Otimização da purificação e caracterização adicional de uma desintegrina-RGD recombinante de Bothrops alternatus e seu efeito em células endoteliais humanas (HUVEC)

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Pontes, Carmen Lucia Salla
Data de Publicação: 2006
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UFSCAR
Texto Completo: https://repositorio.ufscar.br/handle/ufscar/5435
Resumo: Disintegrins are snake venom protein, of low molecular weight, rich in cysteines and RGDcontaining peptides that bind specifically to integrins αIIbβ3, α5β1, and αvβ3 expressed on platelets, endothelial and tumor cells. The biological effects of these peptides are related with biological process of cellular adhesion where receptors called integrins are presents. This dissertation describes the optimization of purification and additional characterization of a recombinant RGD-disintegrin of Bothrops alternatus, DisBa-01.. The DisBa-01 is a recombinant RGD-disintegrin, which interacts with αIIbβ3 integrin, inhibiting platelet aggregation and proliferation of endothelial and some tumor cells. In this work, a new protocol of purification was proposed for most efficient purification of the DisBa-01. The recombinant disintegrin, DisBa-01, was expressed in an optimizedbacterial system (Escherichia coli BL21(DE3) pET28a+DisBa-01) and purified by affinity chromatography. In this new protocol, the product of the purification in nickel column is submitted ion exchange chromatography. The use of the ion exchange chromatography as second step for purification increased the purity degree and the protein yield. The purified protein had its N-Terminal portion sequenced in 20 amino acids residues and its molecular mass determined by mass spectrometry. The mass spectrometry assay confirmed the mass of the DisBa-01 as 11.658 Da. The RGD-disintegrin pure had the tag of polihistidinas removed with thrombin. The cleavage of the tag of histidinas with thrombin was efficient. Polyclonal antibodies against DisBa-01 have also been produced in mice. The reactivity of these antibodies was observed through imunoblotting. These results provided one better form of obtain the pure protein as well as significant additional information for a better characterization of recombinant RGDdisintegrin, DisBa-01, which could be useful for the study of RGD-disintegrin, recombinant or native, and integrin.
id SCAR_b23023d1b2041374a9862f9b4115b2f3
oai_identifier_str oai:repositorio.ufscar.br:ufscar/5435
network_acronym_str SCAR
network_name_str Repositório Institucional da UFSCAR
repository_id_str 4322
spelling Pontes, Carmen Lucia SallaAraújo, Heloísa Sobreiro Selistre dehttp://genos.cnpq.br:12010/dwlattes/owa/prc_imp_cv_int?f_cod=K4787059Y2http://lattes.cnpq.br/7468571768190030bd0a537d-c540-4f93-99cf-6cdd344f040e2016-06-02T20:21:18Z2007-07-062016-06-02T20:21:18Z2006-11-23PONTES, Carmen Lucia Salla. Otimização da purificação e caracterização adicional de uma desintegrina-RGD recombinante de Bothrops alternatus e seu efeito em células endoteliais humanas (HUVEC).. 2006. 140 f. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas) - Universidade Federal de São Carlos, São Carlos, 2006.https://repositorio.ufscar.br/handle/ufscar/5435Disintegrins are snake venom protein, of low molecular weight, rich in cysteines and RGDcontaining peptides that bind specifically to integrins αIIbβ3, α5β1, and αvβ3 expressed on platelets, endothelial and tumor cells. The biological effects of these peptides are related with biological process of cellular adhesion where receptors called integrins are presents. This dissertation describes the optimization of purification and additional characterization of a recombinant RGD-disintegrin of Bothrops alternatus, DisBa-01.. The DisBa-01 is a recombinant RGD-disintegrin, which interacts with αIIbβ3 integrin, inhibiting platelet aggregation and proliferation of endothelial and some tumor cells. In this work, a new protocol of purification was proposed for most efficient purification of the DisBa-01. The recombinant disintegrin, DisBa-01, was expressed in an optimizedbacterial system (Escherichia coli BL21(DE3) pET28a+DisBa-01) and purified by affinity chromatography. In this new protocol, the product of the purification in nickel column is submitted ion exchange chromatography. The use of the ion exchange chromatography as second step for purification increased the purity degree and the protein yield. The purified protein had its N-Terminal portion sequenced in 20 amino acids residues and its molecular mass determined by mass spectrometry. The mass spectrometry assay confirmed the mass of the DisBa-01 as 11.658 Da. The RGD-disintegrin pure had the tag of polihistidinas removed with thrombin. The cleavage of the tag of histidinas with thrombin was efficient. Polyclonal antibodies against DisBa-01 have also been produced in mice. The reactivity of these antibodies was observed through imunoblotting. These results provided one better form of obtain the pure protein as well as significant additional information for a better characterization of recombinant RGDdisintegrin, DisBa-01, which could be useful for the study of RGD-disintegrin, recombinant or native, and integrin.Desintegrinas são proteínas de veneno de serpentes, de baixo peso molecular, ricas em cisteína e em geral um peptídeo contendo o motivo RGD que liga especificamente a integrinas αIIbβ3, α5β1, e αvβ3 de plaquetas, células endoteliais e células tumorais. Os efeitos biológicos desses peptídeos estão relacionados com processos biológicos de adesão celular onde receptores denominados integrinas estão presentes. Esta dissertação descreve a otimização da purificação de uma desintegrina-RGD recombinante de Bothrops alternatus, DisBa-01, e a caracterização adicional desta proteína. A DisBa-01 é uma desintegrina-RGD recombinante que interage com a integrina αIIbβ3 inibindo agregação plaquetária e proliferação de células endoteliais e algumas células tumorais. Neste trabalho, um novo protocolo de purificação foi proposto para a purificação mais eficiente da DisBa-01. A desintegrina, DisBa-01, foi expressa em um sistema bacteriano otimizado (Escherichia coli BL21(DE3)pET28a+DisBa-01) e purificada em coluna de afinidade. Neste novo protocolo, o produto da purificação na coluna de níquel é submetido à cromatografia de troca-iônica. O uso da cromatografia de troca-iônica aumentou o grau de pureza e o produto protéico final. A proteína purificada teve o N-terminal seqüenciado em 20 resíduos de aminoácidos. A massa molecular foi determinada por espectrometria de massa que confirmou como 11.658 Da a massa da proteína. A desintegrina-RGD pura teve a cauda de polihistidinas eficientemente removida com proteólise com trombina. Anticorpos policlonais contra DisBa-01 foram produzidos em camundongos. A reatividade desses anticorpos foi observada através de imunoblotting. Estes resultados estabelecem uma nova forma de obtenção da proteína pura, assim como informações adicionais significativas de uma melhor caracterização da desintegrina-RGD recombinante, DisBa-01, que pode ser útil para o estudo de desintegrinas- RGD, recombinantes ou nativas, e interações com integrinas.Universidade Federal de Sao Carlosapplication/pdfporUniversidade Federal de São CarlosPrograma de Pós-Graduação em Genética Evolutiva e Biologia Molecular - PPGGEvUFSCarBRBioquímicaDesintegrinaAnticorpos policlonaisProteínas recombinantesRGD-disintegrin recombinantBothrops alternatusN-terminal sequenceMass spectrometryPurificationCIENCIAS BIOLOGICAS::GENETICAOtimização da purificação e caracterização adicional de uma desintegrina-RGD recombinante de Bothrops alternatus e seu efeito em células endoteliais humanas (HUVEC)info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesis-1-1b61211db-d955-45b7-886e-a0cefb89980finfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UFSCARinstname:Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR)instacron:UFSCARORIGINALDissCLSP.pdfapplication/pdf1835751https://repositorio.ufscar.br/bitstream/ufscar/5435/1/DissCLSP.pdf94d92e1d4b14f4f8befcd6cb0b350de1MD51THUMBNAILDissCLSP.pdf.jpgDissCLSP.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg5506https://repositorio.ufscar.br/bitstream/ufscar/5435/2/DissCLSP.pdf.jpg92bf6cd964a18b95abe5df1d559fe12cMD52ufscar/54352023-09-18 18:31:18.549oai:repositorio.ufscar.br:ufscar/5435Repositório InstitucionalPUBhttps://repositorio.ufscar.br/oai/requestopendoar:43222023-09-18T18:31:18Repositório Institucional da UFSCAR - Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR)false
dc.title.por.fl_str_mv Otimização da purificação e caracterização adicional de uma desintegrina-RGD recombinante de Bothrops alternatus e seu efeito em células endoteliais humanas (HUVEC)
title Otimização da purificação e caracterização adicional de uma desintegrina-RGD recombinante de Bothrops alternatus e seu efeito em células endoteliais humanas (HUVEC)
spellingShingle Otimização da purificação e caracterização adicional de uma desintegrina-RGD recombinante de Bothrops alternatus e seu efeito em células endoteliais humanas (HUVEC)
Pontes, Carmen Lucia Salla
Bioquímica
Desintegrina
Anticorpos policlonais
Proteínas recombinantes
RGD-disintegrin recombinant
Bothrops alternatus
N-terminal sequence
Mass spectrometry
Purification
CIENCIAS BIOLOGICAS::GENETICA
title_short Otimização da purificação e caracterização adicional de uma desintegrina-RGD recombinante de Bothrops alternatus e seu efeito em células endoteliais humanas (HUVEC)
title_full Otimização da purificação e caracterização adicional de uma desintegrina-RGD recombinante de Bothrops alternatus e seu efeito em células endoteliais humanas (HUVEC)
title_fullStr Otimização da purificação e caracterização adicional de uma desintegrina-RGD recombinante de Bothrops alternatus e seu efeito em células endoteliais humanas (HUVEC)
title_full_unstemmed Otimização da purificação e caracterização adicional de uma desintegrina-RGD recombinante de Bothrops alternatus e seu efeito em células endoteliais humanas (HUVEC)
title_sort Otimização da purificação e caracterização adicional de uma desintegrina-RGD recombinante de Bothrops alternatus e seu efeito em células endoteliais humanas (HUVEC)
author Pontes, Carmen Lucia Salla
author_facet Pontes, Carmen Lucia Salla
author_role author
dc.contributor.authorlattes.por.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/7468571768190030
dc.contributor.author.fl_str_mv Pontes, Carmen Lucia Salla
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Araújo, Heloísa Sobreiro Selistre de
dc.contributor.advisor1Lattes.fl_str_mv http://genos.cnpq.br:12010/dwlattes/owa/prc_imp_cv_int?f_cod=K4787059Y2
dc.contributor.authorID.fl_str_mv bd0a537d-c540-4f93-99cf-6cdd344f040e
contributor_str_mv Araújo, Heloísa Sobreiro Selistre de
dc.subject.por.fl_str_mv Bioquímica
Desintegrina
Anticorpos policlonais
Proteínas recombinantes
topic Bioquímica
Desintegrina
Anticorpos policlonais
Proteínas recombinantes
RGD-disintegrin recombinant
Bothrops alternatus
N-terminal sequence
Mass spectrometry
Purification
CIENCIAS BIOLOGICAS::GENETICA
dc.subject.eng.fl_str_mv RGD-disintegrin recombinant
Bothrops alternatus
N-terminal sequence
Mass spectrometry
Purification
dc.subject.cnpq.fl_str_mv CIENCIAS BIOLOGICAS::GENETICA
description Disintegrins are snake venom protein, of low molecular weight, rich in cysteines and RGDcontaining peptides that bind specifically to integrins αIIbβ3, α5β1, and αvβ3 expressed on platelets, endothelial and tumor cells. The biological effects of these peptides are related with biological process of cellular adhesion where receptors called integrins are presents. This dissertation describes the optimization of purification and additional characterization of a recombinant RGD-disintegrin of Bothrops alternatus, DisBa-01.. The DisBa-01 is a recombinant RGD-disintegrin, which interacts with αIIbβ3 integrin, inhibiting platelet aggregation and proliferation of endothelial and some tumor cells. In this work, a new protocol of purification was proposed for most efficient purification of the DisBa-01. The recombinant disintegrin, DisBa-01, was expressed in an optimizedbacterial system (Escherichia coli BL21(DE3) pET28a+DisBa-01) and purified by affinity chromatography. In this new protocol, the product of the purification in nickel column is submitted ion exchange chromatography. The use of the ion exchange chromatography as second step for purification increased the purity degree and the protein yield. The purified protein had its N-Terminal portion sequenced in 20 amino acids residues and its molecular mass determined by mass spectrometry. The mass spectrometry assay confirmed the mass of the DisBa-01 as 11.658 Da. The RGD-disintegrin pure had the tag of polihistidinas removed with thrombin. The cleavage of the tag of histidinas with thrombin was efficient. Polyclonal antibodies against DisBa-01 have also been produced in mice. The reactivity of these antibodies was observed through imunoblotting. These results provided one better form of obtain the pure protein as well as significant additional information for a better characterization of recombinant RGDdisintegrin, DisBa-01, which could be useful for the study of RGD-disintegrin, recombinant or native, and integrin.
publishDate 2006
dc.date.issued.fl_str_mv 2006-11-23
dc.date.available.fl_str_mv 2007-07-06
2016-06-02T20:21:18Z
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2016-06-02T20:21:18Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.citation.fl_str_mv PONTES, Carmen Lucia Salla. Otimização da purificação e caracterização adicional de uma desintegrina-RGD recombinante de Bothrops alternatus e seu efeito em células endoteliais humanas (HUVEC).. 2006. 140 f. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas) - Universidade Federal de São Carlos, São Carlos, 2006.
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://repositorio.ufscar.br/handle/ufscar/5435
identifier_str_mv PONTES, Carmen Lucia Salla. Otimização da purificação e caracterização adicional de uma desintegrina-RGD recombinante de Bothrops alternatus e seu efeito em células endoteliais humanas (HUVEC).. 2006. 140 f. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas) - Universidade Federal de São Carlos, São Carlos, 2006.
url https://repositorio.ufscar.br/handle/ufscar/5435
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.relation.confidence.fl_str_mv -1
-1
dc.relation.authority.fl_str_mv b61211db-d955-45b7-886e-a0cefb89980f
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal de São Carlos
dc.publisher.program.fl_str_mv Programa de Pós-Graduação em Genética Evolutiva e Biologia Molecular - PPGGEv
dc.publisher.initials.fl_str_mv UFSCar
dc.publisher.country.fl_str_mv BR
publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal de São Carlos
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da UFSCAR
instname:Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR)
instacron:UFSCAR
instname_str Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR)
instacron_str UFSCAR
institution UFSCAR
reponame_str Repositório Institucional da UFSCAR
collection Repositório Institucional da UFSCAR
bitstream.url.fl_str_mv https://repositorio.ufscar.br/bitstream/ufscar/5435/1/DissCLSP.pdf
https://repositorio.ufscar.br/bitstream/ufscar/5435/2/DissCLSP.pdf.jpg
bitstream.checksum.fl_str_mv 94d92e1d4b14f4f8befcd6cb0b350de1
92bf6cd964a18b95abe5df1d559fe12c
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UFSCAR - Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR)
repository.mail.fl_str_mv
_version_ 1802136285587963904