Discriminating B and T-lymphocyte from its molecular profile acquired in a label-free and high-throughput method

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Ramalhete, Luís
Data de Publicação: 2020
Outros Autores: Araújo, Rúben, Calado, Cecília
Tipo de documento: Artigo
Idioma: eng
Título da fonte: Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)
Texto Completo: http://hdl.handle.net/10400.21/12305
Resumo: Este trabalho foi financiado pelo Concurso Anual para Projetos de Investigação, Desenvolvimento, Inovação e Criação Artística (IDI&CA) 2018 do Instituto Politécnico de Lisboa. Código de referência IPL/2018/RENALPROG_ISEL
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spelling Discriminating B and T-lymphocyte from its molecular profile acquired in a label-free and high-throughput methodB lymphocytesT-lymphocytesMolecular profileFTIR spectroscopyEste trabalho foi financiado pelo Concurso Anual para Projetos de Investigação, Desenvolvimento, Inovação e Criação Artística (IDI&CA) 2018 do Instituto Politécnico de Lisboa. Código de referência IPL/2018/RENALPROG_ISELEste trabalho foi financiado pelo Concurso Anual para Projetos de Investigação, Desenvolvimento, Inovação e Criação Artística (IDI&CA) 2020 do Instituto Politécnico de Lisboa. Código de referência IPL/2020/NephroMD:ISELB and T-lymphocytes are one of the main players of the adaptive immune system and consequently, the ability to discriminate these cells is relevant in diverse pathophysiological cases. In the present work, FTIR spectroscopy was used to acquire the cells molecular profile in a label-free, simple, rapid, economic, and high-throughput mode. It was possible, by hierarchical cluster analysis of the second derivative spectra, between 900 to 1500 cm-1, to correctly classify 98% of samples as B and T-lymphocyte. It was also possible to develop a very good support vector machine model, which could predict B and T-lymphocyte from the second derivative spectra, with high accuracy (0.95), precision (0.95), recall (0.95), and F1 score (0.95). The method developed presents therefore, appealing characteristics to promote a new diagnostic tool to analyze and discriminate B from T-lymphocytes.ElsevierRCIPLRamalhete, LuísAraújo, RúbenCalado, Cecília2020-10-30T10:26:28Z2020-112020-11-01T00:00:00Zinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/articleapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/10400.21/12305engRAMALHETE, Luís; ARAÚJO, Rúben; CALADO, Cecília R. C. – Discriminating B and T-lymphocyte from its molecular profile acquired in a label-free and high-throughput method. Vibrational Spectroscopy. ISSN 0924-2031. Vol. 111 (2020), pp. 1-80924-203110.1016/j.vibspec.2020.103177metadata only accessinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)instname:Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informaçãoinstacron:RCAAP2023-08-03T10:04:56Zoai:repositorio.ipl.pt:10400.21/12305Portal AgregadorONGhttps://www.rcaap.pt/oai/openaireopendoar:71602024-03-19T20:20:25.201589Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) - Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informaçãofalse
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