FILOGEOGRAFIA DE DUAS ESPÉCIES DE DROSOPHILA DOS GRUPOS GUARAMUNU E GUARANI
Autor(a) principal: | |
---|---|
Data de Publicação: | 2013 |
Tipo de documento: | Dissertação |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Biblioteca Digital de Teses e Dissertações do UNICENTRO |
Texto Completo: | http://localhost:8080/tede/handle/tede/406 |
Resumo: | Phylogeography is a research field that can evidence geographic and genetic patterns resulted from historic events that a species or population has suffered along its evolutionary history. The main goal of this work was to study the populational structure, evolutionary history and distribution of the Neotropical Drosophila species, Drosophila maculifrons (guaramunu group) and D. ornatifrons (guarani group), collected in the Atlantic Forest biome from southern Brazil. Sequences of the mitochondrial genes Cytochrome Oxidase I (COI) and II (COII), from three populations of D. maculifrons and nine populations of D. ornatifrons, were analyzed. The mean nucleotide diversity (?) found for D. maculifrons in the COI gene was 0.000476, and in COII was 0.000651. The AMOVA, Analysis of Molecular Variance, revealed considerable variation for COI (63.51%; ?ct = 0.63328 - p < 0.05) among G1 and G2 groups (categorized according to the Atlantic Forest phytophysiognomy were the population was located), and for COII among populations within the groups (101.12%; ?sc = -0.01481 - p < 0.05). The Mismatch Distribution (MD) graphics for both genes presented multimodal curves, which suggest the occurrence of demographic equilibrium or population subdivision. The pattern of haplotipic variation distribution for D. maculifrons can be also explained by balancing selection, with genetic diversity reduction and maintenance of ancestral polymorphism; the difference in the variation found among populations could be due to the distinct flora composition of the sampled Atlantic Forest areas, Semideciduous Seazonal Forest (FES) and Mixed Ombrophylous Forest (FOM), or as a consequence of the higher geographic proximity among the FOM populations than among the FES populations, resulting in restrict by distance gene flow. For D. ornatifrons, the COII neutrality tests, MD graphics and Bayesian analysis indicated that this species may have suffered a population expansion event. This event is possible to have initiated from coastal or near to the coast populations of the Rio Grande do Sul state, more humid ones, as indicated by the higher variation and the position of Ilha dos Marinheiros-RS population in the haplotype net. The BSP dating suggested that this expansion would have occurred between 20,000 and 25,000 years ago, period that the temperatures were five to six degrees lower than the current mean temperature. Therefore, the haplotype diversity distribution analysis of the COI and COII genes of D. maculifrons revealed a possible relation with the type of habitat (FES or FOM), however, a wider geographic sampling could contribute more precisely to elucidate this species evolutionary history. The phylogegraphic study of D. ornatifrons suggested that the coastal region of the Rio Grande do Sul state is possibly the ancestral area that originated the other populations analysed. The restriction of the diversity distribution observed in the coastal ancestral population analyzed, Ilha dos Marinheiros-RS, toward to the colonized areas could be due to the limited capacity of dispersion of these insects, associated with the difficulty of overcoming clinal barriers, specially humidity, which are considerably frequent in forest environments, such as the Atlantic Forest. |
id |
UCEN_9b6845bfbd7230e2df10ae09c0e92a76 |
---|---|
oai_identifier_str |
oai:localhost:tede/406 |
network_acronym_str |
UCEN |
network_name_str |
Biblioteca Digital de Teses e Dissertações do UNICENTRO |
repository_id_str |
|
spelling |
Machado, Luciana Paes de BarrosCPF:00000000000http://lattes.cnpq.br/5621542642051269Mateus, Rogério PincelaCPF:00000000000http://lattes.cnpq.br/3619196057484399CPF:06355029923http://lattes.cnpq.br/5932637086973437Gustani, Emanuele Cristina2016-09-20T12:29:26Z2015-12-042013-02-18GUSTANI, Emanuele Cristina. não consta. 2013. 80 f. Dissertação (Mestrado em Biologia Evolutiva) - UNICENTRO - Universidade Estadual do Centro Oeste, Guarapuava, 2013.http://localhost:8080/tede/handle/tede/406Phylogeography is a research field that can evidence geographic and genetic patterns resulted from historic events that a species or population has suffered along its evolutionary history. The main goal of this work was to study the populational structure, evolutionary history and distribution of the Neotropical Drosophila species, Drosophila maculifrons (guaramunu group) and D. ornatifrons (guarani group), collected in the Atlantic Forest biome from southern Brazil. Sequences of the mitochondrial genes Cytochrome Oxidase I (COI) and II (COII), from three populations of D. maculifrons and nine populations of D. ornatifrons, were analyzed. The mean nucleotide diversity (?) found for D. maculifrons in the COI gene was 0.000476, and in COII was 0.000651. The AMOVA, Analysis of Molecular Variance, revealed considerable variation for COI (63.51%; ?ct = 0.63328 - p < 0.05) among G1 and G2 groups (categorized according to the Atlantic Forest phytophysiognomy were the population was located), and for COII among populations within the groups (101.12%; ?sc = -0.01481 - p < 0.05). The Mismatch Distribution (MD) graphics for both genes presented multimodal curves, which suggest the occurrence of demographic equilibrium or population subdivision. The pattern of haplotipic variation distribution for D. maculifrons can be also explained by balancing selection, with genetic diversity reduction and maintenance of ancestral polymorphism; the difference in the variation found among populations could be due to the distinct flora composition of the sampled Atlantic Forest areas, Semideciduous Seazonal Forest (FES) and Mixed Ombrophylous Forest (FOM), or as a consequence of the higher geographic proximity among the FOM populations than among the FES populations, resulting in restrict by distance gene flow. For D. ornatifrons, the COII neutrality tests, MD graphics and Bayesian analysis indicated that this species may have suffered a population expansion event. This event is possible to have initiated from coastal or near to the coast populations of the Rio Grande do Sul state, more humid ones, as indicated by the higher variation and the position of Ilha dos Marinheiros-RS population in the haplotype net. The BSP dating suggested that this expansion would have occurred between 20,000 and 25,000 years ago, period that the temperatures were five to six degrees lower than the current mean temperature. Therefore, the haplotype diversity distribution analysis of the COI and COII genes of D. maculifrons revealed a possible relation with the type of habitat (FES or FOM), however, a wider geographic sampling could contribute more precisely to elucidate this species evolutionary history. The phylogegraphic study of D. ornatifrons suggested that the coastal region of the Rio Grande do Sul state is possibly the ancestral area that originated the other populations analysed. The restriction of the diversity distribution observed in the coastal ancestral population analyzed, Ilha dos Marinheiros-RS, toward to the colonized areas could be due to the limited capacity of dispersion of these insects, associated with the difficulty of overcoming clinal barriers, specially humidity, which are considerably frequent in forest environments, such as the Atlantic Forest.O estudo filogeográfico é uma ferramenta que pode evidenciar padrões geográficos e genéticos capazes de refletir eventos históricos sofridos por uma espécie ou população ao longo de sua história evolutiva. O objetivo deste trabalho foi estudar a estrutura populacional, história evolutiva, e distribuição das espécies neotropicais Drosophila maculifrons (grupo guaramunu) e D. ornatifrons (grupo guarani), coletadas no bioma Mata Atlântica da região sul do Brasil. Foram analisadas as sequências dos genes mitocondriais Citocromo Oxidase I (COI) e II (COII) de três populações de D. maculifrons e nove de D. ornatifrons. A diversidade nucleotídica média (?) encontrada para as populações de D. maculifrons para o gene COI foi de 0,000476, e para COII foi de 0,000651. A AMOVA, Análise de Variância Molecular, revelou variação considerável para COI (63,51%; ?ct = 0,63328 - p < 0,05) entre os grupos G1 e G2 (categorizados de acordo com a fitofisionomia da Mata Atlântica onde as populações foram coletadas), e para COII entre populações dentro dos grupos (101,12%; ?sc = -0,01481 - p < 0,05). Os gráficos de Mismatch Distribution (MD) para os dois genes apresentaram curvas multimodais, o que sugere tanto equilíbrio demográfico, quanto subdivisão de populações. O padrão de distribuição da variação haplotípica de D. maculifrons também pode ser explicado pela ação de seleção balanceadora, com redução da diversidade genética e manutenção de polimorfismo ancestral; a diferença na variação observada entre as populações pode ser tanto devido à composição vegetal distinta encontrada nas áreas de Mata Atlântica amostradas, Floresta Estacional Semidecidual (FES) e Floresta Ombrófila Mista (FOM), como também esta relação pode ser consequência da maior proximidade geográfica das populações da área de FOM em relação a população coletada na área de FES, sendo resultado de fluxo gênico restrito pela distância. Para D. ornatifrons, os testes de neutralidade, o gráfico de MD e a Análise Bayesiana (BSP) para o gene COII indicam que esta espécie sofreu possivelmente um evento de expansão populacional. Este evento teria ocorrido provavelmente a partir das populações litorâneas ou próximas ao litoral do estado do Rio Grande do Sul, mais úmidas, como indicado pela posição da população de Ilha dos Marinheiros-RS na rede de haplótipos e a maior variação encontrada neste local. A datação pela BSP sugere que esta expansão teria ocorrido entre 20.000 e 25.000 anos atrás, período em que as temperaturas no hemisfério sul estavam em torno de cinco ou seis graus mais baixas que as atuais. Portanto, a análise da distribuição da diversidade de haplótipos dos genes COI e COII de D. maculifrons revelou uma possível relação com o tipo de habitat (FES e FOM), contudo, uma amostragem com maior amplitude geográfica poderia contribuir com melhor precisão para a elucidação da história evolutiva desta espécie. A análise filogeografia de D. ornatifrons sugeriu que a região litorânea do Rio Grande do Sul seria a área ancestral de dispersão e origem das demais populações analisadas. A restrição da distribuição da diversidade observada na população costeira ancestral analisada, Ilha dos Marinheiros-RS, para as áreas colonizadas seria resultado da capacidade limitada de dispersão destes insetos, associada a dificuldade de transpor barreiras clinais, especialmente de umidade, tão frequentes em ambientes florestais como a Mata Atlântica.Made available in DSpace on 2016-09-20T12:29:26Z (GMT). No. of bitstreams: 1 PR EMANUELE CRISTINA GUSTANI.pdf: 1606552 bytes, checksum: d0e8b9cc06b7ce9bc848732ef2a6f193 (MD5) Previous issue date: 2013-02-18Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPESapplication/pdfhttp://localhost:8080/tede/retrieve/1309/PR%20EMANUELE%20CRISTINA%20GUSTANI.pdf.jpgporUNICENTRO - Universidade Estadual do Centro OestePrograma de Pós-Graduação em Biologia Evolutiva (Mestrado)UNICENTROBRUnicentro::Departamento de Biologianão constanão constaCIENCIAS BIOLOGICAS::BIOLOGIA GERALFILOGEOGRAFIA DE DUAS ESPÉCIES DE DROSOPHILA DOS GRUPOS GUARAMUNU E GUARANInão constainfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesis18315802413433703826006006006006887173787787986718-16345593859312446972075167498588264571info:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações do UNICENTROinstname:Universidade Estadual do Centro-Oeste (UNICENTRO)instacron:UNICENTROORIGINALPR EMANUELE CRISTINA GUSTANI.pdfapplication/pdf1606552http://localhost:8080/tede/bitstream/tede/406/1/PR+EMANUELE+CRISTINA+GUSTANI.pdfd0e8b9cc06b7ce9bc848732ef2a6f193MD51TEXTPR EMANUELE CRISTINA GUSTANI.pdf.txtPR EMANUELE CRISTINA GUSTANI.pdf.txttext/plain133497http://localhost:8080/tede/bitstream/tede/406/2/PR+EMANUELE+CRISTINA+GUSTANI.pdf.txtb56f67dd92274584f547ba5683226884MD52THUMBNAILPR EMANUELE CRISTINA GUSTANI.pdf.jpgPR EMANUELE CRISTINA GUSTANI.pdf.jpgimage/jpeg2867http://localhost:8080/tede/bitstream/tede/406/3/PR+EMANUELE+CRISTINA+GUSTANI.pdf.jpg7c041ee8541ec4f546f28ba8fa396facMD53tede/4062017-09-12 08:35:14.857oai:localhost:tede/406Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://tede.unicentro.br:8080/jspui/PUBhttp://tede.unicentro.br/tde_oai/oai3.phprepositorio@unicentro.br||fabianoqueiroz@yahoo.com.bropendoar:2017-09-12T11:35:14Biblioteca Digital de Teses e Dissertações do UNICENTRO - Universidade Estadual do Centro-Oeste (UNICENTRO)false |
dc.title.por.fl_str_mv |
FILOGEOGRAFIA DE DUAS ESPÉCIES DE DROSOPHILA DOS GRUPOS GUARAMUNU E GUARANI |
dc.title.alternative.eng.fl_str_mv |
não consta |
title |
FILOGEOGRAFIA DE DUAS ESPÉCIES DE DROSOPHILA DOS GRUPOS GUARAMUNU E GUARANI |
spellingShingle |
FILOGEOGRAFIA DE DUAS ESPÉCIES DE DROSOPHILA DOS GRUPOS GUARAMUNU E GUARANI Gustani, Emanuele Cristina não consta não consta CIENCIAS BIOLOGICAS::BIOLOGIA GERAL |
title_short |
FILOGEOGRAFIA DE DUAS ESPÉCIES DE DROSOPHILA DOS GRUPOS GUARAMUNU E GUARANI |
title_full |
FILOGEOGRAFIA DE DUAS ESPÉCIES DE DROSOPHILA DOS GRUPOS GUARAMUNU E GUARANI |
title_fullStr |
FILOGEOGRAFIA DE DUAS ESPÉCIES DE DROSOPHILA DOS GRUPOS GUARAMUNU E GUARANI |
title_full_unstemmed |
FILOGEOGRAFIA DE DUAS ESPÉCIES DE DROSOPHILA DOS GRUPOS GUARAMUNU E GUARANI |
title_sort |
FILOGEOGRAFIA DE DUAS ESPÉCIES DE DROSOPHILA DOS GRUPOS GUARAMUNU E GUARANI |
author |
Gustani, Emanuele Cristina |
author_facet |
Gustani, Emanuele Cristina |
author_role |
author |
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv |
Machado, Luciana Paes de Barros |
dc.contributor.advisor1ID.fl_str_mv |
CPF:00000000000 |
dc.contributor.advisor1Lattes.fl_str_mv |
http://lattes.cnpq.br/5621542642051269 |
dc.contributor.advisor-co1.fl_str_mv |
Mateus, Rogério Pincela |
dc.contributor.advisor-co1ID.fl_str_mv |
CPF:00000000000 |
dc.contributor.advisor-co1Lattes.fl_str_mv |
http://lattes.cnpq.br/3619196057484399 |
dc.contributor.authorID.fl_str_mv |
CPF:06355029923 |
dc.contributor.authorLattes.fl_str_mv |
http://lattes.cnpq.br/5932637086973437 |
dc.contributor.author.fl_str_mv |
Gustani, Emanuele Cristina |
contributor_str_mv |
Machado, Luciana Paes de Barros Mateus, Rogério Pincela |
dc.subject.por.fl_str_mv |
não consta |
topic |
não consta não consta CIENCIAS BIOLOGICAS::BIOLOGIA GERAL |
dc.subject.eng.fl_str_mv |
não consta |
dc.subject.cnpq.fl_str_mv |
CIENCIAS BIOLOGICAS::BIOLOGIA GERAL |
description |
Phylogeography is a research field that can evidence geographic and genetic patterns resulted from historic events that a species or population has suffered along its evolutionary history. The main goal of this work was to study the populational structure, evolutionary history and distribution of the Neotropical Drosophila species, Drosophila maculifrons (guaramunu group) and D. ornatifrons (guarani group), collected in the Atlantic Forest biome from southern Brazil. Sequences of the mitochondrial genes Cytochrome Oxidase I (COI) and II (COII), from three populations of D. maculifrons and nine populations of D. ornatifrons, were analyzed. The mean nucleotide diversity (?) found for D. maculifrons in the COI gene was 0.000476, and in COII was 0.000651. The AMOVA, Analysis of Molecular Variance, revealed considerable variation for COI (63.51%; ?ct = 0.63328 - p < 0.05) among G1 and G2 groups (categorized according to the Atlantic Forest phytophysiognomy were the population was located), and for COII among populations within the groups (101.12%; ?sc = -0.01481 - p < 0.05). The Mismatch Distribution (MD) graphics for both genes presented multimodal curves, which suggest the occurrence of demographic equilibrium or population subdivision. The pattern of haplotipic variation distribution for D. maculifrons can be also explained by balancing selection, with genetic diversity reduction and maintenance of ancestral polymorphism; the difference in the variation found among populations could be due to the distinct flora composition of the sampled Atlantic Forest areas, Semideciduous Seazonal Forest (FES) and Mixed Ombrophylous Forest (FOM), or as a consequence of the higher geographic proximity among the FOM populations than among the FES populations, resulting in restrict by distance gene flow. For D. ornatifrons, the COII neutrality tests, MD graphics and Bayesian analysis indicated that this species may have suffered a population expansion event. This event is possible to have initiated from coastal or near to the coast populations of the Rio Grande do Sul state, more humid ones, as indicated by the higher variation and the position of Ilha dos Marinheiros-RS population in the haplotype net. The BSP dating suggested that this expansion would have occurred between 20,000 and 25,000 years ago, period that the temperatures were five to six degrees lower than the current mean temperature. Therefore, the haplotype diversity distribution analysis of the COI and COII genes of D. maculifrons revealed a possible relation with the type of habitat (FES or FOM), however, a wider geographic sampling could contribute more precisely to elucidate this species evolutionary history. The phylogegraphic study of D. ornatifrons suggested that the coastal region of the Rio Grande do Sul state is possibly the ancestral area that originated the other populations analysed. The restriction of the diversity distribution observed in the coastal ancestral population analyzed, Ilha dos Marinheiros-RS, toward to the colonized areas could be due to the limited capacity of dispersion of these insects, associated with the difficulty of overcoming clinal barriers, specially humidity, which are considerably frequent in forest environments, such as the Atlantic Forest. |
publishDate |
2013 |
dc.date.issued.fl_str_mv |
2013-02-18 |
dc.date.available.fl_str_mv |
2015-12-04 |
dc.date.accessioned.fl_str_mv |
2016-09-20T12:29:26Z |
dc.type.status.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/publishedVersion |
dc.type.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/masterThesis |
format |
masterThesis |
status_str |
publishedVersion |
dc.identifier.citation.fl_str_mv |
GUSTANI, Emanuele Cristina. não consta. 2013. 80 f. Dissertação (Mestrado em Biologia Evolutiva) - UNICENTRO - Universidade Estadual do Centro Oeste, Guarapuava, 2013. |
dc.identifier.uri.fl_str_mv |
http://localhost:8080/tede/handle/tede/406 |
identifier_str_mv |
GUSTANI, Emanuele Cristina. não consta. 2013. 80 f. Dissertação (Mestrado em Biologia Evolutiva) - UNICENTRO - Universidade Estadual do Centro Oeste, Guarapuava, 2013. |
url |
http://localhost:8080/tede/handle/tede/406 |
dc.language.iso.fl_str_mv |
por |
language |
por |
dc.relation.program.fl_str_mv |
1831580241343370382 |
dc.relation.confidence.fl_str_mv |
600 600 600 600 |
dc.relation.department.fl_str_mv |
6887173787787986718 |
dc.relation.cnpq.fl_str_mv |
-1634559385931244697 |
dc.relation.sponsorship.fl_str_mv |
2075167498588264571 |
dc.rights.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/openAccess |
eu_rights_str_mv |
openAccess |
dc.format.none.fl_str_mv |
application/pdf |
dc.publisher.none.fl_str_mv |
UNICENTRO - Universidade Estadual do Centro Oeste |
dc.publisher.program.fl_str_mv |
Programa de Pós-Graduação em Biologia Evolutiva (Mestrado) |
dc.publisher.initials.fl_str_mv |
UNICENTRO |
dc.publisher.country.fl_str_mv |
BR |
dc.publisher.department.fl_str_mv |
Unicentro::Departamento de Biologia |
publisher.none.fl_str_mv |
UNICENTRO - Universidade Estadual do Centro Oeste |
dc.source.none.fl_str_mv |
reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações do UNICENTRO instname:Universidade Estadual do Centro-Oeste (UNICENTRO) instacron:UNICENTRO |
instname_str |
Universidade Estadual do Centro-Oeste (UNICENTRO) |
instacron_str |
UNICENTRO |
institution |
UNICENTRO |
reponame_str |
Biblioteca Digital de Teses e Dissertações do UNICENTRO |
collection |
Biblioteca Digital de Teses e Dissertações do UNICENTRO |
bitstream.url.fl_str_mv |
http://localhost:8080/tede/bitstream/tede/406/1/PR+EMANUELE+CRISTINA+GUSTANI.pdf http://localhost:8080/tede/bitstream/tede/406/2/PR+EMANUELE+CRISTINA+GUSTANI.pdf.txt http://localhost:8080/tede/bitstream/tede/406/3/PR+EMANUELE+CRISTINA+GUSTANI.pdf.jpg |
bitstream.checksum.fl_str_mv |
d0e8b9cc06b7ce9bc848732ef2a6f193 b56f67dd92274584f547ba5683226884 7c041ee8541ec4f546f28ba8fa396fac |
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv |
MD5 MD5 MD5 |
repository.name.fl_str_mv |
Biblioteca Digital de Teses e Dissertações do UNICENTRO - Universidade Estadual do Centro-Oeste (UNICENTRO) |
repository.mail.fl_str_mv |
repositorio@unicentro.br||fabianoqueiroz@yahoo.com.br |
_version_ |
1811733808702029824 |