Associação independente da variante rs1333049, no locus 9p21, com a doença coronária, numa população portuguesa
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Data de Publicação: | 2011 |
Outros Autores: | , , , , , , , , , , , |
Tipo de documento: | Artigo |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) |
Texto Completo: | http://hdl.handle.net/10400.13/4487 |
Resumo: | Introdução: Estudos recentes de associação genómica em larga escala (GWAS) identificaram vários polimorfismos de um único nucleótido (SNP), localizados no locus 9p21, associados com doença arterial coronária (DAC). De entre eles o SNP rs1333049 demonstrou uma associação consistente com a DAC tendo sido reproduzida, com sucesso, em várias populações. Objectivo: Investigar se a nova variante rs1333049, no cromossoma 9p21, é um factor de risco independente para DAC, na população Portuguesa. Material e métodos: Estudo caso-controlo, que incluiu 1406 indivíduos, 723 doentes coronários internados consecutivamente (idade média de 53,7±8,9 anos 79,9% do sexo masculino) e 683 controlos sem doença coronária (idade média de 53,3±10,5 anos, 73,9 % do sexo masculino) seleccionados para não serem significativamente diferentes quanto ao sexo e idade. Estudou-se o SNP rs1333049, em todos os indivíduos, com recurso à técnica convencionada de PCR combinada com a técnica TaqMan (Applied Biosystems). Determinou-se a distribuição alélica e genotípica (C/G), odds ratio e respectivo intervalo de confiança para risco de DAC. Foi construído um modelo de regressão logística forward wald ajustado para a idade, sexo, factores de risco convencionais, marcadores bioquímicos e genótipos em estudo, afim de avaliar quais as variáveis associadas de forma significativa e independente com DAC. Resultados: 60% dos doentes coronários e 53% dos controlos apresentaram o alelo C (OR=1,33; p=0,0002), 35,7% dos doentes e 29,3% dos controlos tinham o genótipo homozigoto CC (OR=1,34;p=0,010). O heterozigoto CG estava presente em 48,1% dos doentes e 47% nos controlos, não atingindo significância estatística, para risco vascular (OR=1,05;p=0,670). Após análise multivariada de regressão logística o genótipo CC do cromossoma 9p21 ficou na equação com um OR=1,7, p=0,018 e o genótipo heterozigoto CG com um OR=1,5, p=0,048. Conclusão: Com o presente trabalho replicou-se, numa população portuguesa, o risco coronário ligado à nova variante rs1333049 do cromossoma 9p21. A robustez deste genótipo, tanto em homo como em heterozigotia, tem sido consistente e relevante na estratificação de risco para a DAC, mesmo em contextos populacionais muito diversos. Nestas circunstâncias, a utilização do genótipo CC ou CG poderá vir a revelar-se útil para a previsão do risco de DAC na nossa população. |
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Associação independente da variante rs1333049, no locus 9p21, com a doença coronária, numa população portuguesaIndependent association of the variant rs1333049 at the 9p21 locus and coronary heart diseaseFactores de riscoPolimorfismos genéticosDoença arterial coronáriaLocus 9p21Risk factorsGenetic polymorphismsCoronary artery disease.Faculdade de Ciências da VidaIntrodução: Estudos recentes de associação genómica em larga escala (GWAS) identificaram vários polimorfismos de um único nucleótido (SNP), localizados no locus 9p21, associados com doença arterial coronária (DAC). De entre eles o SNP rs1333049 demonstrou uma associação consistente com a DAC tendo sido reproduzida, com sucesso, em várias populações. Objectivo: Investigar se a nova variante rs1333049, no cromossoma 9p21, é um factor de risco independente para DAC, na população Portuguesa. Material e métodos: Estudo caso-controlo, que incluiu 1406 indivíduos, 723 doentes coronários internados consecutivamente (idade média de 53,7±8,9 anos 79,9% do sexo masculino) e 683 controlos sem doença coronária (idade média de 53,3±10,5 anos, 73,9 % do sexo masculino) seleccionados para não serem significativamente diferentes quanto ao sexo e idade. Estudou-se o SNP rs1333049, em todos os indivíduos, com recurso à técnica convencionada de PCR combinada com a técnica TaqMan (Applied Biosystems). Determinou-se a distribuição alélica e genotípica (C/G), odds ratio e respectivo intervalo de confiança para risco de DAC. Foi construído um modelo de regressão logística forward wald ajustado para a idade, sexo, factores de risco convencionais, marcadores bioquímicos e genótipos em estudo, afim de avaliar quais as variáveis associadas de forma significativa e independente com DAC. Resultados: 60% dos doentes coronários e 53% dos controlos apresentaram o alelo C (OR=1,33; p=0,0002), 35,7% dos doentes e 29,3% dos controlos tinham o genótipo homozigoto CC (OR=1,34;p=0,010). O heterozigoto CG estava presente em 48,1% dos doentes e 47% nos controlos, não atingindo significância estatística, para risco vascular (OR=1,05;p=0,670). Após análise multivariada de regressão logística o genótipo CC do cromossoma 9p21 ficou na equação com um OR=1,7, p=0,018 e o genótipo heterozigoto CG com um OR=1,5, p=0,048. Conclusão: Com o presente trabalho replicou-se, numa população portuguesa, o risco coronário ligado à nova variante rs1333049 do cromossoma 9p21. A robustez deste genótipo, tanto em homo como em heterozigotia, tem sido consistente e relevante na estratificação de risco para a DAC, mesmo em contextos populacionais muito diversos. Nestas circunstâncias, a utilização do genótipo CC ou CG poderá vir a revelar-se útil para a previsão do risco de DAC na nossa população.Introduction: Recent genome-wide association studies have identified single-nucleotide polymorphisms (SNPs) at the 9p21 locus as risk factors for coronary artery disease (CAD). Among them, the SNP rs1333049 has demonstrated a consistent association with CAD, which has been successfully replicated in several populations. Aim: To investigate whether the SNP rs1333049 located on the 9p21 chromosome is an independent risk factor for CAD in a Portuguese population. Methods: We performed a case-control study which included 1406 individuals, 723 consecutive coronary patients (mean age 53.7±8.9 years, 79.9% male) and 683 controls without coronary disease (mean age 53.3±10.5 years, 73.9% male). Cases and controls were selected so as not to be significantly different in terms of gender and age. We studied the SNP rs1333049 at the 9p21 locus in all individuals, using standard PCR combined with the TaqMan technique (Applied Biosystems). The allelic and genotype distribution (C/G), odds ratios and corresponding confidence intervals for CAD risk were determined. A forward Wald logistic regression analysis model was constructed, adjusted for age, gender, conventional risk factors, biochemical markers and the genotypes under study, in order to determine which variables were linked significantly and independently with CAD. Results: The C allele was found in 60% of the CAD patients and 53% of the controls, with OR=1.33; p=0.0002. The CC genotype appeared in 35.7% of CAD patients, with OR=1.34, p=0.010. The heterozygous CG genotype was present in 48.1% of the CAD patients and 47% of the controls, and did not present vascular risk (OR=1.05, p=0.670). After logistic regression analysis, the CC genotype remained in the equation with OR=1.7; p=0.018 and CG with OR=1.5, p=0.048. Conclusion: In the present study we replicated the coronary risk linked to the recently discovered variant rs1333049 on the 9p21 chromosome in a Portuguese population. Although the mechanism underlying the risk is still unknown, the robustness of this risk allele in risk stratification for CAD has been consistent, even in very different populations. The presence of the CC or CG genotype may thus prove to be useful for predicting the risk of developing CAD in the Portuguese population.ElsevierDigitUMaMendonça, IsabelReis, Roberto Palma dosPereira, AndreiaCafé, HugoSerrão, MarcoSousa, Ana CéliaFreitas, Ana IsabelGuerra, GraçaFreitas, SóniaFreitas, CarolinaOrnelas, IlídioBrehm, AntónioAraújo, José Jorge2022-08-01T10:39:17Z2011-01-01T00:00:00Z2011-01-01T00:00:00Zinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/articleapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/10400.13/4487porMendonça, I., Reis, R. P., Pereira, A., Café, H., Serrão, M., Sousa, A. C., ... & Araújo, J. J. (2011). Associação independente da variante rs1333049, no locus 9p21, com a doença coronária, numa população portuguesa. Revista Portuguesa de Cardiologia, 30(06), 575-591.info:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)instname:Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informaçãoinstacron:RCAAP2022-09-05T12:57:48Zoai:digituma.uma.pt:10400.13/4487Portal AgregadorONGhttps://www.rcaap.pt/oai/openaireopendoar:71602024-03-19T15:08:36.806581Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) - Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informaçãofalse |
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