Genetic characterization of Rhizobia isolated from Lotus corniculatus L.

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Oliveira, Andréia Mara Rotta
Data de Publicação: 2007
Outros Autores: Perez, Naylor Bastiani, Dall’agnol, Miguel, Bangel, Eliane Villamil, Silva, Gilmário
Tipo de documento: Artigo
Idioma: por
Título da fonte: Pesquisa Agropecuária Gaúcha (Online)
Texto Completo: http://revistapag.agricultura.rs.gov.br/ojs/index.php/revistapag/article/view/250
Resumo: Thirty three Rhizobium sp isolates obtained from birdsfoot trefoil (Lotus corniculatus L.) collected on different regions of Rio Grande do Sul were characterized using Box-PCR. The isolates presented distinct amplification profiles among then, as well as from the isolates recommended nowadays for the production of birdsfoot trefoil inoculants, SEMIA 806 and SEMIA 816. The genetic similarity index, determined by the Jaccard coefficient, ranged from 0.5 to 0.9%, pointing out to a large genetic variability among the isolates. The cluster analysis isolates showed a formation of tree large groups and was not possible to establish a relationship among the amplification profiles, groups formed and geographic origin of the isolates.
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spelling Genetic characterization of Rhizobia isolated from Lotus corniculatus L. Caracterização genética de rizóbios isolados de Lotus corniculatus L.Birdsfoot trefoil, Rhizobium sp., genetic variability.Cornichão, Box-PCR, Fixação Biológica de Nitrogênio, Rhizobium sp., variabilidade genética.Thirty three Rhizobium sp isolates obtained from birdsfoot trefoil (Lotus corniculatus L.) collected on different regions of Rio Grande do Sul were characterized using Box-PCR. The isolates presented distinct amplification profiles among then, as well as from the isolates recommended nowadays for the production of birdsfoot trefoil inoculants, SEMIA 806 and SEMIA 816. The genetic similarity index, determined by the Jaccard coefficient, ranged from 0.5 to 0.9%, pointing out to a large genetic variability among the isolates. The cluster analysis isolates showed a formation of tree large groups and was not possible to establish a relationship among the amplification profiles, groups formed and geographic origin of the isolates. Trinta e três isolados de Rhizobium sp obtidos a partir de nódulos de cornichão (Lotus corniculatus L.), coletados em diferentes regiões do Rio Grande do Sul, foram caracterizados pela técnica da PCR (reação em cadeia da polimerase), utilizando oligonucleotídeos específicos para a amplificação de seqüências repetitivas Box. Os isolados apresentaram perfis de amplificação distintos entre si e das estirpes de Mesorhizobium loti, SEMIA 806 e SEMIA 816, atualmente recomendadas para a produção de inoculantes para cornichão. O índice de similaridade genética determinado pelo coeficiente de Jaccard variou entre 0,5 e 0,9% indicando uma grande variabilidade entre os isolados. A análise de agrupamento dos isolados demonstrou a formação de três grupos, não tendo sido possível estabelecer relação entre o perfil de amplificação, grupos formados e origem geográfica dos isolados. Departamento de Diagnóstico e Pesquisa Agropecuária. Secretaria de Agricultura, Pecuária e Desenvolvimento Rural2007-12-20info:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionapplication/pdfhttp://revistapag.agricultura.rs.gov.br/ojs/index.php/revistapag/article/view/250Pesquisa Agropecuária Gaúcha; Vol 13 No 1/2 (2007): PESQ. AGROP. GAÚCHA; 23-27Pesquisa Agropecuária Gaúcha; v. 13 n. 1/2 (2007): PESQ. AGROP. GAÚCHA; 23-272595-76860104-9070reponame:Pesquisa Agropecuária Gaúcha (Online)instname:Secretaria de Agricultura, Pecuária e Desenvolvimento Rural do Rio Grande do Sulinstacron:SEAPDRporhttp://revistapag.agricultura.rs.gov.br/ojs/index.php/revistapag/article/view/250/213Oliveira, Andréia Mara RottaPerez, Naylor Bastiani Dall’agnol, Miguel Bangel, Eliane Villamil Silva, Gilmárioinfo:eu-repo/semantics/openAccess2024-04-22T12:36:26Zoai:ojs.revistapag.agricultura.rs.gov.br:article/250Revistahttp://revistapag.agricultura.rs.gov.br/ojs/index.php/revistapagPUBhttp://revistapag.agricultura.rs.gov.br/ojs/index.php/revistapag/oaipag@agricultura.rs.gov.br||2595-76860104-9070opendoar:2024-04-22T12:36:26Pesquisa Agropecuária Gaúcha (Online) - Secretaria de Agricultura, Pecuária e Desenvolvimento Rural do Rio Grande do Sulfalse
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