Detecção de locos de características quantitativas (QTL) afetando o crescimento e a carcaça de suínos: um enfoque Bayesiano com o uso de diferentes prioris

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Gonçalves,Tarcisio de Moraes
Data de Publicação: 2008
Outros Autores: Costa,Ana Luísa Lopes da, Laranjo,Juliana Salgado, Rodriguez,Mary Ana Petersen, Rebouças,Geovanne Ferreira
Tipo de documento: Artigo
Idioma: por
Título da fonte: Revista Brasileira de Zootecnia (Online)
Texto Completo: http://old.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982008000200012
Resumo: Foram utilizados 1.129 animais, 298 F1 e 831 F2 para gordura intramuscular (GIM, %) e ganho de peso (GP, g/dia) e 324 F1 e 805 F2 para espessura de toucinho (ET, mm), obtidos por meio do cruzamento de suínos machos da raça Meishan e fêmeas Large White e Landrace. Os animais foram genotipados para marcadores moleculares cobrindo todo o genoma. Foram estudados os cromossomos 1, 2, 4, 5, 6, 7, 13, 14 e19 para ET e GIM e os cromossomos 1, 2, 4, 6, 7, 8, 13, 17 e19 para GP entre 25 e 90 kg de peso vivo (PV). Análises de QTL usando metodologia Bayesiana foram aplicadas mediante o modelo genético estatístico combinando os efeitos Poligênico Infinito (MPI), Poligênico Finito (MPF) e de QTL. Os sumários dos parâmetros estimados foram baseados nas distribuições marginais a posteriori obtidas por Cadeia de Markov, algoritmo de Monte Carlo (MCMC). De modo geral, por meio dos resultados, foi possível evidenciar um QTL para ET, independentemente da priori estudada. Não foi possível detectar QTL para as características GIM e GP com a aplicação desta metodologia, o que pode estar relacionado aos marcadores não-informativos ou à ausência de QTL segregando nos cromossomos estudados. Há vantagens em analisar dados experimentais ajustando modelos genéticos combinados e não considerando unicamente o modelo poligênico ou o oligogênico. As análises ilustraram a utilidade e aplicabilidade do método Bayesiano no qual foram utilizados modelos finitos.
id SBZ-1_6f34a189789bd2716cd09affd1a6f049
oai_identifier_str oai:scielo:S1516-35982008000200012
network_acronym_str SBZ-1
network_name_str Revista Brasileira de Zootecnia (Online)
repository_id_str
spelling Detecção de locos de características quantitativas (QTL) afetando o crescimento e a carcaça de suínos: um enfoque Bayesiano com o uso de diferentes priorisanálise MCMCdetecção de QTLmétodo BayesianoForam utilizados 1.129 animais, 298 F1 e 831 F2 para gordura intramuscular (GIM, %) e ganho de peso (GP, g/dia) e 324 F1 e 805 F2 para espessura de toucinho (ET, mm), obtidos por meio do cruzamento de suínos machos da raça Meishan e fêmeas Large White e Landrace. Os animais foram genotipados para marcadores moleculares cobrindo todo o genoma. Foram estudados os cromossomos 1, 2, 4, 5, 6, 7, 13, 14 e19 para ET e GIM e os cromossomos 1, 2, 4, 6, 7, 8, 13, 17 e19 para GP entre 25 e 90 kg de peso vivo (PV). Análises de QTL usando metodologia Bayesiana foram aplicadas mediante o modelo genético estatístico combinando os efeitos Poligênico Infinito (MPI), Poligênico Finito (MPF) e de QTL. Os sumários dos parâmetros estimados foram baseados nas distribuições marginais a posteriori obtidas por Cadeia de Markov, algoritmo de Monte Carlo (MCMC). De modo geral, por meio dos resultados, foi possível evidenciar um QTL para ET, independentemente da priori estudada. Não foi possível detectar QTL para as características GIM e GP com a aplicação desta metodologia, o que pode estar relacionado aos marcadores não-informativos ou à ausência de QTL segregando nos cromossomos estudados. Há vantagens em analisar dados experimentais ajustando modelos genéticos combinados e não considerando unicamente o modelo poligênico ou o oligogênico. As análises ilustraram a utilidade e aplicabilidade do método Bayesiano no qual foram utilizados modelos finitos.Sociedade Brasileira de Zootecnia2008-02-01info:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/publishedVersiontext/htmlhttp://old.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982008000200012Revista Brasileira de Zootecnia v.37 n.2 2008reponame:Revista Brasileira de Zootecnia (Online)instname:Sociedade Brasileira de Zootecnia (SBZ)instacron:SBZ10.1590/S1516-35982008000200012info:eu-repo/semantics/openAccessGonçalves,Tarcisio de MoraesCosta,Ana Luísa Lopes daLaranjo,Juliana SalgadoRodriguez,Mary Ana PetersenRebouças,Geovanne Ferreirapor2008-01-30T00:00:00Zoai:scielo:S1516-35982008000200012Revistahttps://www.rbz.org.br/pt-br/https://old.scielo.br/oai/scielo-oai.php||bz@sbz.org.br|| secretariarbz@sbz.org.br1806-92901516-3598opendoar:2008-01-30T00:00Revista Brasileira de Zootecnia (Online) - Sociedade Brasileira de Zootecnia (SBZ)false
dc.title.none.fl_str_mv Detecção de locos de características quantitativas (QTL) afetando o crescimento e a carcaça de suínos: um enfoque Bayesiano com o uso de diferentes prioris
title Detecção de locos de características quantitativas (QTL) afetando o crescimento e a carcaça de suínos: um enfoque Bayesiano com o uso de diferentes prioris
spellingShingle Detecção de locos de características quantitativas (QTL) afetando o crescimento e a carcaça de suínos: um enfoque Bayesiano com o uso de diferentes prioris
Gonçalves,Tarcisio de Moraes
análise MCMC
detecção de QTL
método Bayesiano
title_short Detecção de locos de características quantitativas (QTL) afetando o crescimento e a carcaça de suínos: um enfoque Bayesiano com o uso de diferentes prioris
title_full Detecção de locos de características quantitativas (QTL) afetando o crescimento e a carcaça de suínos: um enfoque Bayesiano com o uso de diferentes prioris
title_fullStr Detecção de locos de características quantitativas (QTL) afetando o crescimento e a carcaça de suínos: um enfoque Bayesiano com o uso de diferentes prioris
title_full_unstemmed Detecção de locos de características quantitativas (QTL) afetando o crescimento e a carcaça de suínos: um enfoque Bayesiano com o uso de diferentes prioris
title_sort Detecção de locos de características quantitativas (QTL) afetando o crescimento e a carcaça de suínos: um enfoque Bayesiano com o uso de diferentes prioris
author Gonçalves,Tarcisio de Moraes
author_facet Gonçalves,Tarcisio de Moraes
Costa,Ana Luísa Lopes da
Laranjo,Juliana Salgado
Rodriguez,Mary Ana Petersen
Rebouças,Geovanne Ferreira
author_role author
author2 Costa,Ana Luísa Lopes da
Laranjo,Juliana Salgado
Rodriguez,Mary Ana Petersen
Rebouças,Geovanne Ferreira
author2_role author
author
author
author
dc.contributor.author.fl_str_mv Gonçalves,Tarcisio de Moraes
Costa,Ana Luísa Lopes da
Laranjo,Juliana Salgado
Rodriguez,Mary Ana Petersen
Rebouças,Geovanne Ferreira
dc.subject.por.fl_str_mv análise MCMC
detecção de QTL
método Bayesiano
topic análise MCMC
detecção de QTL
método Bayesiano
description Foram utilizados 1.129 animais, 298 F1 e 831 F2 para gordura intramuscular (GIM, %) e ganho de peso (GP, g/dia) e 324 F1 e 805 F2 para espessura de toucinho (ET, mm), obtidos por meio do cruzamento de suínos machos da raça Meishan e fêmeas Large White e Landrace. Os animais foram genotipados para marcadores moleculares cobrindo todo o genoma. Foram estudados os cromossomos 1, 2, 4, 5, 6, 7, 13, 14 e19 para ET e GIM e os cromossomos 1, 2, 4, 6, 7, 8, 13, 17 e19 para GP entre 25 e 90 kg de peso vivo (PV). Análises de QTL usando metodologia Bayesiana foram aplicadas mediante o modelo genético estatístico combinando os efeitos Poligênico Infinito (MPI), Poligênico Finito (MPF) e de QTL. Os sumários dos parâmetros estimados foram baseados nas distribuições marginais a posteriori obtidas por Cadeia de Markov, algoritmo de Monte Carlo (MCMC). De modo geral, por meio dos resultados, foi possível evidenciar um QTL para ET, independentemente da priori estudada. Não foi possível detectar QTL para as características GIM e GP com a aplicação desta metodologia, o que pode estar relacionado aos marcadores não-informativos ou à ausência de QTL segregando nos cromossomos estudados. Há vantagens em analisar dados experimentais ajustando modelos genéticos combinados e não considerando unicamente o modelo poligênico ou o oligogênico. As análises ilustraram a utilidade e aplicabilidade do método Bayesiano no qual foram utilizados modelos finitos.
publishDate 2008
dc.date.none.fl_str_mv 2008-02-01
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/article
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
format article
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://old.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982008000200012
url http://old.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982008000200012
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.relation.none.fl_str_mv 10.1590/S1516-35982008000200012
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv text/html
dc.publisher.none.fl_str_mv Sociedade Brasileira de Zootecnia
publisher.none.fl_str_mv Sociedade Brasileira de Zootecnia
dc.source.none.fl_str_mv Revista Brasileira de Zootecnia v.37 n.2 2008
reponame:Revista Brasileira de Zootecnia (Online)
instname:Sociedade Brasileira de Zootecnia (SBZ)
instacron:SBZ
instname_str Sociedade Brasileira de Zootecnia (SBZ)
instacron_str SBZ
institution SBZ
reponame_str Revista Brasileira de Zootecnia (Online)
collection Revista Brasileira de Zootecnia (Online)
repository.name.fl_str_mv Revista Brasileira de Zootecnia (Online) - Sociedade Brasileira de Zootecnia (SBZ)
repository.mail.fl_str_mv ||bz@sbz.org.br|| secretariarbz@sbz.org.br
_version_ 1750318142424350720