Estudo de azaçúcares como inibidores de Glge, uma maltosiltransferase de Mycobacterium tuberculosis, por meio de docking molecular e da avaliação de interações moleculares

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Pedroso, Sofia Dallasta
Data de Publicação: 2023
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UFSCAR
Texto Completo: https://repositorio.ufscar.br/handle/ufscar/18968
Resumo: Tuberculosis is still a worrying disease around the world, especially in low- and middle-income countries. Current treatment for tuberculosis involves a combination of antibiotics, however, it is often ineffective due to drug resistance and the difficulty of completely eliminating the disease-causing bacteria, namely Mycobacterium tuberculosis. In this context, the use of molecular docking is a promising tool in the development of new drugs for the treatment of tuberculosis. Molecular docking consists of the computational analysis of the fitting of a drug candidate molecule with bacterial proteins, thus allowing the identification of promising compounds and optimizing their effectiveness. Its use aims to accelerate the development of new drugs, improving the effectiveness of tuberculosis treatment. In this context, azasugars have been studied as possible drugs for the treatment of tuberculosis, due to their ability to inhibit the enzyme maltosyltransferase (GlgE), essential for the survival of Mycobacterium tuberculosis. Furthermore, azasugars have low toxicity and high selectivity, increasing their therapeutic efficacy. In this sense, in the present work we describe the study of three series of azasugars with the aim of evaluating their potential as anti-tuberculosis drugs targeting GlgE. The results point to a compound, called A532 in this study, as a substance of pharmacological interest for this purpose, due to its favorable interaction with the active site of the enzyme, explained by the existence of a network of π interactions and hydrogen bonds. Furthermore, the results presented provide further information about the structure of possible GlgE-inhibiting azasugars and their relationship with the residues that make up its active site.
id SCAR_1e7e495fc1b81944e88605a0b26452da
oai_identifier_str oai:repositorio.ufscar.br:ufscar/18968
network_acronym_str SCAR
network_name_str Repositório Institucional da UFSCAR
repository_id_str 4322
spelling Pedroso, Sofia DallastaZukerman-Schpector, Juliohttp://lattes.cnpq.br/4252331837170383http://lattes.cnpq.br/8054606648208210https://orcid.org/0000-0003-4490-5373https://orcid.org/0000-0003-2191-40742023-11-30T17:11:14Z2023-11-30T17:11:14Z2023-11-13PEDROSO, Sofia Dallasta. Estudo de azaçúcares como inibidores de Glge, uma maltosiltransferase de Mycobacterium tuberculosis, por meio de docking molecular e da avaliação de interações moleculares. 2023. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) – Universidade Federal de São Carlos, São Carlos, 2023. Disponível em: https://repositorio.ufscar.br/handle/ufscar/18968.https://repositorio.ufscar.br/handle/ufscar/18968Tuberculosis is still a worrying disease around the world, especially in low- and middle-income countries. Current treatment for tuberculosis involves a combination of antibiotics, however, it is often ineffective due to drug resistance and the difficulty of completely eliminating the disease-causing bacteria, namely Mycobacterium tuberculosis. In this context, the use of molecular docking is a promising tool in the development of new drugs for the treatment of tuberculosis. Molecular docking consists of the computational analysis of the fitting of a drug candidate molecule with bacterial proteins, thus allowing the identification of promising compounds and optimizing their effectiveness. Its use aims to accelerate the development of new drugs, improving the effectiveness of tuberculosis treatment. In this context, azasugars have been studied as possible drugs for the treatment of tuberculosis, due to their ability to inhibit the enzyme maltosyltransferase (GlgE), essential for the survival of Mycobacterium tuberculosis. Furthermore, azasugars have low toxicity and high selectivity, increasing their therapeutic efficacy. In this sense, in the present work we describe the study of three series of azasugars with the aim of evaluating their potential as anti-tuberculosis drugs targeting GlgE. The results point to a compound, called A532 in this study, as a substance of pharmacological interest for this purpose, due to its favorable interaction with the active site of the enzyme, explained by the existence of a network of π interactions and hydrogen bonds. Furthermore, the results presented provide further information about the structure of possible GlgE-inhibiting azasugars and their relationship with the residues that make up its active site.A tuberculose é uma doença ainda preocupante em todo o mundo, especialmente em países de baixa e média renda. O tratamento atual para a tuberculose envolve uma combinação de antibióticos, no entanto, frequentemente é ineficaz devido à resistência aos medicamentos e à dificuldade de eliminar completamente a bactéria causadora da doença, Mycobacterium tuberculosis. Nesse contexto, o uso do docking molecular é uma ferramenta promissora no desenvolvimento de novos medicamentos para o tratamento da tuberculose. O docking molecular consiste na análise computacional do encaixe de moléculas candidatas a fármacos com proteínas da bactéria, permitindo assim identificar compostos promissores e ainda otimizar sua eficácia, o seu uso visa acelerar o desenvolvimento de novos medicamentos, melhorando a eficácia do tratamento da tuberculose. Neste contexto os azaçúcares têm sido estudados como possíveis fármacos para o tratamento da tuberculose, devido à sua capacidade de inibir a enzima maltosiltransferase (GlgE), essencial para a sobrevivência do Mycobacterium tuberculosis. Além disso, os azaçúcares apresentam baixa toxicidade e alta seletividade, aumentando sua eficácia terapêutica. Nesse sentido, no presente trabalho descrevemos o estudo três séries de azaçúcares com o objetivo de avaliar seu potencial como anti-tuberculósicos com alvo na GlgE. Os resultados apontam para um composto, denominado A532 neste estudo, como uma substância de interesse farmacológico para esse fim, devido à sua interação favorável com o sítio ativo da enzima, explicada pela existência de uma rede de interações π e ligações de hidrogênio. Além disso, os resultados apresentados trazem maiores informações sobre a estrutura de possíveis azaçúcares inibidores de GlgE e sua relação com os resíduos que compõem o sítio ativo.Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)164735/2021-6porUniversidade Federal de São CarlosCâmpus São CarlosPrograma de Pós-Graduação em Biotecnologia - PPGBiotecUFSCarAttribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 Brazilhttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/br/info:eu-repo/semantics/openAccessTuberculoseGlgEMaltosiltransferaseDockingCIENCIAS BIOLOGICAS::FARMACOLOGIA::FARMACOLOGIA BIOQUIMICA E MOLECULAREstudo de azaçúcares como inibidores de Glge, uma maltosiltransferase de Mycobacterium tuberculosis, por meio de docking molecular e da avaliação de interações molecularesStudy of azasugars as inhibitors of Glge, a maltosyltransferase from Mycobacterium tuberculosis, through molecular docking and evaluation of molecular interactionsinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisreponame:Repositório Institucional da UFSCARinstname:Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR)instacron:UFSCARORIGINALDissertação Sofia Dallasta Pedroso.pdfDissertação Sofia Dallasta Pedroso.pdfDissertação corrigida após defesa de Mestradoapplication/pdf3903903https://repositorio.ufscar.br/bitstream/ufscar/18968/1/Disserta%c3%a7%c3%a3o%20Sofia%20Dallasta%20Pedroso.pdfce4df1504c15f9a1d3f6a9b57282983fMD51CC-LICENSElicense_rdflicense_rdfapplication/rdf+xml; charset=utf-8810https://repositorio.ufscar.br/bitstream/ufscar/18968/2/license_rdff337d95da1fce0a22c77480e5e9a7aecMD52TEXTDissertação Sofia Dallasta Pedroso.pdf.txtDissertação Sofia Dallasta Pedroso.pdf.txtExtracted texttext/plain125519https://repositorio.ufscar.br/bitstream/ufscar/18968/3/Disserta%c3%a7%c3%a3o%20Sofia%20Dallasta%20Pedroso.pdf.txt2f214ba4f0fa66f0f39e23313a5419a5MD53ufscar/189682024-05-14 17:22:49.735oai:repositorio.ufscar.br:ufscar/18968Repositório InstitucionalPUBhttps://repositorio.ufscar.br/oai/requestopendoar:43222024-05-14T17:22:49Repositório Institucional da UFSCAR - Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR)false
dc.title.por.fl_str_mv Estudo de azaçúcares como inibidores de Glge, uma maltosiltransferase de Mycobacterium tuberculosis, por meio de docking molecular e da avaliação de interações moleculares
dc.title.alternative.por.fl_str_mv Study of azasugars as inhibitors of Glge, a maltosyltransferase from Mycobacterium tuberculosis, through molecular docking and evaluation of molecular interactions
title Estudo de azaçúcares como inibidores de Glge, uma maltosiltransferase de Mycobacterium tuberculosis, por meio de docking molecular e da avaliação de interações moleculares
spellingShingle Estudo de azaçúcares como inibidores de Glge, uma maltosiltransferase de Mycobacterium tuberculosis, por meio de docking molecular e da avaliação de interações moleculares
Pedroso, Sofia Dallasta
Tuberculose
GlgE
Maltosiltransferase
Docking
CIENCIAS BIOLOGICAS::FARMACOLOGIA::FARMACOLOGIA BIOQUIMICA E MOLECULAR
title_short Estudo de azaçúcares como inibidores de Glge, uma maltosiltransferase de Mycobacterium tuberculosis, por meio de docking molecular e da avaliação de interações moleculares
title_full Estudo de azaçúcares como inibidores de Glge, uma maltosiltransferase de Mycobacterium tuberculosis, por meio de docking molecular e da avaliação de interações moleculares
title_fullStr Estudo de azaçúcares como inibidores de Glge, uma maltosiltransferase de Mycobacterium tuberculosis, por meio de docking molecular e da avaliação de interações moleculares
title_full_unstemmed Estudo de azaçúcares como inibidores de Glge, uma maltosiltransferase de Mycobacterium tuberculosis, por meio de docking molecular e da avaliação de interações moleculares
title_sort Estudo de azaçúcares como inibidores de Glge, uma maltosiltransferase de Mycobacterium tuberculosis, por meio de docking molecular e da avaliação de interações moleculares
author Pedroso, Sofia Dallasta
author_facet Pedroso, Sofia Dallasta
author_role author
dc.contributor.authorlattes.por.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/8054606648208210
dc.contributor.authororcid.por.fl_str_mv https://orcid.org/0000-0003-4490-5373
dc.contributor.advisor1orcid.por.fl_str_mv https://orcid.org/0000-0003-2191-4074
dc.contributor.author.fl_str_mv Pedroso, Sofia Dallasta
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Zukerman-Schpector, Julio
dc.contributor.advisor1Lattes.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/4252331837170383
contributor_str_mv Zukerman-Schpector, Julio
dc.subject.por.fl_str_mv Tuberculose
GlgE
Maltosiltransferase
topic Tuberculose
GlgE
Maltosiltransferase
Docking
CIENCIAS BIOLOGICAS::FARMACOLOGIA::FARMACOLOGIA BIOQUIMICA E MOLECULAR
dc.subject.eng.fl_str_mv Docking
dc.subject.cnpq.fl_str_mv CIENCIAS BIOLOGICAS::FARMACOLOGIA::FARMACOLOGIA BIOQUIMICA E MOLECULAR
description Tuberculosis is still a worrying disease around the world, especially in low- and middle-income countries. Current treatment for tuberculosis involves a combination of antibiotics, however, it is often ineffective due to drug resistance and the difficulty of completely eliminating the disease-causing bacteria, namely Mycobacterium tuberculosis. In this context, the use of molecular docking is a promising tool in the development of new drugs for the treatment of tuberculosis. Molecular docking consists of the computational analysis of the fitting of a drug candidate molecule with bacterial proteins, thus allowing the identification of promising compounds and optimizing their effectiveness. Its use aims to accelerate the development of new drugs, improving the effectiveness of tuberculosis treatment. In this context, azasugars have been studied as possible drugs for the treatment of tuberculosis, due to their ability to inhibit the enzyme maltosyltransferase (GlgE), essential for the survival of Mycobacterium tuberculosis. Furthermore, azasugars have low toxicity and high selectivity, increasing their therapeutic efficacy. In this sense, in the present work we describe the study of three series of azasugars with the aim of evaluating their potential as anti-tuberculosis drugs targeting GlgE. The results point to a compound, called A532 in this study, as a substance of pharmacological interest for this purpose, due to its favorable interaction with the active site of the enzyme, explained by the existence of a network of π interactions and hydrogen bonds. Furthermore, the results presented provide further information about the structure of possible GlgE-inhibiting azasugars and their relationship with the residues that make up its active site.
publishDate 2023
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2023-11-30T17:11:14Z
dc.date.available.fl_str_mv 2023-11-30T17:11:14Z
dc.date.issued.fl_str_mv 2023-11-13
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.citation.fl_str_mv PEDROSO, Sofia Dallasta. Estudo de azaçúcares como inibidores de Glge, uma maltosiltransferase de Mycobacterium tuberculosis, por meio de docking molecular e da avaliação de interações moleculares. 2023. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) – Universidade Federal de São Carlos, São Carlos, 2023. Disponível em: https://repositorio.ufscar.br/handle/ufscar/18968.
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://repositorio.ufscar.br/handle/ufscar/18968
identifier_str_mv PEDROSO, Sofia Dallasta. Estudo de azaçúcares como inibidores de Glge, uma maltosiltransferase de Mycobacterium tuberculosis, por meio de docking molecular e da avaliação de interações moleculares. 2023. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) – Universidade Federal de São Carlos, São Carlos, 2023. Disponível em: https://repositorio.ufscar.br/handle/ufscar/18968.
url https://repositorio.ufscar.br/handle/ufscar/18968
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv Attribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 Brazil
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/br/
info:eu-repo/semantics/openAccess
rights_invalid_str_mv Attribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 Brazil
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/br/
eu_rights_str_mv openAccess
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal de São Carlos
Câmpus São Carlos
dc.publisher.program.fl_str_mv Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia - PPGBiotec
dc.publisher.initials.fl_str_mv UFSCar
publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal de São Carlos
Câmpus São Carlos
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da UFSCAR
instname:Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR)
instacron:UFSCAR
instname_str Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR)
instacron_str UFSCAR
institution UFSCAR
reponame_str Repositório Institucional da UFSCAR
collection Repositório Institucional da UFSCAR
bitstream.url.fl_str_mv https://repositorio.ufscar.br/bitstream/ufscar/18968/1/Disserta%c3%a7%c3%a3o%20Sofia%20Dallasta%20Pedroso.pdf
https://repositorio.ufscar.br/bitstream/ufscar/18968/2/license_rdf
https://repositorio.ufscar.br/bitstream/ufscar/18968/3/Disserta%c3%a7%c3%a3o%20Sofia%20Dallasta%20Pedroso.pdf.txt
bitstream.checksum.fl_str_mv ce4df1504c15f9a1d3f6a9b57282983f
f337d95da1fce0a22c77480e5e9a7aec
2f214ba4f0fa66f0f39e23313a5419a5
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UFSCAR - Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR)
repository.mail.fl_str_mv
_version_ 1813715672079794176