miR-371a-3p as a tool for subtyping Testicular Germ Cell Tumors

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Salgueiro, Bárbara Denise Vilela
Data de Publicação: 2018
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: eng
Título da fonte: Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)
Texto Completo: http://hdl.handle.net/10348/8367
Resumo: Os tumores de células germinativas testiculares (TGCTs) constituem um grupo heterogéneo de neoplasmas, afetando na maioria homens em idade jovem. As taxas de cura são elevadas e o tratamento adequado depende de uma avaliação clínica e patológica que seja cuidadosa e precisa. De fato, a subtipagem histopatológica dos TGCTs é um ponto crítico para uma decisão terapêutica adequada. Considerando a limitação dos biomarcadores de soro atualmente disponíveis, foram propostos novos candidatos, principalmente o miR-371a-3p, que superou os marcadores de soro clássicos, contudo não existe informação detalhada relativamente ao perfil de expressão nos vários subtipos de TGCTs. Deste modo, avaliamos os níveis dos níveis de expressão do miR-371a-3p nos vários subtipos de TGCT usando uma coorte consecutiva de amostras de tecido testicular. Após o isolamento do RNA e síntese de cDNA, os níveis de expressão do miR-371a-3p foram avaliados em 154 amostras de tecido de TGCT e em 15 tecidos não-tumorais por PCR quantitativo em tempo real (RT-qPCR). A fim de gerar uma curva padrão para a quantificação relativa e verificar a eficiência do PCR, o cDNA do RNA total de referência humano (Agilent, EUA) foi utilizado e, para a normalização, o RNU48 foi utilizado como um gene de referência. O miR-371a-3p discriminou tecidos tumorais de tecidos controlo com alta sensibilidade e especificidade (AUC = 0,99). Além disso, os seminomas apresentaram níveis mais elevados de expressão do miR-371a-3p em comparação com amostras de TGCT não-seminomatoso, revelando também diferenças significativas entre eles. Contudo, os TGCTs pré-púberes apresentaram níveis mais baixos de expressão do miR-371a-3p do que TGCTs pós-púberes. Globalmente, os níveis de expressão do miR-371a-3p diminuíram em paralelo com a diferenciação celular progressiva. Concluímos que o miR-371a-3p é específico para TGCT e pode ser clinicamente útil para a deteção precoce e monitorização desta doença oncológica.
id RCAP_96c007f97eacc242316b3215719c5ef7
oai_identifier_str oai:repositorio.utad.pt:10348/8367
network_acronym_str RCAP
network_name_str Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)
repository_id_str 7160
spelling miR-371a-3p as a tool for subtyping Testicular Germ Cell TumorsTumores de células germinativas testicularesmicroRNAsbiomarcadoresmiR-371a-3ppós-púberespré-púberesOs tumores de células germinativas testiculares (TGCTs) constituem um grupo heterogéneo de neoplasmas, afetando na maioria homens em idade jovem. As taxas de cura são elevadas e o tratamento adequado depende de uma avaliação clínica e patológica que seja cuidadosa e precisa. De fato, a subtipagem histopatológica dos TGCTs é um ponto crítico para uma decisão terapêutica adequada. Considerando a limitação dos biomarcadores de soro atualmente disponíveis, foram propostos novos candidatos, principalmente o miR-371a-3p, que superou os marcadores de soro clássicos, contudo não existe informação detalhada relativamente ao perfil de expressão nos vários subtipos de TGCTs. Deste modo, avaliamos os níveis dos níveis de expressão do miR-371a-3p nos vários subtipos de TGCT usando uma coorte consecutiva de amostras de tecido testicular. Após o isolamento do RNA e síntese de cDNA, os níveis de expressão do miR-371a-3p foram avaliados em 154 amostras de tecido de TGCT e em 15 tecidos não-tumorais por PCR quantitativo em tempo real (RT-qPCR). A fim de gerar uma curva padrão para a quantificação relativa e verificar a eficiência do PCR, o cDNA do RNA total de referência humano (Agilent, EUA) foi utilizado e, para a normalização, o RNU48 foi utilizado como um gene de referência. O miR-371a-3p discriminou tecidos tumorais de tecidos controlo com alta sensibilidade e especificidade (AUC = 0,99). Além disso, os seminomas apresentaram níveis mais elevados de expressão do miR-371a-3p em comparação com amostras de TGCT não-seminomatoso, revelando também diferenças significativas entre eles. Contudo, os TGCTs pré-púberes apresentaram níveis mais baixos de expressão do miR-371a-3p do que TGCTs pós-púberes. Globalmente, os níveis de expressão do miR-371a-3p diminuíram em paralelo com a diferenciação celular progressiva. Concluímos que o miR-371a-3p é específico para TGCT e pode ser clinicamente útil para a deteção precoce e monitorização desta doença oncológica.Testicular germ cell tumors (TGCT) are heterogeneous group of neoplasms, mostly affecting young men. Curability rates are high and adequate treatment relies in careful and accurate pathological and clinical assessment. Indeed, TGCT histopathological subtyping is critical for adequate therapeutic decision. Considering limitation of currently available serum biomarkers, novel candidates have been proposed, most notably miR-371a-3p, which outperformed classical serum markers, but no detailed information concerning TGCT subtype was available. Thus, we carried out evaluation of miR-371a-3p expression levels among TGCT subtypes using a consecutive cohort of tissue samples. After RNA isolation and cDNA synthesis, miR-371a-3p expression levels were measured in 154 tissue samples of TGCT and in 15 non-tumoral tissues by real-time quantitative PCR (RT-qPCR). To allowed generation of a standard curve for relative quantification and ascertain PCR efficiency cDNA from total Human Reference RNA (Agilent, USA) was used and for normalization RNU48 was used as a reference gene. MiR-371a-3p discriminated TGCT from control tissues with high sensitivity and specificity (AUC=0.99). Furthermore, seminomas displayed higher miR-371a-3p expression levels compared to nonseminomatous TGCT, which also disclosed significant differences among them. Nonetheless, prepubertal TGCT depicted lower miR-371a-3p expression levels than postpubertal TGCT. Globally, miR-371a-3p expression levels decreased in parallel with progressive cell differentiation. We concluded that miR-371a-3p is TGCT-specific and it might be clinically useful for early detection and disease monitoring.2018-04-04T16:05:29Z2018-01-02T00:00:00Z2018-01-02info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/10348/8367TID:202324087engSalgueiro, Bárbara Denise Vilelainfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)instname:Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informaçãoinstacron:RCAAP2024-02-02T12:47:06Zoai:repositorio.utad.pt:10348/8367Portal AgregadorONGhttps://www.rcaap.pt/oai/openaireopendoar:71602024-03-20T02:04:21.684157Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) - Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informaçãofalse
dc.title.none.fl_str_mv miR-371a-3p as a tool for subtyping Testicular Germ Cell Tumors
title miR-371a-3p as a tool for subtyping Testicular Germ Cell Tumors
spellingShingle miR-371a-3p as a tool for subtyping Testicular Germ Cell Tumors
Salgueiro, Bárbara Denise Vilela
Tumores de células germinativas testiculares
microRNAs
biomarcadores
miR-371a-3p
pós-púberes
pré-púberes
title_short miR-371a-3p as a tool for subtyping Testicular Germ Cell Tumors
title_full miR-371a-3p as a tool for subtyping Testicular Germ Cell Tumors
title_fullStr miR-371a-3p as a tool for subtyping Testicular Germ Cell Tumors
title_full_unstemmed miR-371a-3p as a tool for subtyping Testicular Germ Cell Tumors
title_sort miR-371a-3p as a tool for subtyping Testicular Germ Cell Tumors
author Salgueiro, Bárbara Denise Vilela
author_facet Salgueiro, Bárbara Denise Vilela
author_role author
dc.contributor.author.fl_str_mv Salgueiro, Bárbara Denise Vilela
dc.subject.por.fl_str_mv Tumores de células germinativas testiculares
microRNAs
biomarcadores
miR-371a-3p
pós-púberes
pré-púberes
topic Tumores de células germinativas testiculares
microRNAs
biomarcadores
miR-371a-3p
pós-púberes
pré-púberes
description Os tumores de células germinativas testiculares (TGCTs) constituem um grupo heterogéneo de neoplasmas, afetando na maioria homens em idade jovem. As taxas de cura são elevadas e o tratamento adequado depende de uma avaliação clínica e patológica que seja cuidadosa e precisa. De fato, a subtipagem histopatológica dos TGCTs é um ponto crítico para uma decisão terapêutica adequada. Considerando a limitação dos biomarcadores de soro atualmente disponíveis, foram propostos novos candidatos, principalmente o miR-371a-3p, que superou os marcadores de soro clássicos, contudo não existe informação detalhada relativamente ao perfil de expressão nos vários subtipos de TGCTs. Deste modo, avaliamos os níveis dos níveis de expressão do miR-371a-3p nos vários subtipos de TGCT usando uma coorte consecutiva de amostras de tecido testicular. Após o isolamento do RNA e síntese de cDNA, os níveis de expressão do miR-371a-3p foram avaliados em 154 amostras de tecido de TGCT e em 15 tecidos não-tumorais por PCR quantitativo em tempo real (RT-qPCR). A fim de gerar uma curva padrão para a quantificação relativa e verificar a eficiência do PCR, o cDNA do RNA total de referência humano (Agilent, EUA) foi utilizado e, para a normalização, o RNU48 foi utilizado como um gene de referência. O miR-371a-3p discriminou tecidos tumorais de tecidos controlo com alta sensibilidade e especificidade (AUC = 0,99). Além disso, os seminomas apresentaram níveis mais elevados de expressão do miR-371a-3p em comparação com amostras de TGCT não-seminomatoso, revelando também diferenças significativas entre eles. Contudo, os TGCTs pré-púberes apresentaram níveis mais baixos de expressão do miR-371a-3p do que TGCTs pós-púberes. Globalmente, os níveis de expressão do miR-371a-3p diminuíram em paralelo com a diferenciação celular progressiva. Concluímos que o miR-371a-3p é específico para TGCT e pode ser clinicamente útil para a deteção precoce e monitorização desta doença oncológica.
publishDate 2018
dc.date.none.fl_str_mv 2018-04-04T16:05:29Z
2018-01-02T00:00:00Z
2018-01-02
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://hdl.handle.net/10348/8367
TID:202324087
url http://hdl.handle.net/10348/8367
identifier_str_mv TID:202324087
dc.language.iso.fl_str_mv eng
language eng
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)
instname:Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informação
instacron:RCAAP
instname_str Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informação
instacron_str RCAAP
institution RCAAP
reponame_str Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)
collection Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)
repository.name.fl_str_mv Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) - Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informação
repository.mail.fl_str_mv
_version_ 1799137129378349056