Caracterização de Klebsiella pneumoniae NDM-positivas da região centro de Portugal

• Autor(a) principal: Silva, Sara Margarida dos Santos
• Data de Publicação: 2022
• Tipo de documento: Dissertação
• Idioma: por
• Título da fonte: Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)
• Texto Completo: http://hdl.handle.net/10773/37137
• topic: Carbapenemases; Carbapenemos; PCR; PFGE; Resistência a antibióticos; Resistoma; Sequenciação de genoma; Viruloma

A emergência e a disseminação de bactérias resistentes aos antibióticos é um problema de saúde pública global. O gene blaNDM codifica a Nova Deli metalo-beta-lactamase (NDM). Este gene está frequentemente associado a outros genes de resistência a antibióticos (ARGs) e a elementos genéticos móveis, o que aumenta o risco de patogenicidade da bactéria. Os hospitais necessitam de gerir eficientemente os doentes blaNDM-positivos para minimizar os riscos de infeções nosocomiais, frequentemente associadas a elevada mortalidade e morbilidade. Além disso, são necessárias bases de dados de estirpes blaNDM-positivas nas unidades de cuidados de saúde que irão ajudar na construção de planos de gestão ao longo do tempo. A necessidade do presente estudo teve por base o aumento súbito de estirpes de Klebsiella pneumoniae produtoras de NDM (NDM-p-KP; n=8) causadoras de infeções do trato urinário num hospital no centro de Portugal num período do ano de 2021. O objetivo passou por estudar a origem do surto e caracterizar, a nível genético, as estirpes NDM-p-KP quanto ao seu grupo de tipagem, resistoma e viruloma. Para tal, foi investigada a relação epidemiológica das estirpes recorrendo a BOX-PCR e PFGE. Os resultados mostraram um nível elevado de semelhança entre as estirpes (>95%), apoiando a sua relação clonal. Contudo, de acordo com o histórico de admissão dos pacientes, o surto não pode ser de origem nosocomial. Logo, considerou-se que houve uma via de disseminação externa às instalações de saúde. Dada a clonalidade das estirpes, foram selecionadas duas e os seus genomas foram sequenciados. A análise dos mesmos permitiu concluir que as estirpes NDM-p-KP pertencem ao grupo ST11 e apresentam vários fatores de virulência que podem potenciar a sua patogenicidade. Além do gene blaNDM-1, foram detetados outros genes de resistência, incluindo quinolonas e de aminoglicosídeos, confirmando o perfil de multirresistência das estirpes. Foi ainda possível determinar que o ambiente genético do gene blaNDM-1 é semelhante a outros já descritos para K. pneumoniae. No entanto foi inconclusivo se o mesmo se localiza num plasmídeo conjugativo, como a maioria dos casos descritos. A caracterização efetuada neste trabalho contribuirá para o desenvolvimento de bases de dados para a vigilância das infeções associadas ao gene blaNDM.