Purificação de uma vacina de DNA plasmídico contra o Vírus do Papiloma Humano

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Gaspar, Rita Isabel Mota
Data de Publicação: 2015
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)
Texto Completo: http://hdl.handle.net/10400.6/6002
Resumo: O vírus do papiloma humano é um vírus sexualmente transmissível e está associado a cerca de 99% dos casos de cancro do colo do útero. Este cancro é considerado a segunda maior causa de morte em mulheres ao nível mundial. As vacinas comercializadas contra este vírus são apenas preventivas, ou seja, permitem o desenvolvimento de anticorpos de memória caso não exista ainda contato com o vírus. Além disto, apresentam outras limitações, tais como o elevado custo e não protegem contra todos os tipos de vírus do papiloma humano. Desta forma, as vacinas de DNA surgiram como uma estratégia bastante promissora, pois estas vacinas têm a capacidade de induzir dois tipos de resposta, a resposta humoral e a resposta celular, evitando assim a progressão da doença. As vacinas de DNA plasmídico requerem uma etapa de produção e uma etapa de purificação para obter apenas a isoforma superenrolada, pois é a isoforma biologicamente ativa e de interesse terapêutico. Para a etapa de purificação, têm sido desenvolvidas novas estratégias para aplicação em processos cromatográficos que apresentem elevada eficiência na separação da biomolécula de interesse. Uma das estratégias recentemente exploradas consiste na utilização de monolitos como colunas cromatográficas que permitem maior capacidade de transferência de massa. Outra das estratégias é a utilização de aminoácidos como ligandos de afinidade, por reconhecerem especificamente a isoforma superenrolada do DNA plasmídico. Desta forma, o trabalho apresentado nesta dissertação baseou-se na utilização de uma coluna monolítica imobilizada com um ligando derivado do aminoácido de histidina (benzil-histidina). O objetivo de explorar este ligando foi estudar as interações que possam ser estabelecidas entre os grupos funcionais do ligando, como os anéis aromáticos de benzil e imidazole, e a isoforma superenrolada do plasmídeo assim como os restantes constituintes do lisado de Escherichia coli. Inicialmente foram realizadas mutações nos genes E6 e E7 do plasmídeo HPV16 E6/E7 para impedir que estas proteínas antigénicas reconheçam as proteínas p53 e retinoblastoma e tenham atividade oncogénica. Posteriormente foram realizados vários ensaios com amostras do plasmídeo mutado obtidas através de um kit comercial, contendo apenas as isoformas superenrolada e circular aberta do plasmídeo, para avaliar o comportamento e seletividade do ligando. Os resultados mostraram que foi possível isolar a isoforma superenrolada com uma concentração de sal de 2 M de sulfato de amónio. Posteriormente, foram realizados ensaios com a amostra complexa de lisado e confirmou-se que é possível purificar a isoforma superenrolada com uma concentração de sal de 1,65 M. Também foram realizados ensaios de dicroísmo circular para avaliar a estabilidade estrutural do plasmídeo superenrolado no processo cromatográfico em função do tampão de eluição utilizado e verificou-se que a estabilidade da isoforma superenrolada se mantém. Por fim, a qualidade e percentagem de pureza do plasmídeo resultante da purificação com o monolito de benzil-histidina foram avaliadas através das metodologias requeridas pelas agências reguladoras, como a “Food and Drug Administration”. Estes testes indicaram que a amostra purificada de DNA plasmídico superenrolado apresenta 99% de pureza e está de acordo com os critérios exigidos no que diz respeito ao DNA genómico, proteínas e RNA. Relativamente às endotoxinas foi conseguida uma redução de aproximadamente 344 vezes comparativamente à amostra inicial.
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Desta forma, as vacinas de DNA surgiram como uma estratégia bastante promissora, pois estas vacinas têm a capacidade de induzir dois tipos de resposta, a resposta humoral e a resposta celular, evitando assim a progressão da doença. As vacinas de DNA plasmídico requerem uma etapa de produção e uma etapa de purificação para obter apenas a isoforma superenrolada, pois é a isoforma biologicamente ativa e de interesse terapêutico. Para a etapa de purificação, têm sido desenvolvidas novas estratégias para aplicação em processos cromatográficos que apresentem elevada eficiência na separação da biomolécula de interesse. Uma das estratégias recentemente exploradas consiste na utilização de monolitos como colunas cromatográficas que permitem maior capacidade de transferência de massa. Outra das estratégias é a utilização de aminoácidos como ligandos de afinidade, por reconhecerem especificamente a isoforma superenrolada do DNA plasmídico. Desta forma, o trabalho apresentado nesta dissertação baseou-se na utilização de uma coluna monolítica imobilizada com um ligando derivado do aminoácido de histidina (benzil-histidina). O objetivo de explorar este ligando foi estudar as interações que possam ser estabelecidas entre os grupos funcionais do ligando, como os anéis aromáticos de benzil e imidazole, e a isoforma superenrolada do plasmídeo assim como os restantes constituintes do lisado de Escherichia coli. Inicialmente foram realizadas mutações nos genes E6 e E7 do plasmídeo HPV16 E6/E7 para impedir que estas proteínas antigénicas reconheçam as proteínas p53 e retinoblastoma e tenham atividade oncogénica. Posteriormente foram realizados vários ensaios com amostras do plasmídeo mutado obtidas através de um kit comercial, contendo apenas as isoformas superenrolada e circular aberta do plasmídeo, para avaliar o comportamento e seletividade do ligando. Os resultados mostraram que foi possível isolar a isoforma superenrolada com uma concentração de sal de 2 M de sulfato de amónio. Posteriormente, foram realizados ensaios com a amostra complexa de lisado e confirmou-se que é possível purificar a isoforma superenrolada com uma concentração de sal de 1,65 M. Também foram realizados ensaios de dicroísmo circular para avaliar a estabilidade estrutural do plasmídeo superenrolado no processo cromatográfico em função do tampão de eluição utilizado e verificou-se que a estabilidade da isoforma superenrolada se mantém. Por fim, a qualidade e percentagem de pureza do plasmídeo resultante da purificação com o monolito de benzil-histidina foram avaliadas através das metodologias requeridas pelas agências reguladoras, como a “Food and Drug Administration”. Estes testes indicaram que a amostra purificada de DNA plasmídico superenrolado apresenta 99% de pureza e está de acordo com os critérios exigidos no que diz respeito ao DNA genómico, proteínas e RNA. Relativamente às endotoxinas foi conseguida uma redução de aproximadamente 344 vezes comparativamente à amostra inicial.The human papillomavirus is a sexually transmitted virus and is associated with about 99% of the cases of cervical cancer. This virus is the second leading cause of death in women worldwide. Conventional vaccines against this virus are only preventive and are only effective in cases where there is no contact yet with the virus. Additionally, feature other limitations, such as the high cost and do not protect against all types of human papilloma virus. In this way, DNA vaccines have emerged as a very promising strategy because these vaccines have the ability to induce two types of response, humoral response and the cellular response, thus preventing the progression of the disease. Plasmid DNA vaccines require a production step and one-step purification to obtain only the supercoiled isoform, since it is the biologically active isoform of therapeutic interest. For the purification step, new strategies have been developed for application in chromatographic processes with high efficiency for the separation of the biomolecule of interest. One of the promising strategies is to explore monoliths as chromatographic columns that allow high mass transfer capability. Another strategy is to use amino acids as affinity ligands, because they specifically recognize supercoiled plasmid DNA isoform. In this way, the work presented in this thesis is based on the use of a monolithic column immobilized with a histidine amino acid derivative (benzyl-histidine). The goal of exploring this ligand was to study the interactions that can be established between the functional groups of the ligand, such as the benzyl and imidazole aromatic rings, and the supercoiled plasmid isoform as well as the remaining constituents of Escherichia coli lysate. Initially, mutations in E6 and E7 genes were performed in the HPV16 E6/E7 plasmid DNA to prevent these antigenic proteins recognize the p53 and retinoblastoma proteins and have oncogenic activity. Later al assays were conducted with samples of mutated plasmid DNA and obtained through a commercial kit, containing only the supercoiled and open circular isoforms, to evaluate the behavior and selectivity of the ligand. The results showed that it was possible to isolate the supercoiled isoform with a salt concentration of 2 M ammonium sulfate. Thereafter, tests were done using a complex lysate sample and confirmed that it is possible to purify the supercoiled isoform with a salt concentration of 1.65 M. Circular dichroism assays were also carried out to assess the structural stability of supercoiled plasmid DNA in chromatographic process in function of the used elution buffer and it was found that the stability of supercoiled isoform is maintained. Finally, the quality and purity degree of plasmid resultant of purification with the benzyl-histidine monolith were evaluated through the methodologies required by regulatory agencies such as the Food and Drug Administration. These tests indicated that the purified supercoiled plasmid DNA sample presents 99% of purity and is in compliance with the criteria with regard to the genomic DNA, RNA and proteins. In relation to endotoxins, it was achieved a reduction of approximately 344 times comparing to the original sample.Queiroz, João António de Sampaio RodriguesSousa, Ângela Maria Almeida deuBibliorumGaspar, Rita Isabel Mota2018-08-31T16:13:34Z2015-6-82015-07-082015-07-08T00:00:00Zinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/10400.6/6002TID:201643766porinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)instname:Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informaçãoinstacron:RCAAP2023-12-15T09:44:14Zoai:ubibliorum.ubi.pt:10400.6/6002Portal AgregadorONGhttps://www.rcaap.pt/oai/openaireopendoar:71602024-03-20T00:46:49.542542Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) - Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informaçãofalse
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