Identificação e sequenciação de genes da via da lenhificação em bibliotecas BAC de Eucalyptus globulus

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Barrela, Ricardo Joel Martins Bernardino Marques
Data de Publicação: 2011
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)
Texto Completo: http://hdl.handle.net/10400.5/4188
Resumo: Mestrado em Engenharia Florestal e dos Recursos Naturais - Instituto Superior de Agronomia
id RCAP_3d7b820b7416a899a307bf6ee8b5cf5f
oai_identifier_str oai:www.repository.utl.pt:10400.5/4188
network_acronym_str RCAP
network_name_str Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)
repository_id_str 7160
spelling Identificação e sequenciação de genes da via da lenhificação em bibliotecas BAC de Eucalyptus globulusEucalyptus globulusBAC librarylignin biosynthesis pathway3 D poolMestrado em Engenharia Florestal e dos Recursos Naturais - Instituto Superior de AgronomiaIn this work we characterized two libraries containing BAC clones - EGC_Ba and EGC_Bb - obtained from fragments of genomic DNA of Eucalyptus globulus digested with HindIII and EcoRI respectively. The estimated genome coverage for the two libraries was 16X. Both libraries had inserts with average size of 115kb. Assessment of contamination by extranuclear genome was performed by hybridization of high-density colony filters, ensuring a low rate of contamination. The probability associated with the attempt to find specific sequences in the libraries was calculated at a value greater than 0.99. The identification of several genes involved in lignin biosynthetic pathway, transcription factors and peripheral regions of interest via PCR was performed using an innovative scheme of three-dimensional pools. Of the clones identified, thirteen were chosen for sequencing. The analysis of the sequences obtained allowed identifying the reduced presence of repetitive elements and microsatellites. The identified clones can be used in future researches involving the isolation of genes of QTL and genomic sequence comparison with other species of Eucalyptus.ISA/UTLPaiva, Jorge PintoAlmeida, Maria Helena RibeiroRepositório da Universidade de LisboaBarrela, Ricardo Joel Martins Bernardino Marques2012-03-26T15:15:11Z20112011-01-01T00:00:00Zinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/10400.5/4188porBarrela, Ricardo Joel Martins Bernardino Marques - Identificação e sequenciação de genes da via da lenhificação em bibliotecas BAC de Eucalyptus globulus. Lisboa: ISA, 2011info:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)instname:Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informaçãoinstacron:RCAAP2023-03-06T14:35:11Zoai:www.repository.utl.pt:10400.5/4188Portal AgregadorONGhttps://www.rcaap.pt/oai/openaireopendoar:71602024-03-19T16:51:53.991175Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) - Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informaçãofalse
dc.title.none.fl_str_mv Identificação e sequenciação de genes da via da lenhificação em bibliotecas BAC de Eucalyptus globulus
title Identificação e sequenciação de genes da via da lenhificação em bibliotecas BAC de Eucalyptus globulus
spellingShingle Identificação e sequenciação de genes da via da lenhificação em bibliotecas BAC de Eucalyptus globulus
Barrela, Ricardo Joel Martins Bernardino Marques
Eucalyptus globulus
BAC library
lignin biosynthesis pathway
3 D pool
title_short Identificação e sequenciação de genes da via da lenhificação em bibliotecas BAC de Eucalyptus globulus
title_full Identificação e sequenciação de genes da via da lenhificação em bibliotecas BAC de Eucalyptus globulus
title_fullStr Identificação e sequenciação de genes da via da lenhificação em bibliotecas BAC de Eucalyptus globulus
title_full_unstemmed Identificação e sequenciação de genes da via da lenhificação em bibliotecas BAC de Eucalyptus globulus
title_sort Identificação e sequenciação de genes da via da lenhificação em bibliotecas BAC de Eucalyptus globulus
author Barrela, Ricardo Joel Martins Bernardino Marques
author_facet Barrela, Ricardo Joel Martins Bernardino Marques
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Paiva, Jorge Pinto
Almeida, Maria Helena Ribeiro
Repositório da Universidade de Lisboa
dc.contributor.author.fl_str_mv Barrela, Ricardo Joel Martins Bernardino Marques
dc.subject.por.fl_str_mv Eucalyptus globulus
BAC library
lignin biosynthesis pathway
3 D pool
topic Eucalyptus globulus
BAC library
lignin biosynthesis pathway
3 D pool
description Mestrado em Engenharia Florestal e dos Recursos Naturais - Instituto Superior de Agronomia
publishDate 2011
dc.date.none.fl_str_mv 2011
2011-01-01T00:00:00Z
2012-03-26T15:15:11Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://hdl.handle.net/10400.5/4188
url http://hdl.handle.net/10400.5/4188
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.relation.none.fl_str_mv Barrela, Ricardo Joel Martins Bernardino Marques - Identificação e sequenciação de genes da via da lenhificação em bibliotecas BAC de Eucalyptus globulus. Lisboa: ISA, 2011
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv ISA/UTL
publisher.none.fl_str_mv ISA/UTL
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)
instname:Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informação
instacron:RCAAP
instname_str Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informação
instacron_str RCAAP
institution RCAAP
reponame_str Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)
collection Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)
repository.name.fl_str_mv Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) - Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informação
repository.mail.fl_str_mv
_version_ 1799130995242303488

Registros relacionados