An SiPM-basead PET-TOF demonstrator: test and evaluation of the image reconstruction software and implementation of a TOF algorithm for improved imaging

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Pereira, Liliana Filipa Nunes
Data de Publicação: 2016
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)
Texto Completo: http://hdl.handle.net/10451/27313
Resumo: Tese de mestrado integrado, Engenharia Biomédica e Biofísica (Radiações em Diagnóstico e Terapia)Universidade de Lisboa, Faculdade de Ciências, 2016
id RCAP_e62f01911a27d69238adfdfd48d0c0ec
oai_identifier_str oai:repositorio.ul.pt:10451/27313
network_acronym_str RCAP
network_name_str Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)
repository_id_str 7160
spelling An SiPM-basead PET-TOF demonstrator: test and evaluation of the image reconstruction software and implementation of a TOF algorithm for improved imagingTomografia por Emissão de Positrões (PET)Mamografia por Emissão de Positrões (PEM)Tempo-de-VooSimulação de Monte CarloReconstrução de ImagemTeses de mestrado - 2016Departamento de FísicaTese de mestrado integrado, Engenharia Biomédica e Biofísica (Radiações em Diagnóstico e Terapia)Universidade de Lisboa, Faculdade de Ciências, 2016O cancro da mama é a neoplasia maligna com maior taxa de incidência nas mulheres, sendo também uma das maiores causas de morte por cancro. Nos últimos anos têm sido realizados esforços no sentido de se desenvolverem novas técnicas imagiológicas que permitam uma deteção do cancro da mama no seu estado mais inicial. O uso destas técnicas permite a existência de um da doença com metodologias menos agressivas para o paciente e potencialmente mais eficazes. Estas novas técnicas visam também ultrapassar as dificuldades sentidas pelas técnicas mais antigas em analisar, por exemplo, mamas densas, ou até em detetar lesões em zonas anteriormente de acesso muito difícil, como a zona axilar. Atualmente, a tecnologia de imagem médica mais usada para a deteção e acompanhamento destas neoplasias é a mamografia por raios-X. Outros métodos de imagem, tais como os ultrassons e a ressonância magnética, desempenham um papel importante como técnicas auxiliares à mamografia por raios-X, principalmente quando a sensibilidade do uso de raios-X é baixa (por exemplo, devido a uma elevada densidade da mama). As tecnologias acima referidas produzem, essencialmente, imagens anatómicas, não sendo capazes de obter informação sobre alterações funcionais ou metabólicas nos tecidos. Assim, os métodos de imagem médica molecular, como são a Cintigrafia, a Tomografia Computorizada por Emissão de Fotão Único (SPECT) e a Tomografia por Emissão de Positrões (PET), introduzem informação complementar aos métodos de imagem anatómica. No entanto, estas técnicas de imagem funcional estão direcionadas para imagens de corpo inteiro, verificando-se uma baixa sensibilidade de deteção das pequenas lesões da mama. Neste contexto, tem-se assistido nos últimos anos à criação de equipamentos compactos baseados na cintigrafia e na tecnologia PET, com elevada sensibilidade para detetar as neoplasias características do cancro da mama. Esta evolução, direcionada para a imagem no diagnóstico e tratamento do cancro da mama, surge assim, como uma nova tecnologia designada por Mamografia por Emissão de Positrões (PEM). A Mamografia por Emissão de Positrões (PEM) é uma técnica promissora e decisiva na conquista deste objetivo. A PEM apresenta-se como uma técnica imagiológica funcional e não-invasiva, que se dedica à imagem da mama, partilhando os seus princípios físicos com a tomografia por emissão de positrões (PET). Alguns sistemas de imagem têm sido desenvolvidos neste âmbito, no contexto dos quais surge o novo protótipo desenvolvido e aqui estudado e que se denomina SiPM-based PET-ToF demonstrator. Este apresenta-se como um scanner de alta resolução e sensibilidade com capacidade de obtenção precisa de informação do tempo-de-voo (TOF) das partículas após aniquilação, desenvolvido pela PETsys Electronics, S.A em parceria com o consórcio de PET e com o LIP - Laboratório de Instrumentação e Física Experimental de Partículas. O SiPM-based PET-ToF demonstrator apresenta uma geometria de ^angulo limitado que proporciona exibilidade na colocação do scanner ao redor do paciente, bem como a possibilidade de o de combinar com outras técnicas de imagiologia e diagnóstico. É de grande importância referir que o protótipo avaliado ao longo deste projeto foi desenvolvido com capacidades para obtenção da informação do tempo-de-voo das partículas, característica que tem sido alvo de muitos estudos para obtenção de melhores resultados na reconstrução da imagem final. Ou seja, através da integração da informação do tempo-de-voo das partículas no software de reconstrução de imagem é possível estimar a localização precisa do local onde ocorreu a aniquilação dos positrões ao longo da linha-de-resposta (LOR) estimada. Isto tem importância na reconstrução de imagem, uma vez que permite obter uma melhor e mais correta quantificação da imagem final, melhorando por consequência a deteção de uma possível lesão. Com base nisto, o trabalho desenvolvido no âmbito desta dissertação de mestrado tem como principal propósito avaliar e melhorar o software de reconstrução de imagem utilizado pela PETsys Electronics S.A, especificamente para o SiPM-based PET-ToF demonstrator, bem como a inclusão do algoritmo de tempo-de-voo nesse mesmo software. Para tal, recorreu-se ao método de simulação de Monte Carlo. A metodologia adotada procurou reproduzir de uma forma realística, a geometria do detetor, o ambiente de radiação e fatores instrumentais relacionados com o sistema de imagem. Foram executados testes para validação dos dados simulados recorrendo ao uso de dados obtidos experimentalmente. Foram também avaliados os dados experimentais de forma a obter a resolução espacial intrínseca do protótipo em estudo. Após validação da geometria simulada do SiPM-based PET-ToF demonstrator, foi avaliado o processo de normalização, já utilizado para outros scanners desenvolvidos na PETsys Electronics S.A, para correção de artefactos na obtenção da imagem final. Este estudo foi feito com base em dados obtidos através de simulações de Monte Carlo, e teve como principal objetivo otimizar o processo de normalização utilizado especificamente para este novo protótipo. Após validação e otimização da metodologia de normalização no processo de reconstrução de imagem, o software foi alterado de modo a incluir o algoritmo do tempo-de-voo. Para validação desta alteração, foi realizado um estudo recorrendo a simulações de diferentes fantomas, onde as imagens foram posteriormente reconstruídas utilizando o software com e sem o algoritmo de tempo-de-voo. A resolução espacial, o número de contagens, a sensibilidade e a razão sinal-ruído foram alguns dos parâmetros avaliados ao longo desta tese. Os resultados obtidos demonstraram que os fatores utilizados no processo de normalização têm uma grande influência no que diz respeito a estimar imagem final, uma vez que permite a obtenção de imagens com formas melhor definidas e com menos ruído de fundo. Da mesma forma, a integração do tempo-de-voo na metodologia de reconstrução de imagem confirmou ser um ótimo complemento, uma vez que permitiu a obtenção de melhorias na qualidade das imagens. No entanto, é importante realçar que foram verificados alguns erros durante o tratamento dos dados desta última parte do estudo apresentado nesta tese, que necessitam de ser avaliados e corrigidos futuramente.Positron Emission Mammography (PEM) with 18F-Fluorodeoxyglucose is a functional imaging technique useful for breast cancer detection. The improvement of the detection of early stage breast cancer depends on the development of dedicated imaging systems with high sensitivity and spatial resolution. Also, many studies have supported the inclusion of time-of-flight information in the image reconstruction methods since this can allow for the improvement of image quality and quantitative accuracy, thereby improving lesion detectability. The SiPM-based PET-ToF demonstrator is a high resolution and sensitivity scanner with TOF capabilities developed by PETsys Electronics, S.A. in partnership with the PET-Consortium (eight technology and medical institutions, since 2003) and LIPLaboratory for Particle Physics, Lisbon (Detector and electronics development for CERN experiments since 20 years). The work presented in this thesis focus on the study of the performance of detector imaging quality and on the inclusion of TOF algorithm in the image reconstruction method used in the PETsys Electronics Systems. The image reconstruction method used during the work was already studied for the Clear-PEM system and it's here adapted for the SiPMbased PET-ToF demonstrator geometry and configuration. To achieve this, a realistic design of the detector was performed in the software used for numerical simulations of the final imaging. Monte Carlo data was provided to validate and optimize the changes done in image reconstruction algorithm and to investigate the normalization process in final imaging acquisition. It was demonstrated that the normalization factors used in image reconstruction have a big influence in the final result obtained, since it allows to obtain better defined image shapes and with less background noise. Similarly, the integration of time-of-flight information has confirmed to be of value in image reconstruction methodology, since it improves PET imaging quality. However, the image reconstruction methodology proposed here is still imperfect, resulting in the need for future work.Almeida, Pedro Miguel Dinis de, 1968-Repositório da Universidade de LisboaPereira, Liliana Filipa Nunes2017-03-28T10:19:03Z201620162016-01-01T00:00:00Zinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/10451/27313TID:201684748porinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)instname:Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informaçãoinstacron:RCAAP2023-11-08T16:18:06Zoai:repositorio.ul.pt:10451/27313Portal AgregadorONGhttps://www.rcaap.pt/oai/openaireopendoar:71602024-03-19T21:43:46.070535Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) - Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informaçãofalse
dc.title.none.fl_str_mv An SiPM-basead PET-TOF demonstrator: test and evaluation of the image reconstruction software and implementation of a TOF algorithm for improved imaging
title An SiPM-basead PET-TOF demonstrator: test and evaluation of the image reconstruction software and implementation of a TOF algorithm for improved imaging
spellingShingle An SiPM-basead PET-TOF demonstrator: test and evaluation of the image reconstruction software and implementation of a TOF algorithm for improved imaging
Pereira, Liliana Filipa Nunes
Tomografia por Emissão de Positrões (PET)
Mamografia por Emissão de Positrões (PEM)
Tempo-de-Voo
Simulação de Monte Carlo
Reconstrução de Imagem
Teses de mestrado - 2016
Departamento de Física
title_short An SiPM-basead PET-TOF demonstrator: test and evaluation of the image reconstruction software and implementation of a TOF algorithm for improved imaging
title_full An SiPM-basead PET-TOF demonstrator: test and evaluation of the image reconstruction software and implementation of a TOF algorithm for improved imaging
title_fullStr An SiPM-basead PET-TOF demonstrator: test and evaluation of the image reconstruction software and implementation of a TOF algorithm for improved imaging
title_full_unstemmed An SiPM-basead PET-TOF demonstrator: test and evaluation of the image reconstruction software and implementation of a TOF algorithm for improved imaging
title_sort An SiPM-basead PET-TOF demonstrator: test and evaluation of the image reconstruction software and implementation of a TOF algorithm for improved imaging
author Pereira, Liliana Filipa Nunes
author_facet Pereira, Liliana Filipa Nunes
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Almeida, Pedro Miguel Dinis de, 1968-
Repositório da Universidade de Lisboa
dc.contributor.author.fl_str_mv Pereira, Liliana Filipa Nunes
dc.subject.por.fl_str_mv Tomografia por Emissão de Positrões (PET)
Mamografia por Emissão de Positrões (PEM)
Tempo-de-Voo
Simulação de Monte Carlo
Reconstrução de Imagem
Teses de mestrado - 2016
Departamento de Física
topic Tomografia por Emissão de Positrões (PET)
Mamografia por Emissão de Positrões (PEM)
Tempo-de-Voo
Simulação de Monte Carlo
Reconstrução de Imagem
Teses de mestrado - 2016
Departamento de Física
description Tese de mestrado integrado, Engenharia Biomédica e Biofísica (Radiações em Diagnóstico e Terapia)Universidade de Lisboa, Faculdade de Ciências, 2016
publishDate 2016
dc.date.none.fl_str_mv 2016
2016
2016-01-01T00:00:00Z
2017-03-28T10:19:03Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://hdl.handle.net/10451/27313
TID:201684748
url http://hdl.handle.net/10451/27313
identifier_str_mv TID:201684748
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)
instname:Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informação
instacron:RCAAP
instname_str Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informação
instacron_str RCAAP
institution RCAAP
reponame_str Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)
collection Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)
repository.name.fl_str_mv Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) - Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informação
repository.mail.fl_str_mv
_version_ 1799134357322989568