Bacteria, Archaea e genes de proteorrodopsinas em neuston estuarino

• Autor(a) principal: Lykholat, Veronika
• Data de Publicação: 2012
• Tipo de documento: Dissertação
• Idioma: por
• Título da fonte: Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)
• Texto Completo: http://hdl.handle.net/10773/10262
• topic: Microbiologia; Ecossistemas aquáticos: Ria de Aveiro (Portugal); Microbiologia aquática; Bacterioplâncton

Considerando que a salinidade e um fator determinante da distribuição de procariotas em ambientes aquáticos, o objetivo deste trabalho foi analisar a diversidade estrutural das comunidades de Archaea e de Bacteria na micromada superficial (SML) e na agua subjacente (ULW) ao longo de um gradiente de salinidade na Ria de Aveiro (Canal de Mira). Adicionalmente, foi ainda feita a pesquisa de genes de proteorrodopsinas, proteinas fotossensiveis em DNA total extraído de bacterioneuston e de bacterioplancton. A diversidade estrutural das comunidades de Archaea e de Bacteria no neuston e no plancton foi analisada por electroforese em gel com gradiente desnaturante (DGGE) e os resultados foram tratados estatisticamente no sentido de estimar a diversidade em cada comunidade e o grau de semelhança entre diferentes comunidades. A diversidade de genes das PR foi analisada a base dos resultados da amplificação de PCR com os primers especificos para PR nas amostras ambientais e culturas isoladas. Foram registadas diferenças na estrutura das comunidades bacterianas da SML em diferentes pontos de colheita indicando variação espacial ao longo do gradiente estuarino. Foram registadas diferenças significativas na estrutura das comunidades da SML e da ULW de Bacteria em dois pontos de colheita. A analise estatística efectuada indica a ausência da separação das comunidades de Archaea da SML e da ULW. A analise hierárquica indica a heterogeneidade da diversidade estrutural com pouca similaridade entre todas sub-amostras das comunidades da SML ou da ULW de Archaea ao longo do Canal de Mira. MDS e ANOSIM não mostram a separação espacial das comunidades da SML ou da ULW de Archaea ao longo do perfil estuarino. Os valores do índice de Shannon-Wiener calculados a partir dos resultados de DGGE indicam que a diversidade das comunidades de Archaea e de Bacteria nao apresenta variações significativas entre das comunidades da SML e da ULW nos todos pontos da colheita, nem entre das comunidades da SML ou da ULW ao longo do canal. Foram obtidos resultados positivos da amplificação com primers para as PR da Flavobacteria na quase totalidade das amostras ambientais e nos isolados bacterianos. A ocorrência de genes de proteorrodopsinas pode ser interpretada como uma adaptação das comunidades bacterianas da agua estuarina a elevada exposição a radiação solar.