Perturbação do espectro do autismo: identificação de variantes em genes envolvidos no mecanismo regulador da expressão génica nonsense-mediated mRNA decay
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Data de Publicação: | 2022 |
Outros Autores: | , , , , , |
Tipo de documento: | Artigo |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) |
Texto Completo: | http://hdl.handle.net/10400.18/8028 |
Resumo: | A Perturbação do Espectro do Autismo (PEA) é uma patologia do neurodesenvolvimento caracterizada por dificuldades de socialização e/ou comunicação e por comportamentos estereotipados e repetitivos. Estudos de heritabilidade indicam que fatores genéticos contribuem para 50-80% do risco de desenvolver PEA, mas os mecanismos genéticos não são bem conhecidos. Neste estudo, exploramos a contribuição para o risco de PEA de genes que codificam proteínas envolvidas num mecanismo regulador da expressão génica, o Nonsense-Mediated mRNA Decay (NMD). Para este fim, compilámos uma lista de 46 genes envolvidos no NMD e investigámos a presença de Single Nucleotide Variants (SNVs) e Copy Number Variants (CNV ) nestes genes em duas amostras populacionais de indivíduos diagnosticados com PEA (n=1828 e n=3570, respetivamente). Identificámos variantes raras (MAF<1% em controlos) com efeito deletério de acordo com uma predição in silico, e verificámos se afetam domínios proteicos necessários para o NMD. Identificámos 270 SNVs em 524 pacientes com PEA e 38 CNVs em 38 pacientes com PEA. Destas, 136 variantes (122 SNVs e 11 CNVs) estão localizadas em regiões dos genes que codificam domínios proteicos importantes para o funcionamento do mecanismo de NMD. Deste modo, colocamos a hipótese de que estas variantes possam afetar a função normal do NMD e, consequentemente, contribuir para alterações na expressão dos genes-alvo, podendo assim constituir um fator de risco para a PEA. |
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Perturbação do espectro do autismo: identificação de variantes em genes envolvidos no mecanismo regulador da expressão génica nonsense-mediated mRNA decayAutism spectrum disorder: identification of gene variants involved in the nonsense-mediated mRNA decayAutismoPerturbação do Espectro do AutismoPerturbações do Desenvolvimento InfantilMecanismo ReguladorNonsense-mediated mRNA DecayPerturbações do Desenvolvimento Infantil e Saúde MentalExpressão GénicaGenómica Funcional e EstruturalA Perturbação do Espectro do Autismo (PEA) é uma patologia do neurodesenvolvimento caracterizada por dificuldades de socialização e/ou comunicação e por comportamentos estereotipados e repetitivos. Estudos de heritabilidade indicam que fatores genéticos contribuem para 50-80% do risco de desenvolver PEA, mas os mecanismos genéticos não são bem conhecidos. Neste estudo, exploramos a contribuição para o risco de PEA de genes que codificam proteínas envolvidas num mecanismo regulador da expressão génica, o Nonsense-Mediated mRNA Decay (NMD). Para este fim, compilámos uma lista de 46 genes envolvidos no NMD e investigámos a presença de Single Nucleotide Variants (SNVs) e Copy Number Variants (CNV ) nestes genes em duas amostras populacionais de indivíduos diagnosticados com PEA (n=1828 e n=3570, respetivamente). Identificámos variantes raras (MAF<1% em controlos) com efeito deletério de acordo com uma predição in silico, e verificámos se afetam domínios proteicos necessários para o NMD. Identificámos 270 SNVs em 524 pacientes com PEA e 38 CNVs em 38 pacientes com PEA. Destas, 136 variantes (122 SNVs e 11 CNVs) estão localizadas em regiões dos genes que codificam domínios proteicos importantes para o funcionamento do mecanismo de NMD. Deste modo, colocamos a hipótese de que estas variantes possam afetar a função normal do NMD e, consequentemente, contribuir para alterações na expressão dos genes-alvo, podendo assim constituir um fator de risco para a PEA.Autism Spectrum Disorder (ASD) is a neurodevelopmental condition characterized by impaired social/communication skills and stereotyped /repetitive behaviors. Genetic factors account for 50-80% of the familial risk of ASD, but genetic determinants are not fully understood. In this study, we explored the contribution to ASD etiology of genes involved in an important post-transcriptional regulatory mechanism, the Nonsense-Mediated mRNA Decay (NMD). We first compiled a group of 46 genes encoding NMD factors and regulators. In these genes, we searched for Single Nucleotide Variants (SNVs) and Copy Number Variants (CNVs) in two samples of ASD patients (n=1828 and n=3570, respectively). In genes with rare variants (MAF<1% in controls) predicted in silico to be deleterious, we further investigated whether these variants affect protein domains required for NMD. We identified 270 SNVs in 524 ASD patients and 38 CNVs in 38 ASD patients. We found 136 variants (122 SNVs and 11 CNVs) located within protein domains that may affect proper NMD function and consequently contribute to changes in the expression of NMD targets. This study suggests that genetic variants that cause NMD impairment may constitute a risk factor to ASD pathophysiology.Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge, IPRepositório Científico do Instituto Nacional de SaúdeMarques, Ana RitaSantos, João XavierMartiniano, HugoVilela, JoanaRasga, CéliaRomão, LuísaVicente, Astrid Moura2022-05-27T16:10:23Z2022-052022-05-01T00:00:00Zinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/articleapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/10400.18/8028porBoletim Epidemiológico Observações. 2022 janeiro-abril;11(31):49-540874-2928info:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)instname:Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informaçãoinstacron:RCAAP2023-07-20T15:42:27Zoai:repositorio.insa.pt:10400.18/8028Portal AgregadorONGhttps://www.rcaap.pt/oai/openaireopendoar:71602024-03-19T18:42:52.554964Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos) - Agência para a Sociedade do Conhecimento (UMIC) - FCT - Sociedade da Informaçãofalse |
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A Perturbação do Espectro do Autismo (PEA) é uma patologia do neurodesenvolvimento caracterizada por dificuldades de socialização e/ou comunicação e por comportamentos estereotipados e repetitivos. Estudos de heritabilidade indicam que fatores genéticos contribuem para 50-80% do risco de desenvolver PEA, mas os mecanismos genéticos não são bem conhecidos. Neste estudo, exploramos a contribuição para o risco de PEA de genes que codificam proteínas envolvidas num mecanismo regulador da expressão génica, o Nonsense-Mediated mRNA Decay (NMD). Para este fim, compilámos uma lista de 46 genes envolvidos no NMD e investigámos a presença de Single Nucleotide Variants (SNVs) e Copy Number Variants (CNV ) nestes genes em duas amostras populacionais de indivíduos diagnosticados com PEA (n=1828 e n=3570, respetivamente). Identificámos variantes raras (MAF<1% em controlos) com efeito deletério de acordo com uma predição in silico, e verificámos se afetam domínios proteicos necessários para o NMD. Identificámos 270 SNVs em 524 pacientes com PEA e 38 CNVs em 38 pacientes com PEA. Destas, 136 variantes (122 SNVs e 11 CNVs) estão localizadas em regiões dos genes que codificam domínios proteicos importantes para o funcionamento do mecanismo de NMD. Deste modo, colocamos a hipótese de que estas variantes possam afetar a função normal do NMD e, consequentemente, contribuir para alterações na expressão dos genes-alvo, podendo assim constituir um fator de risco para a PEA. |
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