Sistema de informação de armazenamento e procura de proteínas

• Autor(a) principal: Gonzaga, Ricardo Mateus
• Data de Publicação: 2012
• Tipo de documento: Dissertação
• Idioma: por
• Título da fonte: Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)
• Texto Completo: http://hdl.handle.net/10773/10211
• topic: Engenharia de computadores; Bioinformática; Proteínas; Análise sequencial

Com a redução dos custos de sequenciação, muitos grupos de investigação têm efetuado sequenciações maciças dos organismos com que trabalham. Estas sequenciações revelam a combinação de nucleótidos (A,C,T,G) que compõe os genomas, desvendando o código para a construção das proteínas, que por sua vez, são usadas nos mais diversos processos como regulação, crescimento, manutenção, entre outros mecanismos. As sequências proteicas poderão ter um elevado potencial biotecnológico. Por exemplo, quando se sequenciam organismos que vivem em ambientes extremos, tais como, com elevadas concentrações de produtos tóxicos, grandes profundidades ou elevados níveis de radiação, as proteínas que os protegem contra esses agentes poderão ser importantes em diversas áreas da biotecnologia. Atualmente existem vários métodos que permitem reconhecer as propriedades específicas de cada proteína, desde a análise da sequência, passando pela análise estrutural ou até mesmo funcional. Ferramentas como o Inter- ProScan permitem conhecer de uma forma rápida e simples as mais valias funcionais de uma sequência e perceber se uma dada proteína pode ter ou não potencial para que seja produzida num ambiente laboratorial. O objetivo deste trabalho é desenvolver um sistema que permita organizar e catalogar todas as proteínas pertencentes a um determinado grupo de investigação sendo capaz de publicar características funcionais sem desvendar as suas sequências genéticas. A publicação e pesquisa destas proteínas será baseada nos seus grupos funcionais, revelados recorrendo à ferramenta InterProScan. Este sistema é constituído por dois componentes, uma aplicação local e um site web, e destina-se a grupos de investigação que pretendam divulgar as proteínas sequenciadas nos seus laboratórios e a entidades que necessitem de proteínas com propriedades específicas.