Caracterização de fatores moleculares implicados na patogenicidade de Phytophthora cinnamomi

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Pereira, Nélia Armanda Faiões da Nova
Data de Publicação: 2017
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)
Texto Completo: http://hdl.handle.net/10198/15833
Resumo: Os Oomicetas estão entre os organismos que causam doenças graves nas plantas e importantes perdas económicas na agricultura. São um grupo diverso de organismos eucariotas que podem encontrar-se em muitos nichos ecológicos, incluindo saprófitas e parasitas de plantas e animais. Phytophthora cinnamomi é um Oomiceta, considerado um dos patogéneos mais difundidos e destrutivos do planeta. A sua presença geográfica é cosmopolita e a gama de hospedeiros é encarada como uma das maiores. Este patogéneo causa danos económicos enormes a importantes culturas a nível mundial, isto contribuiu para despertar a atenção da comunidade científica. É o agente causal da doença da “tinta” do castanheiro (Castanea sativa Miller). Em Portugal, o castanheiro ocupa sobretudo a parte mais montanhosa do interior Centro e Norte, sendo uma importante fonte de rendimento das populações. O castanheiro tem diferentes aplicações, para além da castanha e da madeira, possuí um papel importante na ecologia dos solos e na biodiversidade. Por isso, é importante conhecer os mecanismos moleculares (genes e proteínas) que estão na base do processo infeccioso de Castanea sativa por Phytophthora cinnamomi e a natureza da interação patogéneo-hospedeiro a fim de se poderem estabelecer estratégias de combate e controlo deste parasita. Com ferramentas de bioinformática, conseguimos identificar e caracterizar o gene Avr3a em sequências genómicas de P. cinnamomi, depositadas nas Databases. Este gene codifica uma proteína com 209 aa reconhecida no citoplasma do hospedeiro onde desencadeia morte celular. Neste trabalho também caraterizamos duas sequências no genoma de P. cinnamomi que codificam proteínas de 309 e 425 aa, com atividade lipásica e com localização extracelular, homólogas com proteínas de papel significativo na patogenicidade de fungos de diferentes espécies do género Phytophthora. A fim de compreender melhor o seu papel no mecanismo de patogenicidade, foram desenhadas cassetes de silenciamento por ARN de interferência para os genes que codificam estas proteínas.
id RCAP_18b078b7c97586d1079dd67207d1bd96
oai_identifier_str oai:bibliotecadigital.ipb.pt:10198/15833
network_acronym_str RCAP
network_name_str Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)
repository_id_str 7160
spelling Caracterização de fatores moleculares implicados na patogenicidade de Phytophthora cinnamomiCastanheiroPhytophthora cinnamomiDoença da tintaLipasesGene Avr3aARN de interferênciaDomínio/Área Científica::Ciências Médicas::Biotecnologia MédicaOs Oomicetas estão entre os organismos que causam doenças graves nas plantas e importantes perdas económicas na agricultura. São um grupo diverso de organismos eucariotas que podem encontrar-se em muitos nichos ecológicos, incluindo saprófitas e parasitas de plantas e animais. Phytophthora cinnamomi é um Oomiceta, considerado um dos patogéneos mais difundidos e destrutivos do planeta. A sua presença geográfica é cosmopolita e a gama de hospedeiros é encarada como uma das maiores. Este patogéneo causa danos económicos enormes a importantes culturas a nível mundial, isto contribuiu para despertar a atenção da comunidade científica. É o agente causal da doença da “tinta” do castanheiro (Castanea sativa Miller). Em Portugal, o castanheiro ocupa sobretudo a parte mais montanhosa do interior Centro e Norte, sendo uma importante fonte de rendimento das populações. O castanheiro tem diferentes aplicações, para além da castanha e da madeira, possuí um papel importante na ecologia dos solos e na biodiversidade. Por isso, é importante conhecer os mecanismos moleculares (genes e proteínas) que estão na base do processo infeccioso de Castanea sativa por Phytophthora cinnamomi e a natureza da interação patogéneo-hospedeiro a fim de se poderem estabelecer estratégias de combate e controlo deste parasita. Com ferramentas de bioinformática, conseguimos identificar e caracterizar o gene Avr3a em sequências genómicas de P. cinnamomi, depositadas nas Databases. Este gene codifica uma proteína com 209 aa reconhecida no citoplasma do hospedeiro onde desencadeia morte celular. Neste trabalho também caraterizamos duas sequências no genoma de P. cinnamomi que codificam proteínas de 309 e 425 aa, com atividade lipásica e com localização extracelular, homólogas com proteínas de papel significativo na patogenicidade de fungos de diferentes espécies do género Phytophthora. A fim de compreender melhor o seu papel no mecanismo de patogenicidade, foram desenhadas cassetes de silenciamento por ARN de interferência para os genes que codificam estas proteínas.Oomycetes are among the organisms that cause serious diseases in plants and significant economic losses in agriculture. They are a diverse group of eukaryotic organisms that can be found in many ecological niches, including saprophytes and plant and animal parasites. Phytophthora cinnamomi is an Oomycete considered one of the most widespread and destructive pathogens on the planet. Its geographic presence is cosmopolitan and the range of hosts is regarded as one of the largest. This pathogen causes enormous economic damages to important cultures worldwide, this has helped to attract the attention of the scientific community. It is the causal agent of chestnut "ink" disease (Castanea sativa Miller). In Portugal, the chestnut tree occupies mainly the hilly part of the interior of the Center and North, being an important source of income of the populations. The chestnut tree has different applications, besides chestnut and wood, it plays an important role in soil ecology and biodiversity. Therefore it is important to know the molecular mechanisms (genes and proteins) that are the basis of the Castanea sativa infestation process by Phytophthora cinnamomi and the nature of the pathogen-host interaction in order to establish strategies to combat and control this parasite. With bioinformatics tools, we were able to identify and characterize the Avr3a gene in genomic sequences of P. cinnamomi deposited in the Databases. This gene encodes a recognized 209 aa protein in the host cytoplasm where it triggers cell death. In this work we also characterize two sequences in the genome of P. cinnamomi that encode proteins of 309 and 425 aa with lipase activity and with extracellular localization, homologues with proteins with significant role in the pathogenicity of fungi of different species of the genus Phytophthora. In order to better understand their role in the pathogenicity mechanism, interference RNA silencing cassettes were designed for the genes encoding these proteins.Choupina, AltinoBiblioteca Digital do IPBPereira, Nélia Armanda Faiões da Nova2018-02-20T12:19:36Z20172017-01-01T00:00:00Zinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/10198/15833TID:201854406porinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)instname:Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informaçãoinstacron:RCAAP2023-11-21T10:36:39Zoai:bibliotecadigital.ipb.pt:10198/15833Portal AgregadorONGhttps://www.rcaap.pt/oai/openaireopendoar:71602024-03-19T23:05:12.655727Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) - Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informaçãofalse
dc.title.none.fl_str_mv Caracterização de fatores moleculares implicados na patogenicidade de Phytophthora cinnamomi
title Caracterização de fatores moleculares implicados na patogenicidade de Phytophthora cinnamomi
spellingShingle Caracterização de fatores moleculares implicados na patogenicidade de Phytophthora cinnamomi
Pereira, Nélia Armanda Faiões da Nova
Castanheiro
Phytophthora cinnamomi
Doença da tinta
Lipases
Gene Avr3a
ARN de interferência
Domínio/Área Científica::Ciências Médicas::Biotecnologia Médica
title_short Caracterização de fatores moleculares implicados na patogenicidade de Phytophthora cinnamomi
title_full Caracterização de fatores moleculares implicados na patogenicidade de Phytophthora cinnamomi
title_fullStr Caracterização de fatores moleculares implicados na patogenicidade de Phytophthora cinnamomi
title_full_unstemmed Caracterização de fatores moleculares implicados na patogenicidade de Phytophthora cinnamomi
title_sort Caracterização de fatores moleculares implicados na patogenicidade de Phytophthora cinnamomi
author Pereira, Nélia Armanda Faiões da Nova
author_facet Pereira, Nélia Armanda Faiões da Nova
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Choupina, Altino
Biblioteca Digital do IPB
dc.contributor.author.fl_str_mv Pereira, Nélia Armanda Faiões da Nova
dc.subject.por.fl_str_mv Castanheiro
Phytophthora cinnamomi
Doença da tinta
Lipases
Gene Avr3a
ARN de interferência
Domínio/Área Científica::Ciências Médicas::Biotecnologia Médica
topic Castanheiro
Phytophthora cinnamomi
Doença da tinta
Lipases
Gene Avr3a
ARN de interferência
Domínio/Área Científica::Ciências Médicas::Biotecnologia Médica
description Os Oomicetas estão entre os organismos que causam doenças graves nas plantas e importantes perdas económicas na agricultura. São um grupo diverso de organismos eucariotas que podem encontrar-se em muitos nichos ecológicos, incluindo saprófitas e parasitas de plantas e animais. Phytophthora cinnamomi é um Oomiceta, considerado um dos patogéneos mais difundidos e destrutivos do planeta. A sua presença geográfica é cosmopolita e a gama de hospedeiros é encarada como uma das maiores. Este patogéneo causa danos económicos enormes a importantes culturas a nível mundial, isto contribuiu para despertar a atenção da comunidade científica. É o agente causal da doença da “tinta” do castanheiro (Castanea sativa Miller). Em Portugal, o castanheiro ocupa sobretudo a parte mais montanhosa do interior Centro e Norte, sendo uma importante fonte de rendimento das populações. O castanheiro tem diferentes aplicações, para além da castanha e da madeira, possuí um papel importante na ecologia dos solos e na biodiversidade. Por isso, é importante conhecer os mecanismos moleculares (genes e proteínas) que estão na base do processo infeccioso de Castanea sativa por Phytophthora cinnamomi e a natureza da interação patogéneo-hospedeiro a fim de se poderem estabelecer estratégias de combate e controlo deste parasita. Com ferramentas de bioinformática, conseguimos identificar e caracterizar o gene Avr3a em sequências genómicas de P. cinnamomi, depositadas nas Databases. Este gene codifica uma proteína com 209 aa reconhecida no citoplasma do hospedeiro onde desencadeia morte celular. Neste trabalho também caraterizamos duas sequências no genoma de P. cinnamomi que codificam proteínas de 309 e 425 aa, com atividade lipásica e com localização extracelular, homólogas com proteínas de papel significativo na patogenicidade de fungos de diferentes espécies do género Phytophthora. A fim de compreender melhor o seu papel no mecanismo de patogenicidade, foram desenhadas cassetes de silenciamento por ARN de interferência para os genes que codificam estas proteínas.
publishDate 2017
dc.date.none.fl_str_mv 2017
2017-01-01T00:00:00Z
2018-02-20T12:19:36Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://hdl.handle.net/10198/15833
TID:201854406
url http://hdl.handle.net/10198/15833
identifier_str_mv TID:201854406
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)
instname:Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informação
instacron:RCAAP
instname_str Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informação
instacron_str RCAAP
institution RCAAP
reponame_str Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)
collection Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)
repository.name.fl_str_mv Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) - Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informação
repository.mail.fl_str_mv
_version_ 1799135302270320640