Transferência da aplicação DIS2PPI para a plataforma web

• Autor(a) principal: Paris, André Pretto de
• Data de Publicação: 2014
• Tipo de documento: Trabalho de conclusão de curso
• Idioma: por
• Título da fonte: Repositório Institucional da UCS
• Texto Completo: https://repositorio.ucs.br/handle/11338/1266
• topic: Banco de dados - Gerência; Software - Desenvolvimento; Bioinformática; Fluxo de trabalho

O estudo do DNA humano se tornou cada vez mais complexo ao longo dos anos, e a tecnologia ajuda a compreender e a realizar as pesquisas dos profissionais da área de biologia. A bioinformática, uma união entre a biologia e a ciência da computação, utiliza-se de programas de computador para fazer inferências a partir de dados obtidos da biologia molecular, fazendo conexões entre eles e derivando predições importantes e relevantes. A biologia de sistemas, uma subárea da bioinformática, auxilia no entendimento das interações entre as populações de moléculas, células e outros organismos. Para facilitar as análises realizadas pelos biólogos, os experimentos podem ser organizados usando-se workflows ou pipelines. Um workflow científico é um experimento realizado através de uma sequência determinada de etapas. As etapas caracterizam um fluxo de execução com o propósito de integrar e processar dados para um fim específico. Para tal, foi criada a ferramenta Dis2PPI, um workflow científico que possibilitou integrar o banco de dados de doenças monogênicas OMIM (Online Mendelian Inheritance in Man) com o programa de metabuscas STRING (Search Tool for the Retrieval of Interacting Genes/Proteins) com o objetivo de criar uma rede de interação proteína-proteína associada com doenças de natureza monogênica. A ferramenta foi desenvolvida na plataforma Java como uma aplicação desktop, onde os usuários necessitam realizar o download da mesma para poder utilizá-la. Seguindo a metodologia de evolução de software de Sommerville e utilizando as tecnologias Java Server Faces, Spring, PrimeFaces e o servidor de aplicação Glassfish, a aplicação foi transferida para a plataforma web seguindo os padrões de arquitetura Model-View-Controller com o objetivo de gerenciar melhor o acesso à ferramenta e facilitar a utilização da mesma por seus usuários, além de melhorar os recursos oferecidos pela ferramenta (sic).