Burden of disease of Campylobacter spp. infection : a contribute to estimate the public health impact in Portugal

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Rocha, Cristina de Sousa Chora da Cruz Correia
Data de Publicação: 2023
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: eng
Título da fonte: Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)
Texto Completo: http://hdl.handle.net/10400.5/29923
Resumo: Dissertação de Mestrado em Segurança Alimentar, área científica de Produção Animal e Segurança Alimentar
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spelling Burden of disease of Campylobacter spp. infection : a contribute to estimate the public health impact in PortugalBurden of diseaseCampylobacterPublic health surveillancePortugalDALYsCarga de doençaCampylobacterSistema de vigilânciaPortugalDALYsDissertação de Mestrado em Segurança Alimentar, área científica de Produção Animal e Segurança AlimentarCampylobacteriosis has been the most reported zoonosis in EU since 2005, representing 50% of all the reported cases in 2019. However, those cases probably represent only the tip of the iceberg, underestimating the true incidence of this foodborne disease. Several factors that may limit the reporting include healthcare seeking behaviour in gastroenteritis and medical doctors´ decision of requesting a stool sample. This study aimed to reconstruct the surveillance pyramid to estimate the true incidence and the burden of disease of Campylobacter spp. infection in Portugal and therefore contribute to an informed basis for future decision-making by animal and public health authorities. The surveillance pyramid of campylobacteriosis in Portugal was re-constructed from models described in the literature and adapted to country-specific published data and studies whenever available. The model was developed to estimate the true incidence of campylobacteriosis, scaling up the number of reported confirmed cases and correcting it for underdiagnosis and undereporting. The parameters informed by data from literature were in general defined as probabilistic distributions. The estimated multiplier was applied to surveillance data from 2017 on Campylobacter infections in Portugal (SINAVE), data provided by the Directorate-General of Health in 2018. Burden of disease was measured in DALYs (disability-adjusted life years) using ECDC BCoDE toolkit – an application and graphical interface developed in R for probabilistic calculation of DALYs, YLDs (years lived with disability) and YLLs (years of life lost) for each health-outcome, using the estimated data based on 2017 reported cases. The estimated underreporting factor of campylobacteriosis in Portugal was 38.96 (30.01-54.33; 90% CI). In other words, for each case captured by public health surveillance around 39 people were symptomatically infected, suggesting that a total of 23,220 cases occurred, including 450 estimated hospitalized cases. The overall burden of disease in 2017 was estimated in 293 DALYs per year (2.82 DALYs/100,000 population). Like in other EU countries, in Portugal Campylobacter causes a substantial burden of disease. These are the first estimates of burden of campylobacteriosis in Portugal. The model may be applied to other foodborne bacteria, allowing to rank estimates, establishing priorities in surveillance and triggering collaborative interventions across human and animal sectors. This study may thus contribute to raise awareness on the need for a One Health approach by animal and public health authoritiesRESUMO - Carga de doença por infeção de Campylobacter spp. – um contributo para estimar o impacto na saúde pública em Portugal - A campilobacteriose tem sido a zoonose mais notificada na UE desde 2005, representando 50% de todos os casos reportados em 2019. Todavia, esses casos representam apenas a ponta do iceberg, subestimando a verdadeira incidência dessa doença de origem alimentar. Vários fatores podem limitar os casos notificados, incluindo a procura de cuidados médicos em caso de gastroenterite ou a decisão clínica de analisar uma amostra de fezes. Este estudo teve como objetivo a reconstrução da pirâmide de vigilância para estimar a verdadeira incidência e a carga de doença (burden) por infeção de Campylobacter spp. em Portugal e, assim, contribuir para fundamentar decisões por parte das autoridades de saúde animal e saúde pública. A pirâmide de vigilância da campilobacteriose em Portugal foi reconstruída a partir de modelos descritos na literatura e adaptada a estudos nacionais, sempre que disponíveis. O modelo foi desenvolvido para estimar a verdadeira incidência de campilobacteriose, a partir do número de casos notificados, corrigindo-a para subdiagnóstico e subnotificação. Os parâmetros foram informados pela literatura e definidos como distribuições probabilísticas. O multiplicador estimado foi aplicado aos dados de vigilância de 2017 das infeções por Campylobacter spp. em Portugal (SINAVE), disponibilizados pela Direção-Geral da Saúde em 2018. A carga de doença utilizou a métrica DALYs (anos de vida ajustados por incapacidade) usando a ferramenta do ECDC BCoDE – uma aplicação e interface gráfico desenvolvidos em R para cálculo probabilístico de DALYs, YLDs (anos vividos com incapacidade) e YLLs (anos de vida perdidos) para cada resultado de saúde, usando os dados de incidência real estimada com base nos casos notificados de 2017. O fator de subnotificação estimado para a campilobacteriose em Portugal foi de 38,96 (30,01- 54,33; IC 90%). Ou seja, para cada caso captado pelo sistema de vigilância em saúde pública, cerca de 39 pessoas foram infetadas e manifestaram sintomas, sugerindo um total de 23.220 casos , incluindo 450 casos estimados de hospitalização. A carga global da doença em 2017 foi estimada em 293 DALYs por ano (2,82 DALYs/100.000 habitantes). Tal como noutros países da UE, em Portugal a Campylobacter spp. é responsável por uma carga de doença substancial, sendo esta a sua primeira estimativa. O modelo pode ser aplicado a outros agentes transmitidos por alimentos, permitindo estabelecer prioridades na vigilância e promover intervenções articuladas entre os setores humano e animal. Este estudo pode, assim, contribuir para aumentar a consciencialização sobre a necessidade de uma abordagem One Health por parte das autoridades de saúde animal e públicaUniversidade de Lisboa, Faculdade de Medicina VeterináriaPires, Sara Neves da Costa MonteiroNunes, Telmo Renato Landeiro Raposo PinaRepositório da Universidade de LisboaRocha, Cristina de Sousa Chora da Cruz Correia2024-01-24T10:58:38Z2023-11-272023-11-27T00:00:00Zinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/10400.5/29923engRocha CSCCC. 2023. Burden of disease of Campylobacter spp. infection : a contribute to estimate the public health impact in Portugal [master's thesis]. Lisboa: FMV-Universidade de Lisboainfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)instname:Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informaçãoinstacron:RCAAP2024-01-28T01:33:53Zoai:www.repository.utl.pt:10400.5/29923Portal AgregadorONGhttps://www.rcaap.pt/oai/openaireopendoar:71602024-03-20T01:58:21.863130Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) - Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informaçãofalse
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