Expression of recombinant human proteins involved in drug metabolism
Autor(a) principal: | |
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Data de Publicação: | 2021 |
Tipo de documento: | Dissertação |
Idioma: | eng |
Título da fonte: | Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) |
Texto Completo: | http://hdl.handle.net/10400.26/36783 |
Resumo: | Ao longo dos anos, a expressão heteróloga de proteínas recombinantes tem sido um campo muito estudado na biotecnologia, com diversas aplicações laboratoriais e industriais, desde a produção de proteínas para estudos de estrutura e função até à produção industrial, em larga escala, de proteínas como a insulina, que são utilizadas como agentes terapêuticos. A expressão heteróloga de proteínas está intrinsecamente ligada à tecnologia de DNA recombinante, que, ao permitir a manipulação dos genes envolvidos nos processos de expressão proteica, permite a obtenção de praticamente qualquer proteína desejada em quantidades apreciáveis. O objectivo deste trabalho foi o estabelecimento de estirpes bacterianas capazes de expressar proteínas humanas envolvidas no metabolismo de fármacos, de modo a possibilitar o seu posterior uso em modelos in vitro de metabolismo de fármacos. Recorrendo à sub-clonagem de cDNA, procurou-se clonar duas isoformas do citocromo P450 (CYP2C8 e CYP3A4), a NADPH:citocromo P450 oxidorreductase (POR), e a UDP-glucuronosiltransferase 2B7 (UGT2B7).Enquanto que os CYP e a POR estão envolvidas no metabolismo de fase I de muitos fármacos, bem como outros xenobióticos e compostos endógenos, catalisando a introdução de grupos polares de modo a facilitar a sua posterior metabolização, a UGT2B7 actua a nível da fase II, catalisando a inserção de grupos glucuronosilo nos fármacos, facilitando a sua excreção. Para realizar estas subclonagens foram aplicadas técnicas de clonagem tradicional usando amplificação de genes por PCR e sucessivas digestões enzimáticas, fazendo a ligação dos inserts em vetores de expressão com o auxílio de ligases. Em algumas das proteínas (CYP2C8, CYP3A4, e POR) foi aplicada também uma técnica de clonagem independente de ligação enzimática, recorrendo ao uso de primers e reações de PCR para amplificar os inserts de interesse e ligar estes a vetores específicos para este tipo de procedimento. Foram obtidos clones prontos a expressar em E. coli C43(DE3) das proteínas POR e UGT2B7 e clones da CYP2C8 e CYP3A4 em E.coli DH5α. As proteínas POR e UGT2B7 foram expressas concluindo que a proteína UGT2B7 pode ser obtida purificando o sobrenadante da lise celular das células expressas com uma coluna de permuta iónica eluída com um buffer com 25 mM de imidazole. Não foi possível obter a proteína POR através do mesmo método |
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Expression of recombinant human proteins involved in drug metabolismCitocromo P450GlucuronosiltransferaseCitocromo P450 oxidorredutaseSubclonagemExpressão proteicaCytochrome P450GlucuronosyltransferaseCytochrome P450 oxidoreductaseSubcloningProtein expressionAo longo dos anos, a expressão heteróloga de proteínas recombinantes tem sido um campo muito estudado na biotecnologia, com diversas aplicações laboratoriais e industriais, desde a produção de proteínas para estudos de estrutura e função até à produção industrial, em larga escala, de proteínas como a insulina, que são utilizadas como agentes terapêuticos. A expressão heteróloga de proteínas está intrinsecamente ligada à tecnologia de DNA recombinante, que, ao permitir a manipulação dos genes envolvidos nos processos de expressão proteica, permite a obtenção de praticamente qualquer proteína desejada em quantidades apreciáveis. O objectivo deste trabalho foi o estabelecimento de estirpes bacterianas capazes de expressar proteínas humanas envolvidas no metabolismo de fármacos, de modo a possibilitar o seu posterior uso em modelos in vitro de metabolismo de fármacos. Recorrendo à sub-clonagem de cDNA, procurou-se clonar duas isoformas do citocromo P450 (CYP2C8 e CYP3A4), a NADPH:citocromo P450 oxidorreductase (POR), e a UDP-glucuronosiltransferase 2B7 (UGT2B7).Enquanto que os CYP e a POR estão envolvidas no metabolismo de fase I de muitos fármacos, bem como outros xenobióticos e compostos endógenos, catalisando a introdução de grupos polares de modo a facilitar a sua posterior metabolização, a UGT2B7 actua a nível da fase II, catalisando a inserção de grupos glucuronosilo nos fármacos, facilitando a sua excreção. Para realizar estas subclonagens foram aplicadas técnicas de clonagem tradicional usando amplificação de genes por PCR e sucessivas digestões enzimáticas, fazendo a ligação dos inserts em vetores de expressão com o auxílio de ligases. Em algumas das proteínas (CYP2C8, CYP3A4, e POR) foi aplicada também uma técnica de clonagem independente de ligação enzimática, recorrendo ao uso de primers e reações de PCR para amplificar os inserts de interesse e ligar estes a vetores específicos para este tipo de procedimento. Foram obtidos clones prontos a expressar em E. coli C43(DE3) das proteínas POR e UGT2B7 e clones da CYP2C8 e CYP3A4 em E.coli DH5α. As proteínas POR e UGT2B7 foram expressas concluindo que a proteína UGT2B7 pode ser obtida purificando o sobrenadante da lise celular das células expressas com uma coluna de permuta iónica eluída com um buffer com 25 mM de imidazole. Não foi possível obter a proteína POR através do mesmo métodoOver the years, heterologous expression of recombinant proteins has been a very important field in biotechnology, with various laboratory and industrial applications, from protein expression for structural and functional studies to the large-scale industrial production of proteins, such as insulin, that are used as therapeutics. Protein heterologous expression is intrinsically connected to recombinant DNA technology, which, by allowing the manipulation of the genes involved in protein expression, allows obtaining virtually any protein in appreciable amounts. This work aimed to establish bacterial strains able to express human proteins involved in drug metabolism to allow their use in subsequent in vitro studies of drug transformation. By resorting to cDNA sub-cloning, the specific goals were to clone two cytochrome P450 isoforms (CYP2C8 and CYP3A4), NADPH:cytochrome P450 oxidoreductase (POR), and the 2B7 isoform of the UDP-glucuronosyltransferase enzyme (UGT2B7). While CYP and POR are involved in the phase I metabolism of drugs, xenobiotics and endogenous compounds, catalysing the introduction of polar groups to facilitate further metabolism, UGT2B7 is responsible for introducing the large polar glucuronosyl moiety, facilitating the excretion of drugs. To perform these subcloning tasks, traditional cloning techniques were applied using gene amplification by PCR, coupled to enzymatic digestions, ligating the inserts in the vectors with the aid of ligases. For some of the proteins (CYP2C8, CYP3A4, and POR), a ligation independent technique was also applied, using primers and PCR reactions to amplify the inserts of interest and ligate these to specific vectors for this type of procedure. Clones ready to express in E. coli C43 (DE3) of POR and UGT2B7 proteins were obtained, and clones of the CYP2C8 and CYP3A4 were transformed in E. coli DH5α. The POR and UGT2B7 proteins were expressed concluding that the UGT2B7 protein can be attained by purifying the cell lysis supernatant from the expressed cells with an ion-exchange column eluted with a 25 mM imidazole buffer. It was not possible to obtain the POR protein through the same purification method as this protein,although being expressed, remains attached to the cell membranes.Justino, MartaJustino, GonçaloRepositório ComumPrazeres, João Miguel Pinto dos2021-062026-07-01T00:00:00Z2021-06-01T00:00:00Zinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/10400.26/36783TID:203248635enginfo:eu-repo/semantics/embargoedAccessreponame:Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)instname:Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informaçãoinstacron:RCAAP2023-11-21T09:56:14Zoai:comum.rcaap.pt:10400.26/36783Portal AgregadorONGhttps://www.rcaap.pt/oai/openaireopendoar:71602024-03-19T23:11:47.928873Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) - Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informaçãofalse |
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Ao longo dos anos, a expressão heteróloga de proteínas recombinantes tem sido um campo muito estudado na biotecnologia, com diversas aplicações laboratoriais e industriais, desde a produção de proteínas para estudos de estrutura e função até à produção industrial, em larga escala, de proteínas como a insulina, que são utilizadas como agentes terapêuticos. A expressão heteróloga de proteínas está intrinsecamente ligada à tecnologia de DNA recombinante, que, ao permitir a manipulação dos genes envolvidos nos processos de expressão proteica, permite a obtenção de praticamente qualquer proteína desejada em quantidades apreciáveis. O objectivo deste trabalho foi o estabelecimento de estirpes bacterianas capazes de expressar proteínas humanas envolvidas no metabolismo de fármacos, de modo a possibilitar o seu posterior uso em modelos in vitro de metabolismo de fármacos. Recorrendo à sub-clonagem de cDNA, procurou-se clonar duas isoformas do citocromo P450 (CYP2C8 e CYP3A4), a NADPH:citocromo P450 oxidorreductase (POR), e a UDP-glucuronosiltransferase 2B7 (UGT2B7).Enquanto que os CYP e a POR estão envolvidas no metabolismo de fase I de muitos fármacos, bem como outros xenobióticos e compostos endógenos, catalisando a introdução de grupos polares de modo a facilitar a sua posterior metabolização, a UGT2B7 actua a nível da fase II, catalisando a inserção de grupos glucuronosilo nos fármacos, facilitando a sua excreção. Para realizar estas subclonagens foram aplicadas técnicas de clonagem tradicional usando amplificação de genes por PCR e sucessivas digestões enzimáticas, fazendo a ligação dos inserts em vetores de expressão com o auxílio de ligases. Em algumas das proteínas (CYP2C8, CYP3A4, e POR) foi aplicada também uma técnica de clonagem independente de ligação enzimática, recorrendo ao uso de primers e reações de PCR para amplificar os inserts de interesse e ligar estes a vetores específicos para este tipo de procedimento. Foram obtidos clones prontos a expressar em E. coli C43(DE3) das proteínas POR e UGT2B7 e clones da CYP2C8 e CYP3A4 em E.coli DH5α. As proteínas POR e UGT2B7 foram expressas concluindo que a proteína UGT2B7 pode ser obtida purificando o sobrenadante da lise celular das células expressas com uma coluna de permuta iónica eluída com um buffer com 25 mM de imidazole. Não foi possível obter a proteína POR através do mesmo método |
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