O microbioma do solo: influência do estado fitossanitário do sobreiro

• Autor(a) principal: Pinho, Diogo Figueiredo
• Data de Publicação: 2012
• Tipo de documento: Dissertação
• Idioma: por
• Título da fonte: Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)
• Texto Completo: http://hdl.handle.net/10773/10876
• topic: Biotecnologia; Sobreiros; Doenças das plantas; Microorganismos patogénicos: Solos

Nas últimas décadas tem ocorrido um declínio extensivo das espécies de Quercus sp. ao longo da Europa Central e Bacia do Mediterrâneo, induzida por uma série de fatores bióticos e abióticos. De forma a compreender qual o impacto do estado fitossanitário da espécie Quercus suber na população dos microrganismos do solo, foi efetuada a caraterização e comparação do microbioma do solo de sobreiros saudáveis e doentes. Para isso, o DNA total da comunidade microbiana de dezasseis amostras de solo, provenientes de sobreiros saudáveis e sobreiros decrépitos, foi extraído e as sequências dos genes do rRNA 16S (bactérias) e do “Internal Transcribed Spacer II” (fungos) foram amplificadas por PCR. Inicialmente foi utilizada a DGGE como abordagem preliminar para comparação e agrupamento das amostras. De seguida, as amostras selecionadas foram sequenciadas na plataforma 454 da Life Sciences (Roche) de forma a detalhar a estrutura e composição do microbioma associado a cada estádio de saúde do sobreiro, assim como comparar as populações de microrganismos presentes nestas duas condições. Os resultados revelaram que ambas as comunidades microbianas apresentavam uma elevada diversidade de espécies, verificando-se nas comunidades bacterianas e fúngicas uma predominância dos filos Proteobacteria e Basidiomycota, respetivamente. Na análise funcional do grupo dos fungos foram detetadas várias espécies de cogumelos, ectomicorrizas, fungos saprófitas e produtores de antibióticos, e nas bactérias verificou-se a presença de microrganismos que participam no ciclo do azoto, produtoras de antibióticos, produtoras de ácido láctico e promotoras do crescimento das plantas. Na comparação do microbioma do solo de árvores saudáveis e decrépitas não foram observadas diferenças significativas para os dois grupos de microrganismos. Desta forma foi demonstrado que os exsudatos libertados pelas raízes não alteram significativamente a composição das comunidades microbianas presentes no solo livre de raízes. No entanto, este trabalho possibilitou um avanço na compreensão da estrutura e composição das comunidades microbianas do solo de sobreiros, permitindo desta forma a caraterização global dos microrganismos presentes no solo do montado.