Development and validation of a GC-MS based method to analyse faecal bile acids

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Araújo, Ana Margarida Carneiro
Data de Publicação: 2016
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: eng
Título da fonte: Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)
Texto Completo: http://hdl.handle.net/1822/47101
Resumo: Dissertação de mestrado em Biomedical Engineering (área de especialização em Clinical Engineering)
id RCAP_7dce0d1c90259c8cdea85e450a3741ff
oai_identifier_str oai:repositorium.sdum.uminho.pt:1822/47101
network_acronym_str RCAP
network_name_str Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)
repository_id_str 7160
spelling Development and validation of a GC-MS based method to analyse faecal bile acidsEngenharia e Tecnologia::Outras Engenharias e TecnologiasDissertação de mestrado em Biomedical Engineering (área de especialização em Clinical Engineering)Background: About 5% of the bile acids (BAs) escape enterohepatic recirculation in the terminal ileum and enter the large intestine where they are further metabolized by the colonic microbiota and finally excreted in faeces. The amount and composition of faecal bile acids has been associated to several disease states. Aim: to develop a Gas Chromatography – Mass Spectrometry (GCMS) based method that allows the quantification of bile acids (BA) in faecal samples and to validate this method. Methods: BAs were esterified and silylated to increase their volatility. Standard solutions of cholic acid (CA), deoxycholic acid (DCA), chenodeoxycholic acid (CDCA), litocholic acid (LCA) and usodeoxycholic acid (UDCA) were prepared and used to optimize chromatographic parameters using hyodeoxycholic acid (HDCA) as internal standard. After optimizing the esterification (type of catalyst, temperature and time) and silylation (type and amount of reagent, temperature and time) the optimised method was validated. Intraday and interday precision and accuracy of calibration points was assessed as well as the limit of detection (LOD) and limit of quantification (LOQ). Similarly, precision and accuracy were determined for freeze dried stool samples and dried faecal water. Results: Baseline separation of the 5 BAs and internal standard was achieved on an apolar Rxi-1MS column with split injection (split flow 0.25 ml/min) using a He-flow of 1.5 ml/min. Esterification was optimal using HCl 12N as catalyst and heating for 2 h at 60°C whereas the best conditions for silylation were 100 μl of HMDS+TMCS+Pyridine (3:1:9) and heating for 30 min at 55°C. The intraday and interday precision and accuracy was evaluated for each BA and concentration. LOD was 0.05 μg and LOQ was 0.1 μg for most BAs. However, for faecal samples, precision and accuracy were low, despite an additional sonication step and reflux in ethanol to improve the solubilisation of the BAs. Conclusions: Although the performance of the developed method was satisfying for BA standard solutions, its application to faecal samples needs further optimization of the clean-up of the samples prior to derivatisation.Background: Cerca de 5% dos ácidos biliares escapa à recirculação enterohepática no íleo terminal e entra no intestino grosso onde eles são posteriormente metabolizados pelo microbioma colónico e finalmente excretado nas fezes. A quantidade e composição dos ácidos biliares fecais tem sido associada a vários estados de doenças. Objetivo: desenvolver um método baseado em cromatografia gasosa — espectrometria de massa que permita a quantificação de ácidos biliares em amostras fecais e validar este mesmo método. Métodos: Os ácidos biliares foram esterificados e sililados para aumentar a sua volatilidade. Soluções padrão de ácido cólico, ácido desoxicólico, ácido quenodesoxicólico, ácido litocólico, ácido ursodesoxicólico foram preparadas e usadas para otimizar parâmetros cromatográficos, usando o ácido hiodesoxicólico como padrão interno. Após a otimização da esterificação (tipo de catalisador, temperatura e tempo) e sililação (tipo e quantidade de reagente, temperatura e tempo), o método otimizado foi validado. A precisão intra-dia e inter-dia e a exatidão dos pontos de calibração foram avaliadas bem como o limite de deteção e o limite de quantificação. Semelhantemente, a precisão e exatidão foram determinadas para amostras de fezes liofilizadas e para água fecal liofilizada. Resultados: A separação da linha de base dos 5 ácidos biliares e do padrão interno foi atingida com a coluna apolar Rxi-1MS com injeção em modo split (fluxo do split 0.25 ml/min) usado com fluxo de He a 1.5 ml/min. A esterificação foi ótima usando HCl 12N como catalisador a uma temperatura de 60°C, durante 2 h, enquanto que as melhores condições para a sililação foram 100 μl de HMDS+TMCS+Pyridine (3:1:9) a uma temperatura de 55°C, durante 30 min. A precisão, intra- e inter-dia, e a exatidão foram avaliadas para cada ácido biliar e cada concentração. O limite de deteção foi 0.05 μg e o limite de quantificação foi 0.1 μg para a maioria dos ácidos biliares. Contudo, para as amostras fecais, a precisão e exatidão foram baixas, apesar do passo adicional da sonicação e refluxo em etanol para melhorar a solubilização dos ácidos biliares. Conclusões: Apesar do desempenho do método desenvolvido ter sido satisfeito para as soluções padrão dos ácidos biliares, a aplicação para as amostras fecais necessita posteriormente de uma otimização na limpeza das amostras antes da derivatização.Verbeke, KristinHenriques, MarianaUniversidade do MinhoAraújo, Ana Margarida Carneiro20162016-01-01T00:00:00Zinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/1822/47101eng201561263info:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)instname:Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informaçãoinstacron:RCAAP2023-07-21T12:20:38Zoai:repositorium.sdum.uminho.pt:1822/47101Portal AgregadorONGhttps://www.rcaap.pt/oai/openaireopendoar:71602024-03-19T19:13:49.500724Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) - Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informaçãofalse
dc.title.none.fl_str_mv Development and validation of a GC-MS based method to analyse faecal bile acids
title Development and validation of a GC-MS based method to analyse faecal bile acids
spellingShingle Development and validation of a GC-MS based method to analyse faecal bile acids
Araújo, Ana Margarida Carneiro
Engenharia e Tecnologia::Outras Engenharias e Tecnologias
title_short Development and validation of a GC-MS based method to analyse faecal bile acids
title_full Development and validation of a GC-MS based method to analyse faecal bile acids
title_fullStr Development and validation of a GC-MS based method to analyse faecal bile acids
title_full_unstemmed Development and validation of a GC-MS based method to analyse faecal bile acids
title_sort Development and validation of a GC-MS based method to analyse faecal bile acids
author Araújo, Ana Margarida Carneiro
author_facet Araújo, Ana Margarida Carneiro
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Verbeke, Kristin
Henriques, Mariana
Universidade do Minho
dc.contributor.author.fl_str_mv Araújo, Ana Margarida Carneiro
dc.subject.por.fl_str_mv Engenharia e Tecnologia::Outras Engenharias e Tecnologias
topic Engenharia e Tecnologia::Outras Engenharias e Tecnologias
description Dissertação de mestrado em Biomedical Engineering (área de especialização em Clinical Engineering)
publishDate 2016
dc.date.none.fl_str_mv 2016
2016-01-01T00:00:00Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://hdl.handle.net/1822/47101
url http://hdl.handle.net/1822/47101
dc.language.iso.fl_str_mv eng
language eng
dc.relation.none.fl_str_mv 201561263
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)
instname:Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informação
instacron:RCAAP
instname_str Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informação
instacron_str RCAAP
institution RCAAP
reponame_str Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)
collection Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)
repository.name.fl_str_mv Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) - Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informação
repository.mail.fl_str_mv
_version_ 1799132578326773760