Identificação de ligantes da chiquimato quinase de Mycobacterium tuberculosis por docking molecular
Autor(a) principal: | |
---|---|
Data de Publicação: | 2011 |
Tipo de documento: | Dissertação |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da PUC_RS |
Texto Completo: | http://tede2.pucrs.br/tede2/handle/tede/5389 |
Resumo: | Entre as doenças infecciosas, a tuberculose se destaca, como sendo a principal causa de morte humana, principalmente em países em desenvolvimento. Entre os alvos identificados no genoma de Mycobacterium tuberculosis, as enzimas da via do chiquimato merecem atenção especial, pois são essenciais para a sobrevivência dos microorganismos e ausente em mamíferos. O objeto do nosso estudo é a quinta enzima desta via, a Chiquimato Quinase (SK). Foram aplicados métodos de virtual screening, a fim de identificar novos potenciais inibidores para esta enzima. Neste trabalho nós empregamos o programa MOLDOCK em todas as simulações de docking molecular. A precisão do docking enzima-ligante foi validada em um conjunto de 12 complexos de SK- ligante, para aquelas estruturas cristalográficas que estavam disponíveis, gerando um RMSD abaixo de 2,0 Å. A aplicação deste protocolo em um banco de dados comercialmente disponível permitiu a identificação de novas moléculas com potencial para se tornar drogas contra tuberculose. Além disso, foram identificados os resíduos da cavidade de ligação que são essenciais para as interações intermoleculares desta enzima |
id |
P_RS_f88c7db4bc9a7e1fb78d360602ee3a13 |
---|---|
oai_identifier_str |
oai:tede2.pucrs.br:tede/5389 |
network_acronym_str |
P_RS |
network_name_str |
Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da PUC_RS |
repository_id_str |
|
spelling |
Azevedo Junior, Walter Filgueira deCPF:08501905844http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4723433Y4CPF:81466390034http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4428471D7Vianna, Carolina Pasa2015-04-14T14:51:05Z2011-05-052011-03-10VIANNA, Carolina Pasa. Identificação de ligantes da chiquimato quinase de Mycobacterium tuberculosis por docking molecular. 2011. 52 f. Dissertação (Mestrado em Biologia Celular e Molecular) - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, Porto Alegre, 2011.http://tede2.pucrs.br/tede2/handle/tede/5389Made available in DSpace on 2015-04-14T14:51:05Z (GMT). No. of bitstreams: 1 431138.pdf: 1089028 bytes, checksum: b3d0bb2ab98885aab405ecc4329e3335 (MD5) Previous issue date: 2011-03-10Entre as doenças infecciosas, a tuberculose se destaca, como sendo a principal causa de morte humana, principalmente em países em desenvolvimento. Entre os alvos identificados no genoma de Mycobacterium tuberculosis, as enzimas da via do chiquimato merecem atenção especial, pois são essenciais para a sobrevivência dos microorganismos e ausente em mamíferos. O objeto do nosso estudo é a quinta enzima desta via, a Chiquimato Quinase (SK). Foram aplicados métodos de virtual screening, a fim de identificar novos potenciais inibidores para esta enzima. Neste trabalho nós empregamos o programa MOLDOCK em todas as simulações de docking molecular. A precisão do docking enzima-ligante foi validada em um conjunto de 12 complexos de SK- ligante, para aquelas estruturas cristalográficas que estavam disponíveis, gerando um RMSD abaixo de 2,0 Å. A aplicação deste protocolo em um banco de dados comercialmente disponível permitiu a identificação de novas moléculas com potencial para se tornar drogas contra tuberculose. Além disso, foram identificados os resíduos da cavidade de ligação que são essenciais para as interações intermoleculares desta enzimaapplication/pdfhttp://tede2.pucrs.br:80/tede2/retrieve/16319/431138.pdf.jpgporPontifícia Universidade Católica do Rio Grande do SulPrograma de Pós-Graduação em Biologia Celular e MolecularPUCRSBRFaculdade de BiociênciasBIOLOGIA MOLECULARBIOLOGIA CELULARPROTEÍNASTUBERCULOSEENZIMASCNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::BIOLOGIA GERALIdentificação de ligantes da chiquimato quinase de Mycobacterium tuberculosis por docking molecularinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesis819824693009663736060060036528317262667714info:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da PUC_RSinstname:Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul (PUCRS)instacron:PUC_RSTHUMBNAIL431138.pdf.jpg431138.pdf.jpgimage/jpeg3234http://tede2.pucrs.br/tede2/bitstream/tede/5389/3/431138.pdf.jpgce1291ba911f7d222ce8ff1e3a5a1809MD53TEXT431138.pdf.txt431138.pdf.txttext/plain65647http://tede2.pucrs.br/tede2/bitstream/tede/5389/2/431138.pdf.txtf9ed59307825a9f22a4bd111ccfa3347MD52ORIGINAL431138.pdfapplication/pdf1089028http://tede2.pucrs.br/tede2/bitstream/tede/5389/1/431138.pdfb3d0bb2ab98885aab405ecc4329e3335MD51tede/53892015-05-14 11:40:32.014oai:tede2.pucrs.br:tede/5389Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://tede2.pucrs.br/tede2/PRIhttps://tede2.pucrs.br/oai/requestbiblioteca.central@pucrs.br||opendoar:2015-05-14T14:40:32Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da PUC_RS - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul (PUCRS)false |
dc.title.por.fl_str_mv |
Identificação de ligantes da chiquimato quinase de Mycobacterium tuberculosis por docking molecular |
title |
Identificação de ligantes da chiquimato quinase de Mycobacterium tuberculosis por docking molecular |
spellingShingle |
Identificação de ligantes da chiquimato quinase de Mycobacterium tuberculosis por docking molecular Vianna, Carolina Pasa BIOLOGIA MOLECULAR BIOLOGIA CELULAR PROTEÍNAS TUBERCULOSE ENZIMAS CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::BIOLOGIA GERAL |
title_short |
Identificação de ligantes da chiquimato quinase de Mycobacterium tuberculosis por docking molecular |
title_full |
Identificação de ligantes da chiquimato quinase de Mycobacterium tuberculosis por docking molecular |
title_fullStr |
Identificação de ligantes da chiquimato quinase de Mycobacterium tuberculosis por docking molecular |
title_full_unstemmed |
Identificação de ligantes da chiquimato quinase de Mycobacterium tuberculosis por docking molecular |
title_sort |
Identificação de ligantes da chiquimato quinase de Mycobacterium tuberculosis por docking molecular |
author |
Vianna, Carolina Pasa |
author_facet |
Vianna, Carolina Pasa |
author_role |
author |
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv |
Azevedo Junior, Walter Filgueira de |
dc.contributor.advisor1ID.fl_str_mv |
CPF:08501905844 |
dc.contributor.advisor1Lattes.fl_str_mv |
http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4723433Y4 |
dc.contributor.authorID.fl_str_mv |
CPF:81466390034 |
dc.contributor.authorLattes.fl_str_mv |
http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4428471D7 |
dc.contributor.author.fl_str_mv |
Vianna, Carolina Pasa |
contributor_str_mv |
Azevedo Junior, Walter Filgueira de |
dc.subject.por.fl_str_mv |
BIOLOGIA MOLECULAR BIOLOGIA CELULAR PROTEÍNAS TUBERCULOSE ENZIMAS |
topic |
BIOLOGIA MOLECULAR BIOLOGIA CELULAR PROTEÍNAS TUBERCULOSE ENZIMAS CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::BIOLOGIA GERAL |
dc.subject.cnpq.fl_str_mv |
CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::BIOLOGIA GERAL |
description |
Entre as doenças infecciosas, a tuberculose se destaca, como sendo a principal causa de morte humana, principalmente em países em desenvolvimento. Entre os alvos identificados no genoma de Mycobacterium tuberculosis, as enzimas da via do chiquimato merecem atenção especial, pois são essenciais para a sobrevivência dos microorganismos e ausente em mamíferos. O objeto do nosso estudo é a quinta enzima desta via, a Chiquimato Quinase (SK). Foram aplicados métodos de virtual screening, a fim de identificar novos potenciais inibidores para esta enzima. Neste trabalho nós empregamos o programa MOLDOCK em todas as simulações de docking molecular. A precisão do docking enzima-ligante foi validada em um conjunto de 12 complexos de SK- ligante, para aquelas estruturas cristalográficas que estavam disponíveis, gerando um RMSD abaixo de 2,0 Å. A aplicação deste protocolo em um banco de dados comercialmente disponível permitiu a identificação de novas moléculas com potencial para se tornar drogas contra tuberculose. Além disso, foram identificados os resíduos da cavidade de ligação que são essenciais para as interações intermoleculares desta enzima |
publishDate |
2011 |
dc.date.available.fl_str_mv |
2011-05-05 |
dc.date.issued.fl_str_mv |
2011-03-10 |
dc.date.accessioned.fl_str_mv |
2015-04-14T14:51:05Z |
dc.type.status.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/publishedVersion |
dc.type.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/masterThesis |
format |
masterThesis |
status_str |
publishedVersion |
dc.identifier.citation.fl_str_mv |
VIANNA, Carolina Pasa. Identificação de ligantes da chiquimato quinase de Mycobacterium tuberculosis por docking molecular. 2011. 52 f. Dissertação (Mestrado em Biologia Celular e Molecular) - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, Porto Alegre, 2011. |
dc.identifier.uri.fl_str_mv |
http://tede2.pucrs.br/tede2/handle/tede/5389 |
identifier_str_mv |
VIANNA, Carolina Pasa. Identificação de ligantes da chiquimato quinase de Mycobacterium tuberculosis por docking molecular. 2011. 52 f. Dissertação (Mestrado em Biologia Celular e Molecular) - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, Porto Alegre, 2011. |
url |
http://tede2.pucrs.br/tede2/handle/tede/5389 |
dc.language.iso.fl_str_mv |
por |
language |
por |
dc.relation.program.fl_str_mv |
8198246930096637360 |
dc.relation.confidence.fl_str_mv |
600 600 |
dc.relation.department.fl_str_mv |
36528317262667714 |
dc.rights.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/openAccess |
eu_rights_str_mv |
openAccess |
dc.format.none.fl_str_mv |
application/pdf |
dc.publisher.none.fl_str_mv |
Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul |
dc.publisher.program.fl_str_mv |
Programa de Pós-Graduação em Biologia Celular e Molecular |
dc.publisher.initials.fl_str_mv |
PUCRS |
dc.publisher.country.fl_str_mv |
BR |
dc.publisher.department.fl_str_mv |
Faculdade de Biociências |
publisher.none.fl_str_mv |
Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul |
dc.source.none.fl_str_mv |
reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da PUC_RS instname:Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul (PUCRS) instacron:PUC_RS |
instname_str |
Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul (PUCRS) |
instacron_str |
PUC_RS |
institution |
PUC_RS |
reponame_str |
Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da PUC_RS |
collection |
Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da PUC_RS |
bitstream.url.fl_str_mv |
http://tede2.pucrs.br/tede2/bitstream/tede/5389/3/431138.pdf.jpg http://tede2.pucrs.br/tede2/bitstream/tede/5389/2/431138.pdf.txt http://tede2.pucrs.br/tede2/bitstream/tede/5389/1/431138.pdf |
bitstream.checksum.fl_str_mv |
ce1291ba911f7d222ce8ff1e3a5a1809 f9ed59307825a9f22a4bd111ccfa3347 b3d0bb2ab98885aab405ecc4329e3335 |
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv |
MD5 MD5 MD5 |
repository.name.fl_str_mv |
Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da PUC_RS - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul (PUCRS) |
repository.mail.fl_str_mv |
biblioteca.central@pucrs.br|| |
_version_ |
1799765307608268800 |