Variações no gene yolk em moscas das frutas do grupo fraterculus
Autor(a) principal: | |
---|---|
Data de Publicação: | 2009 |
Tipo de documento: | Dissertação |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório Institucional da UFSCAR |
Texto Completo: | https://repositorio.ufscar.br/handle/ufscar/5458 |
Resumo: | Species of the fraterculus group are associated to the biggest damages to fruit crops due to the fact that they attack indiscriminately green and ripe fruits, making them pests of great economic importance. These species are hard to tell apart, even showing some potential criptic species. The understanding of the populational structure and biology of this species group is of paramount importance to strategies of management and control of these pests. Here, we investigate variation on the gene yolk em 37 individuals sampled throughout the species distribution in Brazil seeking to better understand the populational structure of this species group in Brazil. Our data indicated existence of recombination, which lead us to analyze three different regions in the gene, 5 , mid, and 3 . These regions show high levels of nucleotide diversity intra and interspecifically for all three gene regions investigated. The use of Nested Clade Phylogenetic Analysis independently used on these regions indicate two main results that occurred more than one throughout our analyses. The first is a range expansion from north-NE populations towards the south, mostly related to specimens of Anastrepha fraterculus. The second common event, detected eight times, is restricted gene flow with isolation by distance (IBD). Dating of such events indicated that they are temporarily congruent which might indicate that the lack of IBD in other levels of the analysis might be caused either by sampling limitations or an excess of local gene flow that tampers out as we move farther in space. Our results of the gene yolk have provided us with a better understanding of the levels of local variation of this marker of for the species that may help us determine the evolutionary processes that shaped the species group current distribution. |
id |
SCAR_67b5dca4ca5e2a612b1f5b2f23d13477 |
---|---|
oai_identifier_str |
oai:repositorio.ufscar.br:ufscar/5458 |
network_acronym_str |
SCAR |
network_name_str |
Repositório Institucional da UFSCAR |
repository_id_str |
4322 |
spelling |
Oliveira, Gustavo Castro deBrito, Reinaldo Alves dehttp://lattes.cnpq.br/8253066295947754http://lattes.cnpq.br/0816557348697162e80b9a2a-50f4-41e2-bd91-dfa65c7d2a4a2016-06-02T20:21:21Z2009-12-092016-06-02T20:21:21Z2009-06-30OLIVEIRA, Gustavo Castro de. Variações no gene yolk em moscas das frutas do grupo fraterculus. 2009. 90 f. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas) - Universidade Federal de São Carlos, São Carlos, 2009.https://repositorio.ufscar.br/handle/ufscar/5458Species of the fraterculus group are associated to the biggest damages to fruit crops due to the fact that they attack indiscriminately green and ripe fruits, making them pests of great economic importance. These species are hard to tell apart, even showing some potential criptic species. The understanding of the populational structure and biology of this species group is of paramount importance to strategies of management and control of these pests. Here, we investigate variation on the gene yolk em 37 individuals sampled throughout the species distribution in Brazil seeking to better understand the populational structure of this species group in Brazil. Our data indicated existence of recombination, which lead us to analyze three different regions in the gene, 5 , mid, and 3 . These regions show high levels of nucleotide diversity intra and interspecifically for all three gene regions investigated. The use of Nested Clade Phylogenetic Analysis independently used on these regions indicate two main results that occurred more than one throughout our analyses. The first is a range expansion from north-NE populations towards the south, mostly related to specimens of Anastrepha fraterculus. The second common event, detected eight times, is restricted gene flow with isolation by distance (IBD). Dating of such events indicated that they are temporarily congruent which might indicate that the lack of IBD in other levels of the analysis might be caused either by sampling limitations or an excess of local gene flow that tampers out as we move farther in space. Our results of the gene yolk have provided us with a better understanding of the levels of local variation of this marker of for the species that may help us determine the evolutionary processes that shaped the species group current distribution.Espécies do grupo fraterculus estão relacionadas com os maiores danos a culturas de frutas carnosas por atacar frutos verdes e maduros indistintamente, o que as torna pragas de grande importância econômica. Contudo, estas espécies são de difícil distinção, com a existência potencial de diversas espécies crípticas. Dessa forma, o entendimento da biologia e, particularmente, da estrutura populacional desses insetos-praga tem grande importância para o desenvolvimento de novas estratégias de manejo. Neste trabalho, investigamos a variação no gene yolk em 37 indivíduos ao longo da distribuição do grupo no Brasil para conhecermos melhor o padrão estrutural das espécies do grupo fraterculus. Os dados indicam a existência de recombinação, de forma que analisamos a região amplificada separadamente por regiões distintas: 5 , mid e 3 . Análises de polimorfismos nestas regiões apontaram para altos valores de diversidade nucleotídicas intra e interespecíficas para as três regiões gênicas em questão, sendo estes valores maiores para a região 3 . A metodologia da Análise dos Clados Aninhados (NCPA) foi utilizada para inferências de possíveis relações entre a configuração das redes haplotípicas com o padrão de distribuição geográfica considerando estas três regiões distintas. Através do uso desta metodologia, observamos dois eventos principais que podem estar influenciando a distribuição das espécies do grupo fraterculus no território nacional. A primeira inferência refere-se à expansão populacional no sentido Centro-Sul do Brasil, referente preferencialmente à espécie Anastrepha fraterculus. O segundo evento de inferência indica fluxo gênico restrito com isolamento por distância ao longo da distribuição global dos espécimes amostrados. A datação destes eventos indica uma congruência temporal, o que pode indicar que a não ocorrência de fluxo gênico em clados inferiores possa estar associado a restrições amostrais, uma vez que nossa amostragem é de fato restrita. Além disso, em populações mais próximas, o fluxo gênico pode estar ocorrendo com freqüência suficiente para promover a homogeneização genética das populações. Os resultados obtidos mediante a análise das seqüências do gene yolk nos permitiu um melhor conhecimento àcerca dos níveis de variação referentes a esse marcador, bem como determinar os processos que possam estar envolvidos no padrão de distribuição atual das espécies do grupo fraterculus no território nacional.Financiadora de Estudos e Projetosapplication/pdfporUniversidade Federal de São CarlosPrograma de Pós-Graduação em Genética Evolutiva e Biologia Molecular - PPGGEvUFSCarBRGenética de populaçõesMosca-das-frutasGrupo fraterculusYolkFilogeografiaAnastrephaGroup fraterculusYolkNested clade phylogeographical analysisCIENCIAS BIOLOGICAS::GENETICAVariações no gene yolk em moscas das frutas do grupo fraterculusinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesis-1-1e4ebf16c-a933-4cae-b428-d05e5cc0dc96info:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UFSCARinstname:Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR)instacron:UFSCARORIGINAL2667.pdfapplication/pdf1236621https://repositorio.ufscar.br/bitstream/ufscar/5458/1/2667.pdf9702ce62be0433e7639201366d6444aaMD51THUMBNAIL2667.pdf.jpg2667.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg7415https://repositorio.ufscar.br/bitstream/ufscar/5458/2/2667.pdf.jpgb75c0e5db865910a48e7e1b19ed0c6edMD52ufscar/54582023-09-18 18:31:07.661oai:repositorio.ufscar.br:ufscar/5458Repositório InstitucionalPUBhttps://repositorio.ufscar.br/oai/requestopendoar:43222023-09-18T18:31:07Repositório Institucional da UFSCAR - Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR)false |
dc.title.por.fl_str_mv |
Variações no gene yolk em moscas das frutas do grupo fraterculus |
title |
Variações no gene yolk em moscas das frutas do grupo fraterculus |
spellingShingle |
Variações no gene yolk em moscas das frutas do grupo fraterculus Oliveira, Gustavo Castro de Genética de populações Mosca-das-frutas Grupo fraterculus Yolk Filogeografia Anastrepha Group fraterculus Yolk Nested clade phylogeographical analysis CIENCIAS BIOLOGICAS::GENETICA |
title_short |
Variações no gene yolk em moscas das frutas do grupo fraterculus |
title_full |
Variações no gene yolk em moscas das frutas do grupo fraterculus |
title_fullStr |
Variações no gene yolk em moscas das frutas do grupo fraterculus |
title_full_unstemmed |
Variações no gene yolk em moscas das frutas do grupo fraterculus |
title_sort |
Variações no gene yolk em moscas das frutas do grupo fraterculus |
author |
Oliveira, Gustavo Castro de |
author_facet |
Oliveira, Gustavo Castro de |
author_role |
author |
dc.contributor.authorlattes.por.fl_str_mv |
http://lattes.cnpq.br/0816557348697162 |
dc.contributor.author.fl_str_mv |
Oliveira, Gustavo Castro de |
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv |
Brito, Reinaldo Alves de |
dc.contributor.advisor1Lattes.fl_str_mv |
http://lattes.cnpq.br/8253066295947754 |
dc.contributor.authorID.fl_str_mv |
e80b9a2a-50f4-41e2-bd91-dfa65c7d2a4a |
contributor_str_mv |
Brito, Reinaldo Alves de |
dc.subject.por.fl_str_mv |
Genética de populações Mosca-das-frutas Grupo fraterculus Yolk Filogeografia |
topic |
Genética de populações Mosca-das-frutas Grupo fraterculus Yolk Filogeografia Anastrepha Group fraterculus Yolk Nested clade phylogeographical analysis CIENCIAS BIOLOGICAS::GENETICA |
dc.subject.eng.fl_str_mv |
Anastrepha Group fraterculus Yolk Nested clade phylogeographical analysis |
dc.subject.cnpq.fl_str_mv |
CIENCIAS BIOLOGICAS::GENETICA |
description |
Species of the fraterculus group are associated to the biggest damages to fruit crops due to the fact that they attack indiscriminately green and ripe fruits, making them pests of great economic importance. These species are hard to tell apart, even showing some potential criptic species. The understanding of the populational structure and biology of this species group is of paramount importance to strategies of management and control of these pests. Here, we investigate variation on the gene yolk em 37 individuals sampled throughout the species distribution in Brazil seeking to better understand the populational structure of this species group in Brazil. Our data indicated existence of recombination, which lead us to analyze three different regions in the gene, 5 , mid, and 3 . These regions show high levels of nucleotide diversity intra and interspecifically for all three gene regions investigated. The use of Nested Clade Phylogenetic Analysis independently used on these regions indicate two main results that occurred more than one throughout our analyses. The first is a range expansion from north-NE populations towards the south, mostly related to specimens of Anastrepha fraterculus. The second common event, detected eight times, is restricted gene flow with isolation by distance (IBD). Dating of such events indicated that they are temporarily congruent which might indicate that the lack of IBD in other levels of the analysis might be caused either by sampling limitations or an excess of local gene flow that tampers out as we move farther in space. Our results of the gene yolk have provided us with a better understanding of the levels of local variation of this marker of for the species that may help us determine the evolutionary processes that shaped the species group current distribution. |
publishDate |
2009 |
dc.date.available.fl_str_mv |
2009-12-09 2016-06-02T20:21:21Z |
dc.date.issued.fl_str_mv |
2009-06-30 |
dc.date.accessioned.fl_str_mv |
2016-06-02T20:21:21Z |
dc.type.status.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/publishedVersion |
dc.type.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/masterThesis |
format |
masterThesis |
status_str |
publishedVersion |
dc.identifier.citation.fl_str_mv |
OLIVEIRA, Gustavo Castro de. Variações no gene yolk em moscas das frutas do grupo fraterculus. 2009. 90 f. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas) - Universidade Federal de São Carlos, São Carlos, 2009. |
dc.identifier.uri.fl_str_mv |
https://repositorio.ufscar.br/handle/ufscar/5458 |
identifier_str_mv |
OLIVEIRA, Gustavo Castro de. Variações no gene yolk em moscas das frutas do grupo fraterculus. 2009. 90 f. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas) - Universidade Federal de São Carlos, São Carlos, 2009. |
url |
https://repositorio.ufscar.br/handle/ufscar/5458 |
dc.language.iso.fl_str_mv |
por |
language |
por |
dc.relation.confidence.fl_str_mv |
-1 -1 |
dc.relation.authority.fl_str_mv |
e4ebf16c-a933-4cae-b428-d05e5cc0dc96 |
dc.rights.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/openAccess |
eu_rights_str_mv |
openAccess |
dc.format.none.fl_str_mv |
application/pdf |
dc.publisher.none.fl_str_mv |
Universidade Federal de São Carlos |
dc.publisher.program.fl_str_mv |
Programa de Pós-Graduação em Genética Evolutiva e Biologia Molecular - PPGGEv |
dc.publisher.initials.fl_str_mv |
UFSCar |
dc.publisher.country.fl_str_mv |
BR |
publisher.none.fl_str_mv |
Universidade Federal de São Carlos |
dc.source.none.fl_str_mv |
reponame:Repositório Institucional da UFSCAR instname:Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR) instacron:UFSCAR |
instname_str |
Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR) |
instacron_str |
UFSCAR |
institution |
UFSCAR |
reponame_str |
Repositório Institucional da UFSCAR |
collection |
Repositório Institucional da UFSCAR |
bitstream.url.fl_str_mv |
https://repositorio.ufscar.br/bitstream/ufscar/5458/1/2667.pdf https://repositorio.ufscar.br/bitstream/ufscar/5458/2/2667.pdf.jpg |
bitstream.checksum.fl_str_mv |
9702ce62be0433e7639201366d6444aa b75c0e5db865910a48e7e1b19ed0c6ed |
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv |
MD5 MD5 |
repository.name.fl_str_mv |
Repositório Institucional da UFSCAR - Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR) |
repository.mail.fl_str_mv |
|
_version_ |
1813715544025595904 |