HABIT - a webserver for interactive T cell neoepitope discovery

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Martins, Joana
Data de Publicação: 2019
Outros Autores: Magalhães, Carlos, Vieira, Vítor, Rocha, Miguel, Osório, Nuno S.
Tipo de documento: Artigo
Idioma: eng
Título da fonte: Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)
Texto Completo: https://hdl.handle.net/1822/80292
Resumo: bioRxiv - the Preprint Server for Biology.
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spelling HABIT - a webserver for interactive T cell neoepitope discoveryCiências Médicas::Ciências da SaúdeSaúde de qualidadebioRxiv - the Preprint Server for Biology.Neoepitopes generated by amino acid variants specifically found in pathogens or cancer cells are gaining momentum in immunotherapy development. HABIT (HLA Binding InTelligence) is a web platform designed to generate and analyse machine learning-based T cell epitope predictions for improved neoepitope discovery. Availability and Implementation: HABIT is available at http://habit.evobiomed.com . Peptide-HLA binding predictions by NetMHCpan 4.0 and NetMHCIIpan 3.1 were implemented in a web application for interactive data exploration using shiny package powered by RStudio.info:eu-repo/semantics/publishedVersionCold Spring Harbor LaboratoryUniversidade do MinhoMartins, JoanaMagalhães, CarlosVieira, VítorRocha, MiguelOsório, Nuno S.2019-03-082019-03-08T00:00:00Zinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/articleapplication/pdfhttps://hdl.handle.net/1822/80292engMartins, Joana; Magalhães, Carlos; Vieira, Vítor; Rocha, Miguel; Osório, Nuno S, HABIT - a webserver for interactive T cell neoepitope discovery. bioRxiv - the Preprint Server for Biology. Cold Spring Harbor Laboratory, 2019.10.1101/535716https://www.biorxiv.org/info:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)instname:Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informaçãoinstacron:RCAAP2023-07-21T12:14:49Zoai:repositorium.sdum.uminho.pt:1822/80292Portal AgregadorONGhttps://www.rcaap.pt/oai/openaireopendoar:71602024-03-19T19:07:10.406117Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) - Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informaçãofalse
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