Caracterização das resistências antimicrobianas de bactérias isoladas de aquaculturas

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Nogueira, Sara Sofia Rocha
Data de Publicação: 2023
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)
Texto Completo: http://hdl.handle.net/10451/61562
Resumo: Tese de mestrado, Microbiologia Aplicada, 2023, Universidade de Lisboa, Faculdade de Ciências
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spelling Caracterização das resistências antimicrobianas de bactérias isoladas de aquaculturasAquaculturaResistência antimicrobianaElementos genéticos móveisAntibióticosGenes de resistência a antibióticosTeses de mestrado - 2023Departamento de Biologia VegetalTese de mestrado, Microbiologia Aplicada, 2023, Universidade de Lisboa, Faculdade de CiênciasOs antibióticos são utilizados nas explorações de aquacultura para prevenir e tratar doenças nos animais aquáticos. Como não existem antibióticos especificamente concebidos para a aquacultura, são utilizados fármacos autorizados para outras áreas da medicina, o que pode ter implicações na medicina humana e animal. A presença de elementos genéticos móveis permite a transmissão de genes de resistência a antibióticos a outras bactérias, o que impulsiona a formação de reservatórios de resistência antimicrobiana nestes ambientes. O problema acentua-se quando as explorações de aquacultura se localizam na proximidade de zonas urbanas com atividade antropogénica e quando existe um uso inconsciente de antibióticos. Neste estudo, foi feita a caracterização fenotípica e genotípica de 19 isolados bacterianos de amostras de sedimentos de aquacultura (n=10), de miolo de ostra (n=5) e de ameijoa japonesa (n=3), e de conteúdo intestinal de dourada (n=1). Foi utilizado o método de difusão em agar e microdiluição em caldo para aferir o perfil de resistência dos isolados, tendo sido maioritariamente detetadas resistências intrínsecas. Através da sequenciação de genoma completo dos isolados que demostraram possuir possíveis resistências adquiridas, foram detetados genes de resistência à ciprofloxacina (qnrD1), trimetoprim (dfrA1), espectinomicina e estreptomicina (aadA1) e estreptotricina (sat-2) no isolado Proteus mirabilis 5AQ e tetraciclina (tet(M), tet(L)) em Enterococcus faecalis 3AQ. Foram detetadas mutações em pbp5 que conferem suscetibilidade à ampicilina em dois isolados de Enterococcus faecium, 1AQ e 4AQ. Através de um ensaio de PCR multiplex foi detetado um integrão de classe 1 no isolado Enterococcus hirae 34AQ e um integrão de classe 2 no isolado Proteus mirabilis 5AQ. Com os resultados obtidos neste estudo exploratório, é possível perceber que existe a necessidade de monitorizar este ambiente através de estudos mais alargados e representativos. Metodologias como a análise metagenómica podem ser alternativas mais eficazes para a caracterização do ambiente de aquacultura.Antibiotics are used on aquaculture farms to prevent and treat diseases in aquatic animals. As there are no antibiotics specifically designed for aquaculture, drugs authorized for other areas of medicine are used, which may have implications for human and animal medicine. The presence of mobile genetic elements allows the transmission of antibiotic resistance genes to other bacteria, which drives the formation of reservoirs of antimicrobial resistance in these environments. The problem is accentuated when aquaculture farms are located close to urban areas with anthropogenic activity and when there is an unconscious use of antibiotics. In this study, the phenotypic and genotypic characterization of 19 bacterial isolates from samples of aquaculture sediments (n=10), oyster kernels (n=5) and Japanese clams (n=3), and intestinal contents of sea bream (n=1) were conducted. The agar diffusion and broth microdilution methods were used to assess the resistance profile of the isolates, with intrinsic resistance being mostly detected. Resistance genes for ciprofloxacin (qnrD1), trimethoprim (dfrA1), spectinomycin and streptomycin (aadA1) and streptotricin (sat-2) were detected in isolate Proteus mirabilis 5AQ and tetracycline (tet(M), tet(L)) in Enterococcus faecalis 3AQ by Whole Genome Sequencing. Mutations in pbp5 that confer susceptibility to ampicillin were detected in two Enterococcus faecium isolates, 1AQ and 4AQ. Through a multiplex PCR assay, a class 1 integron was detected in the Enterococcus hirae 34AQ isolate and a class 2 integron in the Proteus mirabilis 5AQ isolate. With the results obtained in this exploratory study, it is possible to perceive that there is a need to monitor this environment through more extensive and representative studies. Methodologies such as metagenomics may be more effective alternatives for characterizing the aquaculture environment.Botelho, Ana Rosa PomboReis, Ana Maria Gonçalves, 1958-Repositório da Universidade de LisboaNogueira, Sara Sofia Rocha2023-12-28T13:37:59Z202320232023-01-01T00:00:00Zinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/10451/61562porinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)instname:Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informaçãoinstacron:RCAAP2024-01-01T01:16:58Zoai:repositorio.ul.pt:10451/61562Portal AgregadorONGhttps://www.rcaap.pt/oai/openaireopendoar:71602024-03-20T00:57:03.172023Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) - Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informaçãofalse
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