Targeted Actinomycete Isolation From Macaronesia, Taxonomic Characterization And Evaluation Of Antimicrobial Potential
Autor(a) principal: | |
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Data de Publicação: | 2023 |
Tipo de documento: | Dissertação |
Idioma: | eng |
Título da fonte: | Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) |
Texto Completo: | http://hdl.handle.net/10362/161481 |
Resumo: | Actinobacteria é o filo que agrupa as bactérias gram-positivas, comumente denominadas de actinomicetas. Estas bactérias podem ser terrestres ou aquáticas (marinhas ou de água doce) e têm a capacidade de produzir uma grande variedade de compostos biologicamente ativos, muitos deles antibióticos importantes em clínica. As de origem terrestre são responsáveis pela produção de cerca de 70% dos compostos antimicrobianos atualmente no mercado. No entanto, a procura por novos antibióticos continua a ser de grande importância para o combate doenças infeciosas emergentes e a resistência bacteriana aos antibióticos. Devido a isto, os investigadores passaram a procurar actinomicetas em fontes menos exploradas, como nos oceanos. O principal objetivo deste trabalho foi explorar a diversidade biológica de actinomicetas marinhas isolados de sedimentos marinhos colhidos na região da Macaronésia. Através da observação de hifas filamentosas e/ou colónias coriáceas e posterior purificação por transferências seriadas, foram isoladas cento e doze actinomicetas das Ilhas Canárias e cento e oitenta e quatro actinomicetas do Arquipélago dos Açores. Para a caracterização taxonómica, o DNA destas actinomicetas, foi extraído e o gene 16S rRNA foi amplificado por PCR e depois sequenciado. Estas sequências foram então comparadas com sequências da base de dados NCBI e foram caracterizadas pela obtenção de um limiar de identidade de sequência de 99%. Nas Ilhas Canárias, os géneros identificados predominantemente foram Streptomyces, Salinispora e Dietzia. Um objetivo adicional foi verificar a capacidade, das actinomicetas coletadas, para produzir compostos com atividade antimicrobiana, contra E. coli K12 e ATCC35218 e S. aureus MRSA COL. Num ensaio de halo de inibição, doze estirpes de actinomicetas das Ilhas Canárias e trinta e sete do Arquipélago dos Açores revelaram atividade antibacteriana. |
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Targeted Actinomycete Isolation From Macaronesia, Taxonomic Characterization And Evaluation Of Antimicrobial PotentialMarine actinomycetesAntimicrobial activityActinobacteriaCanary IslandsAzoresDomínio/Área Científica::Engenharia e Tecnologia::Outras Engenharias e TecnologiasActinobacteria é o filo que agrupa as bactérias gram-positivas, comumente denominadas de actinomicetas. Estas bactérias podem ser terrestres ou aquáticas (marinhas ou de água doce) e têm a capacidade de produzir uma grande variedade de compostos biologicamente ativos, muitos deles antibióticos importantes em clínica. As de origem terrestre são responsáveis pela produção de cerca de 70% dos compostos antimicrobianos atualmente no mercado. No entanto, a procura por novos antibióticos continua a ser de grande importância para o combate doenças infeciosas emergentes e a resistência bacteriana aos antibióticos. Devido a isto, os investigadores passaram a procurar actinomicetas em fontes menos exploradas, como nos oceanos. O principal objetivo deste trabalho foi explorar a diversidade biológica de actinomicetas marinhas isolados de sedimentos marinhos colhidos na região da Macaronésia. Através da observação de hifas filamentosas e/ou colónias coriáceas e posterior purificação por transferências seriadas, foram isoladas cento e doze actinomicetas das Ilhas Canárias e cento e oitenta e quatro actinomicetas do Arquipélago dos Açores. Para a caracterização taxonómica, o DNA destas actinomicetas, foi extraído e o gene 16S rRNA foi amplificado por PCR e depois sequenciado. Estas sequências foram então comparadas com sequências da base de dados NCBI e foram caracterizadas pela obtenção de um limiar de identidade de sequência de 99%. Nas Ilhas Canárias, os géneros identificados predominantemente foram Streptomyces, Salinispora e Dietzia. Um objetivo adicional foi verificar a capacidade, das actinomicetas coletadas, para produzir compostos com atividade antimicrobiana, contra E. coli K12 e ATCC35218 e S. aureus MRSA COL. Num ensaio de halo de inibição, doze estirpes de actinomicetas das Ilhas Canárias e trinta e sete do Arquipélago dos Açores revelaram atividade antibacteriana.Actinobacteria is a phylum that groups gram-positive bacteria, commonly called actinomycetes. These bacteria can be terrestrial or aquatic (marine or freshwater) and are able to produce a wide range of biologically active compounds, many of them important antibiotics used in a clinical setting. Those of terrestrial origin are responsible for the production of more than 70% of the antimicrobial compounds currently on the market. However, the search for new antibiotics continues to be of great importance to combat emerging infectious diseases and bacterial antibiotic resistance. Due to this, researchers started looking for actinomycetes in less explored sources, such as the oceans. The main objective in this work was to explore the biological diversity of actinomycetes isolated from marine sediments collected from the Macaronesia region. Through the observation of filamentous hyphae and/or leathery colonies and posterior purification by serial transferences, one hundred and twelve actinomycetes were isolated from the Canary Islands and one hundred eighty-four actinomycetes were isolated from the Azores Archipelago. For taxonomic characterization, the DNA from these actinomycetes was extracted and the gene 16S rRNA was amplified by PCR and then sequenced. These sequences were then compared with sequences from the NCBI database and were characterized by obtaining a 99% sequence identity threshold. From the Canary Islands, the predominant identified genera were Streptomyces, Salinispora and Dietzia. An additional goal was to ascertain the capacity, of the collected actinomycetes, to produce compounds with antimicrobial activity, against E. coli K12 and ATCC35218 and S. aureus MRSA COL. In an inhibition halo assay, twelve actinomycetes strains from the Canary Islands and thirty-seven from the Azores Archipelago revealed antibacterial activity.Gaudêncio, SusanaSobral, RitaRUNParreira, Daniela Amândio2023-11-232026-09-30T00:00:00Z2023-11-23T00:00:00Zinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/10362/161481enginfo:eu-repo/semantics/embargoedAccessreponame:Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)instname:Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informaçãoinstacron:RCAAP2024-03-11T05:44:23Zoai:run.unl.pt:10362/161481Portal AgregadorONGhttps://www.rcaap.pt/oai/openaireopendoar:71602024-03-20T03:58:32.887068Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) - Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informaçãofalse |
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