Associação entre variantes genéticas e perfil clínico multidimensional de doentes com perturbação do espetro do autismo: uma abordagem integrativa

• Autor(a) principal: Asif, Muhammad
• Data de Publicação: 2018
• Outros Autores: Couto, Francisco, Vicente, Astrid M.
• Tipo de documento: Artigo
• Idioma: por
• Título da fonte: Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)
• Texto Completo: http://hdl.handle.net/10400.18/5590
• topic: Perturbação do Espetro do Autismo; Variantes Genéticas; Perturbações do Desenvolvimento Infantil e Saúde; Machine Learning; Copy Number Variants (CNVs)

A complexidade genética e clínica que caracterizam a per turbação do espetro do autismo (PEA) têm limitado o desenvolvimento de biomarcadores que permitam um diagnóstico precoce e um prognóstico fiável, assim como uma abordagem personalizada para a inter venção terapêutica. Neste estudo pretendeu-se desenvolver uma abordagem integrativa para predição da apresentação clínica baseada em informação de variantes genéticas (Copy Number Variants, CNVs), com aplicação clínica no diagnóstico e prognóstico na PEA. Para tal, técnicas de aprendizagem automática (machine learning) foram aplicadas a dados clínicos e genéticos de 2446 doentes com PEA, recrutados no âmbito do consórcio Autism Genome Project. Análise de clustering de dados clínicos multidimensionais definiu, nesta população, dois subgrupos de pacientes com per fis clínicos diferindo significativamente em termos de capacidade verbal, nível cognitivo, gravidade da doença e compor tamento adaptativo. A análise dos CNVs que afetam especificamente genes do cérebro, nos mesmos indivíduos, identificou 15 processos biológicos enriquecidos em genes alterados. A aplicação de um algoritmo de machine learning para classificação dos doentes com apresentação clínica mais disfuncional, com base nos processos biológicos alterados, mostrou que correlações entre fenótipo clínico e biologia subjacente são possíveis na PEA e que, para grupos populacionais com dados informativos, existe um poder preditivo razoável. Para implementação deste conceito na prática clínica serão necessários estudos mais alargados com dados clínicos e genómicos mais completos.