Influence of Hypholoma fasciculare in chesnut grove sustainability
Autor(a) principal: | |
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Data de Publicação: | 2014 |
Tipo de documento: | Dissertação |
Idioma: | eng |
Título da fonte: | Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) |
Texto Completo: | http://hdl.handle.net/10348/2956 |
Resumo: | O castanheiro europeu (Castanea sativa) possui elevada importância económica a nível nacional, devido sobretudo ao valor do fruto (castanha) e à elevada qualidade da madeira. A presença do fungo Hypholoma fasciculare tem vindo a ser observada em soutos de Trás-os-Montes (Bragança). Este saprófita apresenta uma expressiva acção antagonista contra diversos fungos presentes no solo de soutos. A avaliação do metagenoma do solo dos soutos transmontanos revelou que 55% das sequências identificadas pertencem ao filo Basidiomycota, enquanto apenas 19% pertencem no filo Ascomycota. Apesar do filo Basidiomycota ser o mais representativo (em termos de sequências identificadas), o filo Ascomycota apresenta maior diversidade em espécies. De modo a compreender as consequências da presença de H. fasciculare na diversidade microbiana dos solos, o efeito da presença deste fungo foi avaliado em solos de três soutos contendo diferentes quantidades de carpóforos de H. fasciculare. As diferenças dos três metagenomas não se revelaram estatisticamente significativas. Quando foram analisados os diferentes grupos tróficos, verificou-se que os soutos que continham uma maior abundância de carpóforos de H. fasciculare, apresentavam solos com elevadas quantidades de fungos parasíticos e reduzida quantidade de fungos ectomicorrízicos. Apesar desta diferença não ser estatisticamente significativa, a dúvida sobre se H. fasciculare afeta a comunidade fúngica dos solos ainda permanece. A avaliação da atividade antimicrobiana de H. fasciculare, em condições in vitro, foi realizada pela metodologia de overlay previamente descrita. O efeito de H. fasciculare contra leveduras e bactérias revelou padrões de sensibilidade distintos. No que respeita à actividade anti-levedura, H. fasciculare revelou ter uma atividade inferior à da amphotericina B, enquanto no caso do fluconazole a sua atividade era semelhante. H. fasciculare apresentou uma atividade antibacteriana muito superior, apesar de apresentar um desempenho heterogéneo dependendo dos antibióticos com que se compare. A caracterização preliminar da substância antimicrobiana foi efetuada, sugerindo que a substância é difusível, não parece ser uma proteína e não requer a presença de um organismo interatuante para ser produzida por H. fasciculare. Apesar de ainda permanecerem algumas dúvidas, H. fasciculare aparenta não ter particular importância a nível ambiental para os soutos. No entanto, a produção de uma nova molécula antimicrobiana poderá constituir uma promissora aposta futura. Mais estudos são requeridos para a identificação desta molécula e avaliação do seu eventual interesse industrial. |
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De modo a compreender as consequências da presença de H. fasciculare na diversidade microbiana dos solos, o efeito da presença deste fungo foi avaliado em solos de três soutos contendo diferentes quantidades de carpóforos de H. fasciculare. As diferenças dos três metagenomas não se revelaram estatisticamente significativas. Quando foram analisados os diferentes grupos tróficos, verificou-se que os soutos que continham uma maior abundância de carpóforos de H. fasciculare, apresentavam solos com elevadas quantidades de fungos parasíticos e reduzida quantidade de fungos ectomicorrízicos. Apesar desta diferença não ser estatisticamente significativa, a dúvida sobre se H. fasciculare afeta a comunidade fúngica dos solos ainda permanece. A avaliação da atividade antimicrobiana de H. fasciculare, em condições in vitro, foi realizada pela metodologia de overlay previamente descrita. O efeito de H. fasciculare contra leveduras e bactérias revelou padrões de sensibilidade distintos. 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Mais estudos são requeridos para a identificação desta molécula e avaliação do seu eventual interesse industrial.The chestnut tree (Castanea sativa) has an enormous economic importance at national level, mainly due to the value of the fruit (chestnut) and the high quality of the wood. The presence of Hypholoma fasciculare fungus has been observed in chestnut orchard soils of Trás-os-Montes (Portugal). This saprophyte has an expressive antagonist action against other soil-borne fungi present in chestnut groves and other microorganism. Chestnut soil metagenome was evaluated and revealed that 55% of identified fungi belong to Basidiomycota phylum, while only 19% belong to Ascomycota. Although Basidiomycota was the most representative phylum (number of reads), Ascomycota presented a higher number of species. In order to assess the consequences arising from the presence of H. fasciculare on soil microbial diversity, the effect of the presence of this fungus was evaluated in soils from three chestnut groves presenting different amounts of H. fasciculare sporocarps. Differences on soil metagenomes did not reveal to be statistically significant. When variation of trophic groups were analyzed, orchards presenting high abundance of H. fasciculare displayed higher amounts of parasitic fungi and reduced amounts of ectomycorrhizal fungi. Although these differences were not statistically significant, the hypothesis of H. fasciculare to be affecting the fungal community of soils still remains. The in vitro antimicrobial assay of H. fasciculare against yeasts and bacteria was performed using a previously described overlay methodology. In what concerns anti-yeastactivity, H. fasciculare presented a weaker antimicrobial activity than amphotericin B, but displayed a similar behavior as fluconazole. H. fasciculare presented a much higher antibacterial activity, although displaying a more heterogeneous response depending on the tested antibiotics. The preliminary characterization of the antimicrobial substance was also performed, suggesting that the substance is diffusible, does not seem to be a protein and does not seem to require the presence of an interacting organism to be produced by H. fasciculare. Although some reservations still remains, H. fasciculare does not seem to have a particular environmental importance in chestnut orchards. However, the production of a new antimicrobial molecule could be a promising future tool. More studies are required for identifying this molecule and to evaluate its industrial interest.2014-02-11T15:32:55Z2014-02-11T00:00:00Z2014-02-11info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/10348/2956engReis, Francisca Rodrigues dosinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)instname:Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informaçãoinstacron:RCAAP2024-02-02T12:30:34Zoai:repositorio.utad.pt:10348/2956Portal AgregadorONGhttps://www.rcaap.pt/oai/openaireopendoar:71602024-03-20T02:00:32.931071Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) - Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informaçãofalse |
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