Caraterização de genes de resistência a antibióticos em isolados de Enterobacteriaceae provenientes de suiniculturas de produção intensiva e extensiva de Portugal
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| Data de Publicação: | 2015 |
| Tipo de documento: | Dissertação |
| Idioma: | por |
| Título da fonte: | Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) |
| Texto Completo: | http://hdl.handle.net/10284/5311 |
Resumo: | Projeto de Pós-Graduação/Dissertação apresentado à Universidade Fernando Pessoa como parte dos requisitos para obtenção do grau de Mestre em Ciências Farmacêuticas |
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Caraterização de genes de resistência a antibióticos em isolados de Enterobacteriaceae provenientes de suiniculturas de produção intensiva e extensiva de PortugalProjeto de Pós-Graduação/Dissertação apresentado à Universidade Fernando Pessoa como parte dos requisitos para obtenção do grau de Mestre em Ciências FarmacêuticasA família Enterobacteriaceae constitui a causa de inúmeras infeções em animais e no Homem, cujo tratamento com antibióticos de uma forma exacerbada tem conduzido à emergência e disseminação de genes de resistência, o que tem sido reconhecido como um grave problema de saúde pública. Consequentemente, torna-se imprescindível uma vigilância epidemiológica deste problema, sendo muito útil incluir nos programas de monitorização bactérias indicadoras, como Escherichia coli, provenientes de vários nichos. A emergência de bactérias multirresistentes no Homem devido ao elevado consumo de antibióticos em animais de produção tem sido sugerida em vários estudos. A microflora bacteriana intestinal dos animais constitui um ambiente favorável para a sobrevivência e transferência de bactérias resistentes a antibióticos. Tendo em conta a escassa informação em Portugal sobre a resistência a antibióticos neste nicho, pretende-se com este trabalho de investigação analisar a ocorrência e distribuição de genes de resistência a antibióticos e a presença de clones epidémicos e virulentos entre os isolados de E. coli provenientes de amostras de suiniculturas de produção intensiva e de produção extensiva. Foram incluídos para análise 210 isolados de E. coli previamente identificados e analisados quanto à suscetibilidade a antibióticos e aos grupos filogenéticos em trabalhos de investigação anteriores. Estes isolados foram obtidos de amostras de cinco suiniculturas de produção intensiva e uma suinicultura de produção extensiva de Portugal Continental (2006-2007). A identificação de genes que codificam resistência para as sulfonamidas (sul1, sul2, sul3), tetraciclinas (tetA, tetB e tetG), aminoglicosídeos (armA e rmtB), quinolonas (qnrA, qnrB, qnrC, qnrD, qnrS, qepA, oqxA e oqxB) ou a ambos estes últimos [aac(6’)-Ib-cr], foi efetuada por PCR e sequenciação. Dos 191 isolados correspondentes às cinco suiniculturas de produção intensiva analisadas, 37,7% (72/191) apresentaram o gene tetA e 28,3% (54/191) o gene tetB. O gene tetG não foi detetado em nenhum isolado. Quanto à ocorrência de genes sul, foi de 16,8% (32/191) para sul1, de 34,0% (65/191) para sul2 e de 42,4% (81/191) para sul3. No que diz respeito à resistência a quinolonas mediada por plasmídeos (PMQR), o gene qnrS1 foi detetado em 5,8% (11/191) dos isolados, sendo que a ocorrência foi menor para os restantes genes detectados codificando para as proteínas Qnr (qnrB: 3,1%; qnrC: 0,5% e qnrD: 0,5%) e para oqxA e oqxB (0,5%, 1/191 para ambos), sendo nula para os genes qnrA, aac(6´)-Ib-cr e qepA. Em relação aos 19 isolados provenientes da suinicultura de produção extensiva, apenas se detetaram genes que codificam para PMQR em 6 isolados, correspondendo ao gene qnrD (31,6%). No que se refere a genes de resistência à tetraciclina, detetaram-se os genes tetA (5,3%, 1/19) e tetB (21,1%, 4/19). Os restantes genes de resistência pesquisados não foram detetados. A presença de clones epidémicos e virulentos, internacionalmente disseminados, foi também pesquisada entre os isolados previamente identificados como pertencentes ao grupo filogenético B2 (2,9%, 6/21) ou D (9,4%, 20/210). O clone B2-ST131 foi detetado em dois isolados provenientes de uma suinicultura de produção intensiva, correspondendo a isolados contendo os genes tetA e qnrS1. O clone D-ST393 foi identificado em três isolados, os quais demonstraram possuir os genes sul3, tetA e tetB. Os restantes clones pesquisados (ST69, ST95 e ST405) não foram detetados. Os dados obtidos neste estudo permitem concluir que as suiniculturas portuguesas constituem um reservatório e um veículo de disseminação de E. coli albergando múltiplos genes de resistência a antibióticos, nomeadamente à tetraciclina (tet), sulfonamidas (sul) e, menos frequentemente, às quinolonas (qnr e oqx). Estas bactérias, através do meio ambiente, da cadeia alimentar (por exemplo, nos géneros alimentícios) e/ou do contato direto entre o Homem e animais ou ambiente de produção animal, podem ser transmitidas ao Homem e colonizar o seu intestino, contribuindo desta forma para a disseminação da resistência aos antibióticos entre bactérias comensais e patogénicas (DEPI, 2015). Neste estudo, a taxa de resistência a antibióticos observada foi mais prevalente na maternidade e na sala de engorda em ambiente de produção suinícola. Para além da necessidade em detetar precocemente a emergência e disseminação de genes de resistência em diferentes nichos e espécies bacterianas, o estabelecimento de políticas de uso prudente de antibióticos em animais de produção e humanos será útil para a definição de estratégias que ajudem a prevenir os riscos para a saúde pública.The Enterobacteriaceae family is the cause of numerous infections in animals and humans. Thus, the treatment performed using antibiotics in an enhanced form, has led to the emergence and spread of resistance genes, which has been recognized by the scientific community, as a serious problem of public health. Consequently, epidemiological surveillance of this problem it is essential and very useful to include the monitoring programs indicator bacteria, such as Escherichia coli, from various niches. The emergence of multi-resistant bacteria in humans due to the high consumption of antibiotics in farm animals has been suggested in several studies. The intestinal microflora in animals is a favorable environment for survival the antibiotic-resistant bacteria. Given the limited information in Portugal about antibiotic resistance in this niche, it is intended with this research work, to analyze the occurrence and distribution of antibiotic resistant genes and the presence of epidemic and virulent clones among the strains E. coli samples from pig farms of intensive and extensive production. They were included in the analysis 210 E. coli strains, previously identified and analyzed in earlier research the susceptibility to antibiotics and phylogenetic groups. Between April 2006 and May 2007, these isolates were obtained from 54 samples of five pig farms of intensive production and 9 samples of extensive production in Portugal. The identification of genes which encode resistance to sulphonamides (sul1, sul2, sul3), tetracyclines (tetA, tetB e tetG), aminoglycosides (armA e rmtB), quinolones (qnrA, qnrB, qnrC, qnrD, qnrS, qepA, oqxA and oqxB) or both (aac(6')-Ib-cr), was performed by PCR and sequencing. Of the 191 isolates corresponding to the five intensive production of pig farms analyzed, 37,7% (72/191) had the tetA gene and 28,3% (54/191) the tetB gene. The tetG gene was not detected. For the occurrence of sul genes, it was 16,8% (32/191) for sul1, 34,0% (65/191) for sul2 and 42,4% (81/191) for sul3. The resistance to quinolones mediated plasmids (PMQR), the qnrS1 gene was detected in 5,8% (11/191) isolates, and the occurrence was lower for the remaining genes encoding the Qnr proteins (qnrB: 3,1%; qnrC: 0,5% and qnrD: 0,5%) and for oqxAB genes (0,5%, 1/191 for both). The genes aac(6´)-Ib-cr and qepA were not detected. Regarding the 19 isolates from the extensive production, only 6 isolates encoding PMQR were detected (qnrD: 31,6%). The resistance genes detected to tetracycline were tetA (5,3%, 1/19) and tetB (21,1%, 4/19). The remaining resistance genes studied were not detected. The presence of epidemic and international clones was also studied among the isolates previously identified as belonging to the phylogenetic group B2 (n=2) or D (n=11). The B2-ST131 clone was detected in two isolates from intensive production, corresponding to isolates containing the tetA and qnrS1 genes. The D-ST393 clone was identified in three E. coli strains, which proved to have sul3, tetB and tetA genes. The remaining clones screened (ST69, ST95 and ST405) were not detected. The data obtained in this study allow us to conclude that the Portuguese pig farms constitute a reservoir and spread of E. coli vehicle harboring multiple antibiotic resistance genes, including the tetracycline (tet), sulfonamides (sul) and, less often, to quinolones (qnr and oqx). These bacteria through the environment, the food chain (for example, in foodstuffs) and/or direct contact between humans and animals or animal production environment, can be transmitted to humans and colonize the intestine, thus contributing to the spread of antibiotic resistance between commensal and pathogenic bacteria (DEPI, 2015). In this study, antibiotic resistance observed rate was more prevalent in the maternity and fattening room in pig production environment. Apart from the need for early detect the emergence and spread of resistance genes in different niches and bacterial species, the establishment policies of prudent use of antibiotics in production animals and humans will be helpful in developing strategies to help prevent risks to public health.[s.n.]Machado, ElisabeteRepositório Institucional da Universidade Fernando PessoaCarvalhais, Alexandra Raquel Morais da Costa2017-11-13T01:30:09Z2015-01-01T00:00:00Z2015-01-01T00:00:00Zinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/10284/5311201620162porinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)instname:Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informaçãoinstacron:RCAAP2022-09-06T02:04:39Zoai:bdigital.ufp.pt:10284/5311Portal AgregadorONGhttps://www.rcaap.pt/oai/openaireopendoar:71602024-03-19T15:42:10.882040Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) - Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informaçãofalse |
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