IntergenicDB 2.0

• Autor(a) principal: Andrade, Camila Rachel Tonin de
• Data de Publicação: 2016
• Tipo de documento: Trabalho de conclusão de curso
• Idioma: por
• Título da fonte: Repositório Institucional da UCS
• Texto Completo: https://repositorio.ucs.br/handle/11338/1553
• topic: Banco de dados - Gerência; MySQL (Sistema gerenciador de banco de dados)

O portal IntergenicDB é um repositório público no qual pesquisadores podem consultar as informações referentes a dados integrados de regiões intergênicas com as informações dos seus genes. Na versão 1.0 o portal IntergenicDB utiliza o SGBD MySQL para gerenciar os seus dados. O MySQL possui algumas limitações que estão dificultando a utilização dos usuários administrativos do portal. Este usuário enfrenta problemas de lentidão no acesso ao sistema; e dificuldade na criação de scripts SQL compatíveis com o MySQL. O site de hospedagem utilizado não fornece as versões mais atuais do MySQL. Isto gera erros nas consultas executadas e nas exportações dos dados. Por estes motivos, optou-se por migrar a base de dados existente para o SGBD PostgreSQL. Para realizar a migração foi realizado um estudo dos métodos de migração existentes, com o objetivo de se definir a forma mais adequada para transferir os dados da parte administrativa do portal. Durante a realização da migração, verificou-se problemas nos dados existentes referentes a biologia molecular. Por isso, foram realizadas adequações nas estruturas das tabelas existentes, uma nova carga de dados foi realizada e, vários testes para garantir a integridade dos dados foram realizados. As estruturas e dados das tabelas foram migradas com sucesso. Foi identificado que o problema de desempenho das consultas possuía ligação com o framework LP.Framework utilizado para acessar os dados no MySQL. A retirada do LP.Framework proporcionou um novo rumo a proposta inicial. O portal foi migrado para plataforma de desenvolvimento PHP. Esta alteração proporcionou uma evolução no layout do portal e a inclusão de novas funcionalidades (sic).