Evaluation of the diversity of deep-water sponges of the Selvagens Islands through DNA barcoding.
Autor(a) principal: | |
---|---|
Data de Publicação: | 2021 |
Tipo de documento: | Dissertação |
Idioma: | eng |
Título da fonte: | Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) |
Texto Completo: | http://hdl.handle.net/10400.12/8546 |
Resumo: | Dissertação de Mestrado apresentada no ISPA – Instituto Universitário para obtenção de grau de Mestre na especialidade de Biologia Marinha e Conservação. |
id |
RCAP_a76a36fa9b31bdc134ed7cd31a216555 |
---|---|
oai_identifier_str |
oai:repositorio.ispa.pt:10400.12/8546 |
network_acronym_str |
RCAP |
network_name_str |
Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) |
repository_id_str |
7160 |
spelling |
Evaluation of the diversity of deep-water sponges of the Selvagens Islands through DNA barcoding.Avaliação da Diversidade de esponjas de mar profundo das Ilhas Selvagens através de DNA barcodingPoriferaDemospongiaeBarcodeFilogeniaMar profundoPhylogenyDeep SeaDomínio/Área Científica::Ciências Naturais::Ciências BiológicasDissertação de Mestrado apresentada no ISPA – Instituto Universitário para obtenção de grau de Mestre na especialidade de Biologia Marinha e Conservação.Sponges (Phylum Porifera) are grouped into four classes with Demospongiae being the largest and most diverse. The habitats composed of deep-sea sponges are considered biodiversity hotspots, being part of the benthic communities where they play a very important role in the ecosystem. These are, however, considered vulnerable marine ecosystems (VMEs) of conservation priority. This study aimed to identify, by means of DNA barcoding, deep-sea sponges collected in an understudied area of the Northeast Atlantic, Selvagens Islands. Eighteen specimens collected in the EMEPC/M@rBis/Selvagens2010 campaign were analyzed. Of these, eight specimens were identified and assigned to five genera - Axinella, Topsentia, Characella, Petrosia and Calyx - representing five families (Axinellidae, Halichondriidae, Pachastrellidae, Petrosiidae, Phloeodictyidae) on the basis of their COI mtDNA and 28S rRNA barcodes. We further discuss the phylogenetic and biogeographic affinities of the identified taxa in light of the sponge fauna of the Northeast Atlantic and Mediterranean. The data generated will be further complemented with morphological characterization to allow accurate species-level identifications. This integrative approach is fundamental to understand the diversity and distribution of deep-sea species and contribute to their conservation.As esponjas (Filo Porifera) estão agrupadas em quatro classes, sendo a Demospongiae a maior e mais diversificada. Os habitats compostos por esponjas de profundidade são considerados hotspots de biodiversidade, sendo parte das comunidades bentónicas onde desempenham um papel muito importante no ecossistema. Estes são, no entanto, considerados ecossistemas marinhos vulneráveis (VMEs) de prioridade de conservação. O objetivo neste trabalho foi identificar, através de códigos de barras de ADN, esponjas de profundidade recolhidas numa área sub estudada do Atlântico Nordeste, as Ilhas Selvagens. Foram analisados dezoito espécimes recolhidos na campanha EMEPC/M@rBis/Selvagens2010. Destes, oito espécimes foram identificados e atribuídos a cinco géneros - Axinella, Topsentia, Characella, Petrosia e Calyx - representando cinco famílias (Axinellidae, Halichondriidae, Pachastrellidae, Petrosiidae, Phloeodictyidae) com base nos seus códigos de barras COI mtDNA e 28S rRNA. Discutimos ainda as afinidades filogenéticas e biogeográficas dos taxa identificados, à luz da fauna de esponjas do Atlântico Nordeste e do Mediterrâneo. Os dados gerados serão ainda complementados com a caracterização morfológica para permitir identificações precisas ao nível das espécies. Esta abordagem integrativa é fundamental para compreender a diversidade e distribuição das espécies de águas profundas e contribuir para a sua conservação.Repositório do ISPARodriguez, Karen Avellaneda2023-11-16T01:30:16Z2021-12-132021-12-13T00:00:00Zinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/10400.12/8546TID:202893804enginfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)instname:Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informaçãoinstacron:RCAAP2023-11-19T02:15:21Zoai:repositorio.ispa.pt:10400.12/8546Portal AgregadorONGhttps://www.rcaap.pt/oai/openaireopendoar:71602024-03-19T15:26:22.987478Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) - Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informaçãofalse |
dc.title.none.fl_str_mv |
Evaluation of the diversity of deep-water sponges of the Selvagens Islands through DNA barcoding. Avaliação da Diversidade de esponjas de mar profundo das Ilhas Selvagens através de DNA barcoding |
title |
Evaluation of the diversity of deep-water sponges of the Selvagens Islands through DNA barcoding. |
spellingShingle |
Evaluation of the diversity of deep-water sponges of the Selvagens Islands through DNA barcoding. Rodriguez, Karen Avellaneda Porifera Demospongiae Barcode Filogenia Mar profundo Phylogeny Deep Sea Domínio/Área Científica::Ciências Naturais::Ciências Biológicas |
title_short |
Evaluation of the diversity of deep-water sponges of the Selvagens Islands through DNA barcoding. |
title_full |
Evaluation of the diversity of deep-water sponges of the Selvagens Islands through DNA barcoding. |
title_fullStr |
Evaluation of the diversity of deep-water sponges of the Selvagens Islands through DNA barcoding. |
title_full_unstemmed |
Evaluation of the diversity of deep-water sponges of the Selvagens Islands through DNA barcoding. |
title_sort |
Evaluation of the diversity of deep-water sponges of the Selvagens Islands through DNA barcoding. |
author |
Rodriguez, Karen Avellaneda |
author_facet |
Rodriguez, Karen Avellaneda |
author_role |
author |
dc.contributor.none.fl_str_mv |
Repositório do ISPA |
dc.contributor.author.fl_str_mv |
Rodriguez, Karen Avellaneda |
dc.subject.por.fl_str_mv |
Porifera Demospongiae Barcode Filogenia Mar profundo Phylogeny Deep Sea Domínio/Área Científica::Ciências Naturais::Ciências Biológicas |
topic |
Porifera Demospongiae Barcode Filogenia Mar profundo Phylogeny Deep Sea Domínio/Área Científica::Ciências Naturais::Ciências Biológicas |
description |
Dissertação de Mestrado apresentada no ISPA – Instituto Universitário para obtenção de grau de Mestre na especialidade de Biologia Marinha e Conservação. |
publishDate |
2021 |
dc.date.none.fl_str_mv |
2021-12-13 2021-12-13T00:00:00Z 2023-11-16T01:30:16Z |
dc.type.status.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/publishedVersion |
dc.type.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/masterThesis |
format |
masterThesis |
status_str |
publishedVersion |
dc.identifier.uri.fl_str_mv |
http://hdl.handle.net/10400.12/8546 TID:202893804 |
url |
http://hdl.handle.net/10400.12/8546 |
identifier_str_mv |
TID:202893804 |
dc.language.iso.fl_str_mv |
eng |
language |
eng |
dc.rights.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/openAccess |
eu_rights_str_mv |
openAccess |
dc.format.none.fl_str_mv |
application/pdf |
dc.source.none.fl_str_mv |
reponame:Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) instname:Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informação instacron:RCAAP |
instname_str |
Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informação |
instacron_str |
RCAAP |
institution |
RCAAP |
reponame_str |
Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) |
collection |
Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) |
repository.name.fl_str_mv |
Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) - Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informação |
repository.mail.fl_str_mv |
|
_version_ |
1799130126355529728 |