Geometric deep learning for functional neuroimaging analysis

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Marcon, Matheus Zampieri
Data de Publicação: 2021
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: eng
Título da fonte: Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da PUC_RS
Texto Completo: http://tede2.pucrs.br/tede2/handle/tede/9762
Resumo: O estudo do conectoma cerebral humano, um conjunto complexo de relações entre redes neurais cerebrais que associam estrutura cerebral e funcionalidade, têm recebido crescente interesse na área de neuroimagem ao longo da última década. Técnicas de aprendizado profundo constituem o estado da arte para tarefas de classificação de diferentes disordens neurológicas a partir de neuroimagens, proporcionando análises em profundidade acerca de características inerentes da atividade e conectividade cerebrais sem a necessidade prévia de seleção de features. No entanto, operações convolucionais de redes profundas tradicionais são aplicadas a regiões fixas de elementos durante o aprendizado, enquanto dados de conectoma cerebral são melhor representados na forma de grafos, com elementos espacialmente dispersos. Neste trabalho, fazemos uso de técnicas de aprendizado profundo geométrico para análise de dados de conectoma de imagens de ressonância magnética funcional (fMRI), buscando a identificação e extração de representações de características de alto nível das dinâmicas de redes cerebrais envolvidas na cognição humana. Nossas conclusões sugerem que as técnicas investigadas podem superar o estado da arte relativo a modelos de classificação de dados de fMRI além de possibilitar uma metodologia simples para análise de resultados.
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spelling Meneguzzi, Felipe Rechhttp://lattes.cnpq.br/5973550650941724http://lattes.cnpq.br/1347931480777142Marcon, Matheus Zampieri2021-06-25T18:11:20Z2021-03-19http://tede2.pucrs.br/tede2/handle/tede/9762O estudo do conectoma cerebral humano, um conjunto complexo de relações entre redes neurais cerebrais que associam estrutura cerebral e funcionalidade, têm recebido crescente interesse na área de neuroimagem ao longo da última década. Técnicas de aprendizado profundo constituem o estado da arte para tarefas de classificação de diferentes disordens neurológicas a partir de neuroimagens, proporcionando análises em profundidade acerca de características inerentes da atividade e conectividade cerebrais sem a necessidade prévia de seleção de features. No entanto, operações convolucionais de redes profundas tradicionais são aplicadas a regiões fixas de elementos durante o aprendizado, enquanto dados de conectoma cerebral são melhor representados na forma de grafos, com elementos espacialmente dispersos. Neste trabalho, fazemos uso de técnicas de aprendizado profundo geométrico para análise de dados de conectoma de imagens de ressonância magnética funcional (fMRI), buscando a identificação e extração de representações de características de alto nível das dinâmicas de redes cerebrais envolvidas na cognição humana. Nossas conclusões sugerem que as técnicas investigadas podem superar o estado da arte relativo a modelos de classificação de dados de fMRI além de possibilitar uma metodologia simples para análise de resultados.The study of the human brain connectome, a complex set of cerebral network relationships associating structure and functionality, has seen a growing interest in the field of neuroimaging over the last decade. Deep learning techniques constitute the state-ofthe-art for neuroimaging classification tasks on different neurological disorders, providing in-depth analysis into the inherent characteristics of brain activation and connectivity without the need for prior feature selection. However, convolutional operations of traditional deep networks affect fixed regions of elements during learning, whereas connectome data is best represented in the form of graphs, with spatially dispersed elements. We make use of geometric deep learning (GDL) for the analysis of whole-brain functional magnetic resonance imaging (fMRI) connectome data to identify and extract high-level feature representations of the cerebral network dynamics involved in human cognition. Our findings suggest that GDL techniques can outperform state-of-the-art models for classification of fMRI data while providing a simple framework for result analysis.Submitted by PPG Ciência da Computação (ppgcc@pucrs.br) on 2021-06-21T19:32:12Z No. of bitstreams: 1 MATHEUS ZAMPIERI MARCON_DIS.pdf: 7970023 bytes, checksum: 12565fc73423ae821aff145488a459db (MD5)Approved for entry into archive by Sarajane Pan (sarajane.pan@pucrs.br) on 2021-06-25T18:03:56Z (GMT) No. of bitstreams: 1 MATHEUS ZAMPIERI MARCON_DIS.pdf: 7970023 bytes, checksum: 12565fc73423ae821aff145488a459db (MD5)Made available in DSpace on 2021-06-25T18:11:20Z (GMT). No. of bitstreams: 1 MATHEUS ZAMPIERI MARCON_DIS.pdf: 7970023 bytes, checksum: 12565fc73423ae821aff145488a459db (MD5) Previous issue date: 2021-03-19Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPqapplication/pdfhttp://tede2.pucrs.br:80/tede2/retrieve/181472/MATHEUS%20ZAMPIERI%20MARCON_DIS.pdf.jpgengPontifícia Universidade Católica do Rio Grande do SulPrograma de Pós-Graduação em Ciência da ComputaçãoPUCRSBrasilEscola PolitécnicaArtificial IntelligenceNeuroimagingfMRIDeep Neural NetworksInteligência ArtificialNeuroimagemRedes Neurais ProfundasCIENCIA DA COMPUTACAO::TEORIA DA COMPUTACAOGeometric deep learning for functional neuroimaging analysisAprendizado profundo geométrico para análise de neuroimagens funcionaisinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisTrabalho não apresenta restrição para publicação-4570527706994352458500500600-8620782570833253011802873727776104890info:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da PUC_RSinstname:Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul (PUCRS)instacron:PUC_RSTHUMBNAILMATHEUS ZAMPIERI MARCON_DIS.pdf.jpgMATHEUS ZAMPIERI MARCON_DIS.pdf.jpgimage/jpeg5585http://tede2.pucrs.br/tede2/bitstream/tede/9762/3/MATHEUS+ZAMPIERI+MARCON_DIS.pdf.jpg1ca6fad63a30b62ead34831f6e9ce7d4MD53TEXTMATHEUS ZAMPIERI MARCON_DIS.pdf.txtMATHEUS ZAMPIERI MARCON_DIS.pdf.txttext/plain170695http://tede2.pucrs.br/tede2/bitstream/tede/9762/4/MATHEUS+ZAMPIERI+MARCON_DIS.pdf.txt3e1a64574952ad91225787e0d865b3b9MD54ORIGINALMATHEUS ZAMPIERI MARCON_DIS.pdfMATHEUS ZAMPIERI MARCON_DIS.pdfapplication/pdf7970023http://tede2.pucrs.br/tede2/bitstream/tede/9762/2/MATHEUS+ZAMPIERI+MARCON_DIS.pdf12565fc73423ae821aff145488a459dbMD52LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-8590http://tede2.pucrs.br/tede2/bitstream/tede/9762/1/license.txt220e11f2d3ba5354f917c7035aadef24MD51tede/97622021-06-26 12:00:17.312oai:tede2.pucrs.br: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Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://tede2.pucrs.br/tede2/PRIhttps://tede2.pucrs.br/oai/requestbiblioteca.central@pucrs.br||opendoar:2021-06-26T15:00:17Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da PUC_RS - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul (PUCRS)false
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