Microbioma bacteriano associado ao sistema digestivo e circulatório do choco (Sepia offcinalis, L.)

• Autor(a) principal: Viagem, Leonildo dos Anjo
• Data de Publicação: 2019
• Tipo de documento: Dissertação
• Idioma: por
• Título da fonte: Repositório Científico de Acesso Aberto de Portugal (Repositórios Cientìficos)
• Texto Completo: http://hdl.handle.net/10400.1/13569
• topic: Microbioma; Diversidade; Trato digestivo; Hemolinfa; Choco; Microbioma fundamental; Microbioma total; Microbioma raro; Domínio/Área Científica::Ciências Naturais::Outras Ciências Naturais

A Sepia officinalis, conhecida por choco (Portugal, Espanha) faz parte do grupo dos cefalópodes, considerados como espécies promissoras para a diversificação na indústria da aquacultura, e são considerados modelos biológicos para investigação, principalmente, na Neurociência e Fisiologia Animal. No entanto, a produção em grande escala tem sido afetada pela inexistência de alternativas nutricionais para a alimentação. Pesquisas que são desenvolvidas para a descoberta de fontes alternativas de nutrição, estão centradas na análise de componentes químicos dos alimentos no crescimento do choco. A microbiota desempenha um papel importante, particularmente no funcionamento do trato digestivo e do sistema imunitário. Através da produção e metabolização de substâncias a microbiota pode influenciar a fisiologia e desenvolvimento do animal. Assim neste trabalho, o objetivo fundamental foi o de obter informações da potencial associação das comunidades bacterianas em diferentes regiões do sistema digestivo do choco: hepatopâncreas, estomago, ceco, intestino, esófago e divertículo assim como no sistema circulatório, nomeadamente na hemolinfa. Um segundo objetivo foi o de verificar o potencial efeito da alimentação/ jejum nas comunidades microbianas, os animais foram amostrados antes e depois da alimentação e extraídos os órgãos do trato digestivo e hemolinfa. Com base na utilização do 16SRNA ribossomal, o DNA das amostras da hemolinfa e das regiões discretas do trato digestivo foram extraídos e amplificados por PCR e as sequências analisadas com ferramentas bioinformáticas. Os resultados indicaram que os animais amostrados antes da alimentação apresentaram maior diversidade em comparação com os animais amostrados após a alimentação, com a família Mycoplasmataceae a representarem o microbioma fundamental, e as famílias Oxalobacteriaceae e Burkholderaceae o microbioma raro. A hemolinfa foi o local de maior diversidade e o esófago apresentou a maior diversidade no trato digestivo. No seu conjunto, o estudo mostrou diferenças individuais em termos de composição e diversidade taxonómica do microbioma. A utilização desta diversidade na microbiota poderá vir a ser importante como índice de bem-estar animal e para o desenvolvimento de dietas comerciais para a aquacultura da espécie.