Associação entre o SNP rs6505162 e a expressão de hsa-miR423-5p e has-miR221-3p no soro de gestantes e por bioinformática
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Data de Publicação: | 2019 |
Tipo de documento: | Dissertação |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Biblioteca Digital de Teses e Dissertações do UCpel |
Texto Completo: | http://tede.ucpel.edu.br:8080/jspui/handle/jspui/1006 |
Resumo: | Com o início da gravidez, profundas alterações anatômicas e fisiológicas afetam praticamente todos os órgãos do corpo da mãe. Essas mudanças são induzidas principalmente para atender às complexas demandas de desenvolvimento e proteção fetal e para preparar o organismo materno para o parto. Os microRNAs são pequenas moléculas endógenas não codificantes capazes de regular a expressão gênica no período pós-transcricional e foram recentemente estudados para melhor compreender as condições fisiológicas e patológicas da gestação. Nesse sentido, também é enfatizada a identificação do polimorfismo de nucleotídeo único (SNP) rs6505162. O SNP rs6505162 está localizado no pré-microRNA-423 e mapeia para 17q11.2, com uma mudança nucleotídidica de C para A. Esse polimorfismo foi considerado funcional, regulando os níveis de expressão do microRNA-423. Dessa forma, esta dissertação teve como objetivo avaliar a associação entre o SNP rs6505162 e a expressão de microRNAs (microRNA 423-5p e microRNA-221-3p) em gestantes. Nossa amostra incluiu 173 gestantes. Questionários com questões sociodemográficas foram aplicados para caracterizar a amostra. A genotipagem do SNP rs6505162 foi avaliada por PCR em tempo real. A expressão de microRNA-423-5p, microRNA-221-3p foi avaliada por PCR quantitativa. A análise de bioinformática foi realizada através do software DIANA Tools, mirPath v.3. Os resultados mostram uma associação entre o genótipo CC e o microRNA-221-3p (p = 0,015), bem como com o alelo C e o microRNA-423-5p (p = 0,037) e o microRNA-221- 3p (p = 0,025). A associação foi mantida após a análise de regressão linear ajustada. As portadoras do alelo C apresentaram níveis de expressão de microRNA-423-5p e microRNA-221-3p mais altos no soro sanguíneo. A análise de correlação mostrou uma correlação positiva entre os microRNAs (p = 0,001). A análise de bioinformática revelou 5 a via de sinalização do estrogênio (p = 0,002) e o gene do proto-oncogene Raf-1, serina / treonina-quinase (RAF1). Em conclusão, nossos resultados mostram que o SNP rs6505162 influencia a expressão do microRNA-423-5p e do microRNA-221-3p no sangue periférico e que a expressão de ambos os microRNAs está positivamente correlacionada na gestaç. Assim, a interação entre SNP e microRNAs pode representar um importante alvo de estudo na busca de biomarcadores para condições fisiológicas e patológicas. |
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O SNP rs6505162 está localizado no pré-microRNA-423 e mapeia para 17q11.2, com uma mudança nucleotídidica de C para A. Esse polimorfismo foi considerado funcional, regulando os níveis de expressão do microRNA-423. Dessa forma, esta dissertação teve como objetivo avaliar a associação entre o SNP rs6505162 e a expressão de microRNAs (microRNA 423-5p e microRNA-221-3p) em gestantes. Nossa amostra incluiu 173 gestantes. Questionários com questões sociodemográficas foram aplicados para caracterizar a amostra. A genotipagem do SNP rs6505162 foi avaliada por PCR em tempo real. A expressão de microRNA-423-5p, microRNA-221-3p foi avaliada por PCR quantitativa. A análise de bioinformática foi realizada através do software DIANA Tools, mirPath v.3. Os resultados mostram uma associação entre o genótipo CC e o microRNA-221-3p (p = 0,015), bem como com o alelo C e o microRNA-423-5p (p = 0,037) e o microRNA-221- 3p (p = 0,025). A associação foi mantida após a análise de regressão linear ajustada. As portadoras do alelo C apresentaram níveis de expressão de microRNA-423-5p e microRNA-221-3p mais altos no soro sanguíneo. A análise de correlação mostrou uma correlação positiva entre os microRNAs (p = 0,001). A análise de bioinformática revelou 5 a via de sinalização do estrogênio (p = 0,002) e o gene do proto-oncogene Raf-1, serina / treonina-quinase (RAF1). Em conclusão, nossos resultados mostram que o SNP rs6505162 influencia a expressão do microRNA-423-5p e do microRNA-221-3p no sangue periférico e que a expressão de ambos os microRNAs está positivamente correlacionada na gestaç. Assim, a interação entre SNP e microRNAs pode representar um importante alvo de estudo na busca de biomarcadores para condições fisiológicas e patológicas.With the onset of pregnancy, profound anatomical and physiological changes affect virtually all organs in the mother’s body. These changes are mainly induced to meet the complex demands of fetal development and protection and to prepare the maternal organism for parturition. MicroRNAs are small non-coding endogenous molecules capable of regulating gene expression in the post-transcriptional period and have been recently studied in order to better comprehend the physiological and pathological conditions of pregnancy. In this sense, the identification of the rs6505162 single nucleotide polymorphism (SNP) is also emphasized. The rs6505162 SNP is located in pre-microRNA-423 and maps to 17q11.2, with a nucleotide change from C to A. This polymorphism has been considered functional, regulating levels microRNA-423 expression. Thus, this study aimed to evaluate the association between rs6505162 SNP and microRNAs (microRNA-423-5p and microRNA-221-3p) expression in pregnancy. Our sample included 173 pregnant. Questionnaires with socio demographic questions were applied to characterize the sample. And rs6505162 SNP genotyping were evaluated by real time PCR. MicroRNA-423-5p, microRNA-221-3p expression were evaluated by quantitative PCR. Bioinformatics analysis was performing using the DIANA Tools software, mirPath v.3. The results shows an association between the CC genotype and microRNA-221-3p (p = 0.015), as well as with allele C and microRNA-423-5p (p = 0.037) and microRNA-221-3p (p = 0.025). The association was maintained after the adjusted linear regression analysis. The C allele carriers have higher levels of microRNA 423-5p and microRNA-221-3p expression in the blood serum. The correlation analysis showed a positive correlation between the microRNAs (p = 0.001). The bioinformatics analysis revealed the estrogen signaling pathway (p = 0.002), and the Raf-1 proto- 7 oncogene, serine/threonine kinase (RAF1) gene. In conclusion, our results show that the rs6505162 SNP influences the peripheral blood expression of microRNA-423-5p and microRNA-221-3p, and that both microRNAs expression are positively correlated in pregnancy. Thus, this SNP and microRNAs interaction could represent an important study target to seek biomarker for physiological and pathological conditions.Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPESUniversidade Catolica de PelotasCentro de Ciencias da SaudeBrasilUCPelPrograma de Pos-Graduacao em Saude ComportamentoNedel, FernandaAssis, Adriano Martimbianco deFogaça, Tatiane BilhalvaTrettin, Jéssica PuchalskiAmaral, Cainá Corrêa do2023-10-09T19:45:19Z2019-11-29info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfAmaral, Cainá Corrêa do. Associação entre o SNP rs6505162 e a expressão de hsa-miR423-5p e has-miR221-3p no soro de gestantes e por bioinformática. 2019. 85 f. Dissertação( Programa de Pos-Graduacao em Saude Comportamento) - Universidade Catolica de Pelotas, Pelotas.http://tede.ucpel.edu.br:8080/jspui/handle/jspui/1006porinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações do UCpelinstname:Universidade Católica de Pelotas (UCPEL)instacron:UCPEL2023-10-10T04:10:09Zoai:tede.ucpel.edu.br:jspui/1006Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www2.ufpel.edu.br/tede/http://tede.ucpel.edu.br:8080/oai/requestbiblioteca@ucpel.edu.br||cristiane.chim@ucpel.tche.bropendoar:2023-10-10T04:10:09Biblioteca Digital de Teses e Dissertações do UCpel - Universidade Católica de Pelotas (UCPEL)false |
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