Hibridização reversa e sequenciamento na genotipagem do vírus da hepatite C

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Levada,Patrícia Martinez
Data de Publicação: 2010
Outros Autores: Moraes,Camila Fernanda Verdichio de, Corvino,Silvia Maria, Grotto,Rejane Maria Tommasini, Silva,Giovanni Faria, Pardini,Maria Inês de Moura Campos
Tipo de documento: Artigo
Idioma: por
Título da fonte: Revista da Sociedade Brasileira de Medicina Tropical
Texto Completo: http://old.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0037-86822010000200006
Resumo: INTRODUÇÃO: Os métodos de genotipagem do vírus da hepatite C têm sido muito discutidos. O objetivo deste trabalho foi comparar as metodologias de hibridização reversa e sequenciamento direto para a genotipagem do vírus da hepatite C. MÉTODOS: Noventa e uma amostras de plasma de pacientes assistidos na Faculdade de Medicina de Botucatu da Universidade Estadual Paulista foram utilizadas. A genotipagem por hibridização reversa foi realizada utilizando o kit comercial INNO-LiPA® v.1.0. O sequenciamento direto foi efetuado em sequenciador automático utilizando protocolos in house. RESULTADOS: A genotipagem por sequenciamento direto mostrou-se eficiente na resolução dos resultados inconclusivos pelo kit comercial. O kit mostrou resultados errôneos em relação à subtipagem viral. Além disso, a genotipagem por sequenciamento direto revelou um erro do kit com relação à determinação genotípica questionando a eficiência do método também para a identificação do genótipo viral. CONCLUSÕES: A genotipagem realizada por meio de sequenciamento direto permite uma maior acurácia na classificação viral quando comparada à hibridização reversa.
id SBMT-1_d78a27833198056a381744ca981a0647
oai_identifier_str oai:scielo:S0037-86822010000200006
network_acronym_str SBMT-1
network_name_str Revista da Sociedade Brasileira de Medicina Tropical
repository_id_str
spelling Hibridização reversa e sequenciamento na genotipagem do vírus da hepatite CVírus da hepatite CGenotipagemHibridização reversaSequenciamento diretoINTRODUÇÃO: Os métodos de genotipagem do vírus da hepatite C têm sido muito discutidos. O objetivo deste trabalho foi comparar as metodologias de hibridização reversa e sequenciamento direto para a genotipagem do vírus da hepatite C. MÉTODOS: Noventa e uma amostras de plasma de pacientes assistidos na Faculdade de Medicina de Botucatu da Universidade Estadual Paulista foram utilizadas. A genotipagem por hibridização reversa foi realizada utilizando o kit comercial INNO-LiPA® v.1.0. O sequenciamento direto foi efetuado em sequenciador automático utilizando protocolos in house. RESULTADOS: A genotipagem por sequenciamento direto mostrou-se eficiente na resolução dos resultados inconclusivos pelo kit comercial. O kit mostrou resultados errôneos em relação à subtipagem viral. Além disso, a genotipagem por sequenciamento direto revelou um erro do kit com relação à determinação genotípica questionando a eficiência do método também para a identificação do genótipo viral. CONCLUSÕES: A genotipagem realizada por meio de sequenciamento direto permite uma maior acurácia na classificação viral quando comparada à hibridização reversa.Sociedade Brasileira de Medicina Tropical - SBMT2010-04-01info:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/publishedVersiontext/htmlhttp://old.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0037-86822010000200006Revista da Sociedade Brasileira de Medicina Tropical v.43 n.2 2010reponame:Revista da Sociedade Brasileira de Medicina Tropicalinstname:Sociedade Brasileira de Medicina Tropical (SBMT)instacron:SBMT10.1590/S0037-86822010000200006info:eu-repo/semantics/openAccessLevada,Patrícia MartinezMoraes,Camila Fernanda Verdichio deCorvino,Silvia MariaGrotto,Rejane Maria TommasiniSilva,Giovanni FariaPardini,Maria Inês de Moura Campospor2010-04-20T00:00:00Zoai:scielo:S0037-86822010000200006Revistahttps://www.sbmt.org.br/portal/revista/ONGhttps://old.scielo.br/oai/scielo-oai.php||dalmo@rsbmt.uftm.edu.br|| rsbmt@rsbmt.uftm.edu.br1678-98490037-8682opendoar:2010-04-20T00:00Revista da Sociedade Brasileira de Medicina Tropical - Sociedade Brasileira de Medicina Tropical (SBMT)false
dc.title.none.fl_str_mv Hibridização reversa e sequenciamento na genotipagem do vírus da hepatite C
title Hibridização reversa e sequenciamento na genotipagem do vírus da hepatite C
spellingShingle Hibridização reversa e sequenciamento na genotipagem do vírus da hepatite C
Levada,Patrícia Martinez
Vírus da hepatite C
Genotipagem
Hibridização reversa
Sequenciamento direto
title_short Hibridização reversa e sequenciamento na genotipagem do vírus da hepatite C
title_full Hibridização reversa e sequenciamento na genotipagem do vírus da hepatite C
title_fullStr Hibridização reversa e sequenciamento na genotipagem do vírus da hepatite C
title_full_unstemmed Hibridização reversa e sequenciamento na genotipagem do vírus da hepatite C
title_sort Hibridização reversa e sequenciamento na genotipagem do vírus da hepatite C
author Levada,Patrícia Martinez
author_facet Levada,Patrícia Martinez
Moraes,Camila Fernanda Verdichio de
Corvino,Silvia Maria
Grotto,Rejane Maria Tommasini
Silva,Giovanni Faria
Pardini,Maria Inês de Moura Campos
author_role author
author2 Moraes,Camila Fernanda Verdichio de
Corvino,Silvia Maria
Grotto,Rejane Maria Tommasini
Silva,Giovanni Faria
Pardini,Maria Inês de Moura Campos
author2_role author
author
author
author
author
dc.contributor.author.fl_str_mv Levada,Patrícia Martinez
Moraes,Camila Fernanda Verdichio de
Corvino,Silvia Maria
Grotto,Rejane Maria Tommasini
Silva,Giovanni Faria
Pardini,Maria Inês de Moura Campos
dc.subject.por.fl_str_mv Vírus da hepatite C
Genotipagem
Hibridização reversa
Sequenciamento direto
topic Vírus da hepatite C
Genotipagem
Hibridização reversa
Sequenciamento direto
description INTRODUÇÃO: Os métodos de genotipagem do vírus da hepatite C têm sido muito discutidos. O objetivo deste trabalho foi comparar as metodologias de hibridização reversa e sequenciamento direto para a genotipagem do vírus da hepatite C. MÉTODOS: Noventa e uma amostras de plasma de pacientes assistidos na Faculdade de Medicina de Botucatu da Universidade Estadual Paulista foram utilizadas. A genotipagem por hibridização reversa foi realizada utilizando o kit comercial INNO-LiPA® v.1.0. O sequenciamento direto foi efetuado em sequenciador automático utilizando protocolos in house. RESULTADOS: A genotipagem por sequenciamento direto mostrou-se eficiente na resolução dos resultados inconclusivos pelo kit comercial. O kit mostrou resultados errôneos em relação à subtipagem viral. Além disso, a genotipagem por sequenciamento direto revelou um erro do kit com relação à determinação genotípica questionando a eficiência do método também para a identificação do genótipo viral. CONCLUSÕES: A genotipagem realizada por meio de sequenciamento direto permite uma maior acurácia na classificação viral quando comparada à hibridização reversa.
publishDate 2010
dc.date.none.fl_str_mv 2010-04-01
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/article
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
format article
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://old.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0037-86822010000200006
url http://old.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0037-86822010000200006
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.relation.none.fl_str_mv 10.1590/S0037-86822010000200006
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv text/html
dc.publisher.none.fl_str_mv Sociedade Brasileira de Medicina Tropical - SBMT
publisher.none.fl_str_mv Sociedade Brasileira de Medicina Tropical - SBMT
dc.source.none.fl_str_mv Revista da Sociedade Brasileira de Medicina Tropical v.43 n.2 2010
reponame:Revista da Sociedade Brasileira de Medicina Tropical
instname:Sociedade Brasileira de Medicina Tropical (SBMT)
instacron:SBMT
instname_str Sociedade Brasileira de Medicina Tropical (SBMT)
instacron_str SBMT
institution SBMT
reponame_str Revista da Sociedade Brasileira de Medicina Tropical
collection Revista da Sociedade Brasileira de Medicina Tropical
repository.name.fl_str_mv Revista da Sociedade Brasileira de Medicina Tropical - Sociedade Brasileira de Medicina Tropical (SBMT)
repository.mail.fl_str_mv ||dalmo@rsbmt.uftm.edu.br|| rsbmt@rsbmt.uftm.edu.br
_version_ 1752122155728896000