Characterization of the intestinal microbiome of the recovering eurasian griffon vulture (Gyps fulvus) in mainland Portugal

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Nascimento, Mariana Duarte Limede do
Data de Publicação: 2020
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: eng
Título da fonte: Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)
Texto Completo: http://hdl.handle.net/10400.5/20968
Resumo: Dissertação de Mestrado Integrado em Medicina Veterinária
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spelling Characterization of the intestinal microbiome of the recovering eurasian griffon vulture (Gyps fulvus) in mainland PortugalEurasian Griffon Vultureintestinal microbiomePublic healthGrifoMicrobioma IntestinalSaúde PúblicaDissertação de Mestrado Integrado em Medicina VeterináriaThe Eurasian Griffon Vulture (Gyps fulvus), as a scavenger, and due to its widespread distribution throughout the “Old World”, contributes to the removal from the terrestrial surface of hazardous biomasses for most carnivores and omnivorous animals, such as to the human species, since that by feeding on decaying bodies thereby avoids their accumulation (Margalida and Colomer 2012). Due to their particular diet, a growing interest regarding how scavengers species adapt to avoid sickness is observed. One of the suggested mechanisms indicates that scavengers might possess a specialized gut microbiome, enabling them to feed on dead animals (Blumstein et al. 2017) This study focused on the characterization of the recovering G. fulvus (n=8) gut microbiome in mainland Portugal, through high-throughput 16S rRNA amplicon sequencing of the hypervariable V3-V4 regions, further analysed using Qiime2 bioinformatics platform. The composition of the gut microbiome of Griffon Vultures was found to be highly similar to other wild vultures and scavengers, including mostly Fusobacteria, Firmicutes and Proteobacteria species, suggesting a well conserved functional gut microbiome, possibly due to their similar diet and their functional needs. In this way, both the host and the GIT bacteria benefit of a symbiotic relationship, possibly even contributing to the protection of the Griffon Vulture from pathogenic agents, such as those here identified and possibly dangerous to humans, including Clostridium perfringens and C. tetani, as well as other species capable of causing conditions listed as mandatory communicable diseases in Portugal. No sex modulated changes were identified in the gut microbiome of the animals under study, neither differences on the microbiota profiles of individuals recovering in different locations. Still, it was possible to observe that captivity associated chronic stress could indeed lead to GIT microbiota dysbiosis and reduced diversity overall, and that age and medication can influence G. fulvus intestinal microbiome, as younger animals revealed a less diverse gut microbiome, and high doses of cyanocobalamin were possibly associated with the overgrowth of Proteobacteria and loss of diversity within the GIT bacterial composition. A higher similarity of the gut microbiome was found amongst those sampled during the same period of time (May, August and October). The high F/B ratios found in the late summer and early autumn might be explained due to their need for fattening before wintering and breeding season, in which feeding opportunities tend to be scarcer to the point of starvation.RESUMO - CARACTERIZAÇÃO DO MICROBIOMA INTESTINAL DO GRIFO (G. fulvus) EM RECUPERAÇÃO EM PORTUGAL CONTINENTAL - O Grifo (Gyps fulvus), enquanto necrófago, contribui significativamente para a remoção de cadáveres em decomposição da superfície terrestre, contribuindo, dessa forma, para a reciclagem de matéria orgânica potencialmente perigosa para outros animais, incluíndo o Homem (Margalida and Colomer 2012). Dada a sua dieta específica, tem surgido um maior interesse nos métodos de adaptação da espécie e de outros necrófagos a esta que, para muitos animais, omnívoros e carnívoros, seria letal. É sugerida a existência de um microbioma intestinal especializado que permite que este tipo de alimentação não tenha quaisquer consequências para a referida espécie (Blumstein et al. 2017). O estudo teve como objetivo a caracterização do microbioma intestinal do Grifo (n=8) através da análise de amostras fecais. Estas foram submetidas a extração de DNA, seguindo-se a sequenciação da regiões hipervariáveis do gene 16S rRNA. Os resultados foram tratados na plataforma Qiime2. A composição do microbioma intestinal dos animais em estudo corroborou da descrita noutras espécies de abutres selvagens e necrófagos, incluindo espécies de Fusobacteria, Firmicutes e Proteobacteria. Esta afinidade sugere o desenvolvimento de um microbioma intestinal que se foi preservando com vista ao desempenho de determinadas funções, possivelmente devido à sua dieta e necessidades funcionais similares. Poderá considerar-se então a existência de uma potencial relação simbiótica entre o Grifo e a sua microbiota. Salientam-se os identificados no presente estudo como Clostridium perfringens, C. tetani, e outros, incluíndo espécies que constam na Lista de doenças transmissíveis de notificação obrigatória em Portugal. Não se observaram quaisquer alterações significativas do microbioma nos diferentes sexos, nem como consequência da recolha de amostras em diferentes localizações geográficas. Porém, stress crónico, uma possível repercussão da captividade, poderá ter desencadeado uma disbiose e consequente redução da diversidade da microbiota gastrointestinal num dos indivíduos, à semelhança do que se observou no único animal identificado como juvenil. Os resultados sugerem ainda que doses elevadas de suplementação com cianocobalamina estão associadas a um sobrecrescimento de Proteobacteria e diminuição da diversidade do microbioma intestinal. Os indivíduos cujas amostras foram colhidas durante o mesmo período de tempo, mostraram uma maior semelhança entre o seu microbioma intestinal. O elevado rácio F/B, no período precedente ao Inverno e época de acasalamento, sugere a necessidade de acumulação de gorduras neste período, em que as oportunidades de alimentação são por norma mais escassas.Universidade de Lisboa, Faculdade de Medicina VeterináriaOliveira, Maria Manuela Castilho Monteiro deDias, Ricardo Pedro MoreiraRepositório da Universidade de LisboaNascimento, Mariana Duarte Limede do2021-10-30T00:30:19Z2020-10-302020-10-30T00:00:00Zinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/10400.5/20968TID:202635619engNascimento MDL 2020. Characterization of the intestinal microbiome of the recovering eurasian griffon vulture (Gyps fulvus) in mainland Portugal [dissertação de mestrado]. Lisboa: FMV-Universidade de Lisboa.info:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)instname:Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informaçãoinstacron:RCAAP2023-03-06T14:50:23Zoai:www.repository.utl.pt:10400.5/20968Portal AgregadorONGhttps://www.rcaap.pt/oai/openaireopendoar:71602024-03-19T17:05:38.215864Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) - Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informaçãofalse
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