Genotipagem de isolados de Aspergillus fumigatus de origem clínica e ambiental

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Morais, Susana
Data de Publicação: 2023
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)
Texto Completo: http://hdl.handle.net/10400.18/9140
Resumo: Dissertação de Mestrado em Microbiologia Aplicada, apresentada à Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa, 2022.
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Dada a elevada taxa de mortalidade associada às infeções relacionadas com este fungo, bem como a emergência de um grave problema de resistência aos antifúngicos triazóis utilizados como primeira linha de tratamento nestas, torna-se importante perceber a sua dinâmica no ambiente e no organismo humano. Além disso, o aparecimento de novos grupos de risco aos quais a infeção está associada, tem vindo a levantar também uma crescente preocupação no que toca aos critérios para diagnóstico e tratamento da doença, que ainda representam um desafio. O conhecimento da epidemiologia do fungo permite uma melhor perceção das suas interações com o ambiente e com o Homem, tornando esta área de elevada importância no contexto da relevância crescente de Aspergillus fumigatus na clínica. No presente estudo, foi utilizada uma técnica robusta de genotipagem, específica para Aspergillus fumigatus sensu stricto, o ensaio STRAf, que permite distinguir diferentes estirpes desta espécie, através da amplificação de loci específicos numa reação de amplificação multiplex com primers marcados com fluorescência. Com o ensaio realizado foi possível comprovar a grande variabilidade genética de Aspergillus fumigatus, tendo-se observado 85 genótipos de entre os 100 isolados viáveis analisados. Foi também possível perceber a interação entre alguns dos isolados em estudo. A técnica revelou, como esperado, um elevado poder discriminatório (0,9820) o que confirma a sua utilidade em futuros estudos epidemiológicos de grande escala, essenciais para melhor entender como abordar a problemática crescente que este fungo tem representado.Aspergillus fumigatus is a saprophytic fungus, ubiquitous in the environment, with increasing clinical relevance for human health. This fungus is responsible for causing, among other pathologies, severe invasive infections, particularly in immunocompromised individuals. Given the high mortality rate associated with these infections, as well as the emergence of a serious problem of resistance to triazole antifungals, used as the first line of treatment in Aspergillus infections, it is important to comprehend its dynamics in the environment and in the human body. In addition, the emergence of new risk groups to which the infection is associated, is also raising growing concerns about the criteria for diagnosis and treatment of the disease, which still poses a challenge. Understanding the epidemiology of the fungus allows a better perception of its interactions with the environment and with humans, which makes epidemiology, an area of great importance in the context of the growing relevance of Aspergillus fumigatus in human health. In the present study, a robust genotyping technique, specific to Aspergillus fumigatus sensu stricto, the STRAf assay, was used. The assay allows the distinction of different strains of this species, through amplification of specific loci in a multiplex amplification reaction with fluorescent-labeled primers. With the assay performed, it was possible to verify the great genetic variability of Aspergillus fumigatus, and 85 genotypes were observed, among the 100 viable isolates analyzed. It was also possible to perceive the interaction between some of the isolates under study. The technique revealed, as expected, a high discriminatory power (0,9820) which confirms its usefulness in future large-scale epidemiological studies, essential to better understand how to approach the growing problem that A. fumigatus is becoming.Sabino, RaquelBarata, MargaridaRepositório Científico do Instituto Nacional de SaúdeMorais, Susana2023-012023-01-01T00:00:00Z2025-10-22T00:00:00Zinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/10400.18/9140porinfo:eu-repo/semantics/embargoedAccessreponame:Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)instname:Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informaçãoinstacron:RCAAP2024-02-24T01:31:00Zoai:repositorio.insa.pt:10400.18/9140Portal AgregadorONGhttps://www.rcaap.pt/oai/openaireopendoar:71602024-03-20T03:11:15.815331Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) - Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informaçãofalse
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