Exploring Biodiversity For Natural Micro (Bio)-Based Polymers Biodegradable

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Rodrigues, Diogo Vicente
Data de Publicação: 2021
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: eng
Título da fonte: Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)
Texto Completo: http://hdl.handle.net/10316/98053
Resumo: Dissertação de Mestrado em Bioquímica apresentada à Faculdade de Ciências e Tecnologia
id RCAP_14c24f051efbb53cb892d15d93671cf6
oai_identifier_str oai:estudogeral.uc.pt:10316/98053
network_acronym_str RCAP
network_name_str Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)
repository_id_str 7160
spelling Exploring Biodiversity For Natural Micro (Bio)-Based Polymers BiodegradableEstudo da Biodiversidade Para a Deteção de Polímeros de Base Micro(Bio) BiodegradáveisBiopolímeroPoli-hidroxialcanoatoBiodiversidadeBactériaMineração GenómicaBiopolymerPolyhydroxyalkanoatesBiodiversityBacteriaPHA miningDissertação de Mestrado em Bioquímica apresentada à Faculdade de Ciências e TecnologiaOs polímeros são necessários na sociedade atual. Durante a pandemia COVID-19, houve um aumento da produção e utilização de produtos plásticos. Isto levou ao agravamento dos problemas ambientais. Têm sido exploradas novas alternativas aos plásticos de origem petrolífera, entre eles os bioplásticos. Estes são geralmente definidos como plásticos produzidos a partir de matérias-primas renováveis ou por polímeros produzidos por microrganismos. Os poli-hidroxialcanoatos (PHA) são poliésteres que podem ser produzidos naturalmente e acumulados na forma de grânulos dentro de células bacterianas. As suas propriedades físico-químicas e térmicas dependem de cada organismo produtor e das condições de cultivo. O objetivo deste estudo é encontrar novos produtores de polímeros bacterianos, assim como novos tipos de polímeros. No total, 106 estirpes bacterianas pertencentes a coleções de cultura foram analisadas para a produção de PHA. A extração e a mineração genómica de cada estirpe foram realizadas com vista a encontrar genes essenciais à produção de PHA. Foi realizada a otimização dos parâmetros de produção, tais como pH, temperatura, fontes de carbono e tempo de incubação. Os produtos foram caracterizados por Fourier-Transform Infrared (FTIR) e Ressonância Magnética Nuclear (RMN). Apenas um terço dos isolados apresentou resultados positivos no rastreio, sendo a maioria das estirpes pertencentes à classe Alphaproteobacteria. O gene que codifica para a enzima essencial na produção de PHA (PHA sintase) foi encontrado em genomas de 47 géneros bacterianos. Combinando a informação genómica e o rastreio bioquímico, os cinco produtores bacterianos selecionados mostraram diferentes parâmetros de produção, assim como condições ótimas de produção. O PHA produzido nas condições ótimas para cada estirpe varia de 0.019±0.001 a 0.088±0.007 g.L-1 de PHB equivalentes/DO600. Quando caracterizadas por FTIR e NMR, o PHA destas estirpes mostrou diferenças quando comparado com a literatura. Em conclusão, este trabalho mostrou novos produtores bacterianos e novos polímeros que poderiam ser utilizados como potencial económico.Polymers are necessary for a society that uses them in its daily life. During the pandemic of COVID-19, there was an increase in the production and use of plastic products. This has led to worsening environmental problems. New alternatives to petroleum-based plastics have been explored, especially bioplastics. Bioplastics are generally defined as plastics produced from renewable raw materials or by several polymers produced by microorganisms. Polyhydroxyalkanoates (PHA) are polyesters that can be naturally produced and accumulated as granules inside bacteria cells. Their physicochemical and thermal properties depend on each producer organism and cultivation conditions. The aim of this study is to find new bacterial-polymers producers and new types of polymers. In total, 106 bacterial strains from culture collections were screened for PHA production. The genome mining of each strain was performed in order to find key genes involved in PHA production. The optimization of producing parameters, such as pH, temperature, carbon sources and incubation time, was performed and products were characterized by Fourier-transform Infrared (FTIR) and Nuclear Magnetic Resonance (NMR). Only one-third of isolates showed positive results on screening, most of the strains belonging to the class Alphaproteobacteria. The key gene involved in encoding PHA production for PHA synthase was found in 47 bacterial genera. Combining the genomic information and biochemical screening, the best five bacterial producers showed different producing parameters as optimal production conditions. The PHA produced for each strain at optimal conditions varies from 0.019 ± 0.001 a 0.088 ± 0.007 g.L-1 of PHB equivalents/OD600. When characterized by FTIR and NMR, the PHA of these strains showed differences when compared to the literature. In conclusion, this work showed new bacterial producers and new polymers that could be used as economic potential.2021-12-032027-12-02T00:00:00Zinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesishttp://hdl.handle.net/10316/98053http://hdl.handle.net/10316/98053TID:202919854engRodrigues, Diogo Vicenteinfo:eu-repo/semantics/embargoedAccessreponame:Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)instname:Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informaçãoinstacron:RCAAP2023-10-27T11:04:13Zoai:estudogeral.uc.pt:10316/98053Portal AgregadorONGhttps://www.rcaap.pt/oai/openaireopendoar:71602024-03-19T21:15:58.675797Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) - Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informaçãofalse
dc.title.none.fl_str_mv Exploring Biodiversity For Natural Micro (Bio)-Based Polymers Biodegradable
Estudo da Biodiversidade Para a Deteção de Polímeros de Base Micro(Bio) Biodegradáveis
title Exploring Biodiversity For Natural Micro (Bio)-Based Polymers Biodegradable
spellingShingle Exploring Biodiversity For Natural Micro (Bio)-Based Polymers Biodegradable
Rodrigues, Diogo Vicente
Biopolímero
Poli-hidroxialcanoato
Biodiversidade
Bactéria
Mineração Genómica
Biopolymer
Polyhydroxyalkanoates
Biodiversity
Bacteria
PHA mining
title_short Exploring Biodiversity For Natural Micro (Bio)-Based Polymers Biodegradable
title_full Exploring Biodiversity For Natural Micro (Bio)-Based Polymers Biodegradable
title_fullStr Exploring Biodiversity For Natural Micro (Bio)-Based Polymers Biodegradable
title_full_unstemmed Exploring Biodiversity For Natural Micro (Bio)-Based Polymers Biodegradable
title_sort Exploring Biodiversity For Natural Micro (Bio)-Based Polymers Biodegradable
author Rodrigues, Diogo Vicente
author_facet Rodrigues, Diogo Vicente
author_role author
dc.contributor.author.fl_str_mv Rodrigues, Diogo Vicente
dc.subject.por.fl_str_mv Biopolímero
Poli-hidroxialcanoato
Biodiversidade
Bactéria
Mineração Genómica
Biopolymer
Polyhydroxyalkanoates
Biodiversity
Bacteria
PHA mining
topic Biopolímero
Poli-hidroxialcanoato
Biodiversidade
Bactéria
Mineração Genómica
Biopolymer
Polyhydroxyalkanoates
Biodiversity
Bacteria
PHA mining
description Dissertação de Mestrado em Bioquímica apresentada à Faculdade de Ciências e Tecnologia
publishDate 2021
dc.date.none.fl_str_mv 2021-12-03
2027-12-02T00:00:00Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://hdl.handle.net/10316/98053
http://hdl.handle.net/10316/98053
TID:202919854
url http://hdl.handle.net/10316/98053
identifier_str_mv TID:202919854
dc.language.iso.fl_str_mv eng
language eng
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/embargoedAccess
eu_rights_str_mv embargoedAccess
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)
instname:Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informação
instacron:RCAAP
instname_str Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informação
instacron_str RCAAP
institution RCAAP
reponame_str Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)
collection Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)
repository.name.fl_str_mv Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) - Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informação
repository.mail.fl_str_mv
_version_ 1817552490419191808