animal
ISAG
Marcadores STR
Estudos populacionais
topic Identificação Genética Animal
ISAG
Marcadores STR
Estudos populacionais
CIENCIAS BIOLOGICAS::BIOLOGIA GERAL
dc.subject.cnpq.fl_str_mv CIENCIAS BIOLOGICAS::BIOLOGIA GERAL
description The evolution in human identification through the study of genetic markers STR (Short Tandem Repeats) induced and propitiated the growth also of animal genetic identification. However, contrary to what occurs in the human domain, animal molecular identification still lacks validation of analysis systems and population studies to be considered reliable to the degree required. Only recently the International Society for Animal Genetics (ISAG) has recommended STR markers suitable for individual discrimination in domestic animal species. Accurate animal genetic identification is sought to provide entities, associations, breeders and owners in general with assurances that their animals are in fact derived from reliable breeders. Only reliable and authentic genealogical records will ensure, for example, efficiency in genetic breeding processes. Even though it is a promising area, there are currently only two options in the market for commercial kits for animal genotyping. But its use has been deferred by specialized laboratories in the field, which end up preparing their own identification panels, using the recommended genetic markers to meet their local demands more specifically. However, if the frequencies of the alleles present in these genetic markers in the study population are not known and the real power of discrimination that they provide is not estimated, the analyzes performed and the results obtained may generate misleading or imprecise interpretations. In the present study, three panels of STR genetic markers were used with all loci recommended by ISAG, capable of identifying equine, bovine and canine individuals. Allelic frequencies and other parameters such as heterozygosity, polymorphism information content, power of exclusion and power of discrimination were obtained from significant samples in breeds present in Rio Grande do Sul (Southern Brazil), Uruguay and Paraguay, to be used in the practice of animal genetics for identification purposes. In addition, comparative population studies within and among breeds were also carried out, in order to evaluate the genetic diversity of the animal populations studied.
publishDate 2017
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2017-06-30T18:31:34Z
dc.date.issued.fl_str_mv 2017-03-21
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
format doctoralThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://tede2.pucrs.br/tede2/handle/tede/7534
url http://tede2.pucrs.br/tede2/handle/tede/7534
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.relation.program.fl_str_mv 3463594373552466096
dc.relation.confidence.fl_str_mv 600
600
600
dc.relation.department.fl_str_mv 4699616958383316066
dc.relation.cnpq.fl_str_mv -1634559385931244697
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul
dc.publisher.program.fl_str_mv Programa de Pós-Graduação em Biologia Celular e Molecular
dc.publisher.initials.fl_str_mv PUCRS
dc.publisher.country.fl_str_mv Brasil
dc.publisher.department.fl_str_mv Faculdade de Biociências
publisher.none.fl_str_mv Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da PUC_RS
instname:Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul (PUCRS)
instacron:PUC_RS
instname_str Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul (PUCRS)
instacron_str PUC_RS
institution PUC_RS
reponame_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da PUC_RS
collection Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da PUC_RS
bitstream.url.fl_str_mv http://tede2.pucrs.br/tede2/bitstream/tede/7534/5/TES_ANDRE_ZORATTO_GASTALDO_COMPLETO.pdf.jpg
http://tede2.pucrs.br/tede2/bitstream/tede/7534/4/TES_ANDRE_ZORATTO_GASTALDO_COMPLETO.pdf.txt
http://tede2.pucrs.br/tede2/bitstream/tede/7534/3/license.txt
http://tede2.pucrs.br/tede2/bitstream/tede/7534/2/TES_ANDRE_ZORATTO_GASTALDO_COMPLETO.pdf
bitstream.checksum.fl_str_mv d65ca4d5cdd4b16382c72124d42e04b1
8cb6479eb896d5f913651a4d6e917d6a
5a9d6006225b368ef605ba16b4f6d1be
dbc7c8c4f5ab004118129ecf678044b8
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da PUC_RS - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul (PUCRS)
repository.mail.fl_str_mv biblioteca.central@pucrs.br||
_version_ 1799765327476686848