A influência da hidroxiureia no microbioma intestinal em doentes com anemia das células falciformes

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Fernandes, Maria Carolina de Olivença Dias
Data de Publicação: 2022
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)
Texto Completo: http://hdl.handle.net/10400.21/16522
Resumo: Trabalho final de Mestrado para obtenção do grau de Mestre em Engenharia Biomédica
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spelling A influência da hidroxiureia no microbioma intestinal em doentes com anemia das células falciformesHemoglobina SAnemia das células falciformesHidroxiureiaMicrobioma intestinalGene 16S rRNAHaemoglobin SSickle cell anaemiaHydroxyureaGut microbiome16S rRNA geneTrabalho final de Mestrado para obtenção do grau de Mestre em Engenharia BiomédicaIntrodução: A doença das células falciformes constitui uma desordem sanguínea monogénica e hereditária, caracterizada pela manifestação de hemoglobina S, a variante mutante da hemoglobina mais prevalente a nível mundial. A anemia falciforme resulta numa homozigotia de hemoglobina S, contribuindo com inúmeras complicações clínicas e podendo afetar a integridade do microbioma intestinal, que desempenha um papel fundamental na fisiopatologia da doença. A hidroxiureia tem vindo a ser apontada como um potencial modulador de características da anemia falciforme podendo induzir determinados efeitos benéficos no microbioma intestinal. Objetivos: Análise dos efeitos da hidroxiureia na composição do microbioma intestinal em doentes com anemia das células falciformes. Mais ainda, pretende-se avaliar qual a região mais informativa (V1-V2 ou V3-V4) do gene 16S para o estudo da composição do microbioma intestinal. Materiais e métodos: O procedimento baseou-se na análise de amostras de material fecal recolhidas antes e depois da administração de hidroxiureia em 16 crianças com anemia das células falciformes. Posteriormente estas amostras foram sequenciadas no equipamento Ilumina NextSeq 550 pela técnica de Next Generation Sequencing, aplicando primers para amplificação das regiões pretendidas (com o total 64 amostras, 32 para cada região). Os resultados foram analisados com recurso ao software STAMP e SPSS. Estas amostras foram também analisadas quanto à presença da bactéria Clostridium difficile, identificada no decorrer da sequenciação. Resultados: Os resultados permitiram observar um aumento de frequência de bactérias benéficas no microbioma intestinal após o tratamento, entre elas Blautia luti e Ruminococcus callidus. Verificou-se que os índices de alfa diversidade diminuíram ligeiramente após seis meses de administração de hidroxiureia e que a região V3-V4 mostrou ser a mais informativa. Conclusão: Os resultados demonstram que a terapêutica com hidroxiureia altera o microbioma intestinal, promovendo a frequência de espécies benéficas. Esta técnica revela-se importante para o estudo do microbioma uma vez que é um método mais rápido permitindo compreender com maior precisão a sua composição microbiana.Introduction: Sickle cell disease is a monogenic and hereditary blood disorder characterized by the existence of haemoglobin S, the most prevalent mutant haemoglobin variant worldwide. Sickle cell anaemia results in a homozygotia of haemoglobin S, contributing with numerous clinical complications and affecting the integrity of the intestinal microbiome, which plays a fundamental role in the pathophysiology of the disease Hydroxyurea has been indicated as a potential modulator of sickle cell anaemia characteristics and may induce beneficial effects on the intestinal microbiome. Objectives: Analyse the effects of hydroxyurea therapy on the composition of the intestinal microbiome in patients with sickle cell anaemia. Moreover, it is intended to evaluate which is the most informative region (V1-V2 or V3-V4) of the 16S gene for the study of the gut microbiome composition. Materials and methods: The procedure was based on the analysis of samples of faecal material collected before and after hydroxyurea administration in 16 children with sickle cell anaemia. Subsequently, these samples were sequenced in the equipment Ilumina NextSeq 550 by the technique Next Generation Sequencing, by applying primers for amplification of the desired regions (with a total of 64 samples, 32 for each region), and then the results were processed using the STAMP and SPSS software. These samples were also analysed for the presence of the bacterium Clostridium difficile, identified during sequencing process. Results: The results allowed to observe an increase in the frequency of beneficial bacteria in the intestinal microbiome after treatment, among them Blautia luti and Ruminococcus callidus. Alpha diversity indexes decreased slightly after six months of hydroxyurea administration and that the V3-V4 region proved to be the most informative. Conclusion: The results show that hydroxyurea therapy changes the intestinal microbiome, promoting the frequency of beneficial species. This technique is important for the study of the microbiome as it is a faster method allowing a more precise understanding of the microbial composition.Brito, Rui Miguel DuqueRCIPLFernandes, Maria Carolina de Olivença Dias2023-10-02T11:23:14Z20222022-01-01T00:00:00Zinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/10400.21/16522TID:203352742porFERNANDES, Maria Carolina de Olivença Dias - A influência da hidroxiureia no microbioma intestinal em doentes com anemia das células falciformes. Lisboa: Instituto Superior de Engenharia de Lisboa, 2022. Dissertação de Mestradoinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)instname:Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informaçãoinstacron:RCAAP2023-10-04T02:15:29Zoai:repositorio.ipl.pt:10400.21/16522Portal AgregadorONGhttps://www.rcaap.pt/oai/openaireopendoar:71602024-03-19T20:33:16.810597Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) - Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informaçãofalse
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