Sequenciamento do genoma completo de um isolado de sapovirus no Distrito Federal, Brasil

• Autor(a) principal: Anjos, Karoline
• Data de Publicação: 2010
• Idioma: por
• Título da fonte: Repositório Institucional da UCB
• Texto Completo: https://repositorio.ucb.br:9443/jspui/handle/10869/6034
• topic: Sapovirus; calicivírus; epidemiologia; molecular

Sapporo virus é um membro do gênero Sapovirus da família Caliciviridae, é um agente causador de gastrenterite aguda. Seu genoma é linear, de senso positivo, ssRNA, com tamanho de cerca de 7,5 kb, poliadenilado na região terminal 3 '. Sapporo virus é dividido atualmente em cinco genogrupos (GI-GV), sendo que um genogrupo específico de suínos (GIII). No Brasil, sabe-se que os vírus que mais causam gastrenterites são os rotavírus e norovírus, ao passo que a ocorrência de sapovírus parece ser esporádica. No Distrito Federal, um sapovírus foi encontrado recentemente por RT-PCR de uma amostra fecal, visando amplificar parte do gene da proteína do capsídeo. A fim de identificar o genótipo do sapovírus isolado, o fragmento de DNA amplificado por RT-PCR foi sequenciado utilizando primers específicos para sapovírus na Plataforma de Sequenciamento da Universidade Católica de Brasília. O sapovírus isolado do DF foi identificado como genótipo 2 de genogrupo I. A análise filogenética foi realizada com esta região. Decidiu-se então sequenciar o genoma completo por clonagem dividindo em duas regiões genômicas. Primeiro a região 5’ e segundo a região 3’. Após o sequenciamento utilizando a técnica de primer walking, comparou-se os resultados com todas as sequências de genoma completo de Sapporo virus encontradas no GenBank, encontrando uma semelhança de 72% entre o sapovírus do DF com um sapovírus japonês (número de acesso HM002617).