Deteção de bactérias patogénicas em aquacultura por métodos moleculares

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Ferreira, José Maria Monteiro
Data de Publicação: 2023
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)
Texto Completo: http://hdl.handle.net/10400.5/27088
Resumo: Dissertação de Mestrado Integrado em Medicina Veterinária, na área científica de Produção Animal e Segurança Alimentar
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Este crescimento tem como possíveis entraves maiores densidades das espécies produzidas, alterações climáticas, doenças emergentes e o aumento das resistências aos antibióticos por parte das bactérias patogénicas, o que pode levar ao aumento do impacto económico negativo das doenças provocadas por bactérias. Deste modo, é importante aumentar o conhecimento sobre as espécies de bactérias patogénicas ou oportunistas, para uma melhor prevenção e maior rapidez e eficácia do tratamento. Para que tal aconteça são necessários protocolos de identificação de bactérias baseados em métodos mais rápidos e sensíveis que as técnicas convencionais. Consequentemente, é necessário fazer adaptações desses mesmos protocolos para que possam ser viáveis para a indústria. Este trabalho abrange a otimização de métodos de deteção, baseados em ferramentas moleculares para duas subespécies de Photobacterium damselae, Vibrio anguillarum e Aeromonas salmonicida, comparando os protocolos de identificação bioquímicos correntemente utilizados com a ferramenta PCR desenvolvida. Foram avaliadas as suas potencialidades em identificações independentes da propagação de bactérias em cultura e a possibilidade da sua utilização em amostragens não letais, de modo a diminuir o tempo de resposta a surtos causados por estas bactérias. Com isto, foi validado e implementado, com sucesso, um protocolo para a identificação de Photobacterium damselae subesp. piscicida e Vibrio anguillarum através de reações PCR, com ou sem a necessidade de crescimento bacteriano em culturaABSTRACT - Detection of pathogenic bacteria in aquaculture by molecular techniques - In the last decades, aquaculture has become the fastest growing food sector, in parallel with this, capture fishery rates have stayed relatively the same for the last 30 years. With the growing fish consumption all over the globe, the sector has reached growing importance in the food security outlook. These advances do not occur without potential obstacles such as the rise of antimicrobial resistance, higher densities of the cultivated species, climate change, and the increased likelihood of emerging diseases. Consequently, this may lead to a greater economic impact caused by bacterial diseases. Thus, it is important to increase knowledge about the species of pathogenic and opportunistic bacteria, for better prevention and greater speed and effectiveness of treatment. For this to happen, bacteria identification protocols based on faster and more sensitive methods than conventional techniques are needed. Hence, there's the need to apply changes and adjustments to these same protocols in order to be viable for the industry. This work covers the two subspecies of Photobacterium damselae, Vibrio anguillarum, and Aeromonas salmonicida, comparing the protocols currently used with the PCR tool developed. Culture-independent methods and possible non-lethal techniques to decrease outbreak response time were also evaluated. With this, a protocol was successfully validated and implemented for the identification of Photobacterium damselae piscicida and Vibrio anguillarum through PCR reactions, with or without the need for bacterial growth in cultureUniversidade de Lisboa, Faculdade de Medicina VeterináriaSoares, Florbela Maria BenjamimAfonso, Fernando Ribeiro AlvesRepositório da Universidade de LisboaFerreira, José Maria Monteiro2023-01-27T23:12:37Z2023-01-182023-01-18T00:00:00Zinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/10400.5/27088TID:203299825porFerreira JMM. 2023. Deteção de bactérias patogénicas em aquacultura por métodos moleculares [dissertação de mestrado]. Lisboa: FMV-Universidade de Lisboainfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)instname:Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informaçãoinstacron:RCAAP2024-11-20T18:34:40Zoai:repositorio.ul.pt:10400.5/27088Portal AgregadorONGhttps://www.rcaap.pt/oai/openairemluisa.alvim@gmail.comopendoar:71602024-11-20T18:34:40Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) - Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informaçãofalse
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