Estudo teórico das propriedades geométricas da curcumina em metanol usando dinâmica molecular de Car-parrinello

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Santin, Lauriane Gomes
Data de Publicação: 2014
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Biblioteca Digital Brasileira de Teses e Dissertações da UEG
Texto Completo: http://www.bdtd.ueg.br/handle/tede/264
Resumo: A Curcumina é um polifenol amarelo extraído do rizoma do açafrão. É utilizada como tempero, corante de alimentos e agente terapêutico. Possui atividade antioxidante, antiinflamatória, antibacteriana, antidiabetica, anticarcinogênica, dentre outras. A fórmula molecular da Curcumina é C21H20O6, seu peso molecular é 368,37 g/mol e seu ponto de fusão é aproximadamente 183ºC. A Curcumina apresenta dois isômeros planos tautoméricos, que são as formas cetônica e enólica. A forma enólica é mais estável em solução e no estado sólido. Também é a forma predominante em solução. Propomos o estudo das propriedades geométricas da Curcumina enólica em solução com metanol fazendo uso da Dinâmica Molecular de Car-Parrinello. O Método de Car-Parrinello realiza simulações ab initio utilizando a mecânica clássica para descrever o movimento iônico, obtido das soluções das equações de Newton, e a aproximação de Born-Oppenheimer para separar as coordenadas nucleares e eletrônicas. O movimento eletrônico é tratado quanticamente através da função de onda obtida da solução da equação de Schroedinger. Considera-se um parâmetro de massa fictícia que permite que a função de onda se adapte às mudanças das posições nucleares de forma que as trocas de energia entre os sistemas eletrônicos e iônicos sejam evitadas. A conexão do tratamento clássico para os íons e quântico para os elétrons é feita resolvendo as equações de movimento de Lagrange através da lagrangeana estendida de Car-Parrinello. A Curcumina foi disposta em uma caixa retangular contendo 29 moléculas de metanol. Fizemos a comparação com os resultados teóricos em DMCP para a molécula no vácuo. Analisamos as distâncias e ângulos com maiores variações. Percebemos que a presença do metanol desloca os valores médios dos comprimentos e ângulos de ligação dos seus valores no vácuo. Para a interação que apresentou maiores variações, analisamos a função de distribuição radial de pares e o tempo médio de residência. Observamos formação de camada de solvatação em alguns sítios da Curcumina. A separação adiabática se manteve constante durante toda a simulação, garantindo que não houveram trocas de energia entre o sistema iônico e eletrônico. Os resultados foram comparados com cálculos para a molécula isolada e a diferença sugere modificações na geometria da molécula.
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O Método de Car-Parrinello realiza simulações ab initio utilizando a mecânica clássica para descrever o movimento iônico, obtido das soluções das equações de Newton, e a aproximação de Born-Oppenheimer para separar as coordenadas nucleares e eletrônicas. O movimento eletrônico é tratado quanticamente através da função de onda obtida da solução da equação de Schroedinger. Considera-se um parâmetro de massa fictícia que permite que a função de onda se adapte às mudanças das posições nucleares de forma que as trocas de energia entre os sistemas eletrônicos e iônicos sejam evitadas. A conexão do tratamento clássico para os íons e quântico para os elétrons é feita resolvendo as equações de movimento de Lagrange através da lagrangeana estendida de Car-Parrinello. A Curcumina foi disposta em uma caixa retangular contendo 29 moléculas de metanol. Fizemos a comparação com os resultados teóricos em DMCP para a molécula no vácuo. Analisamos as distâncias e ângulos com maiores variações. Percebemos que a presença do metanol desloca os valores médios dos comprimentos e ângulos de ligação dos seus valores no vácuo. Para a interação que apresentou maiores variações, analisamos a função de distribuição radial de pares e o tempo médio de residência. Observamos formação de camada de solvatação em alguns sítios da Curcumina. A separação adiabática se manteve constante durante toda a simulação, garantindo que não houveram trocas de energia entre o sistema iônico e eletrônico. Os resultados foram comparados com cálculos para a molécula isolada e a diferença sugere modificações na geometria da molécula.Curcumin is a yellow polyphenol extracted from the rhizome of turmeric. It is used as a spice, food colorant and therapeutic agent. It has antioxidant, anti-inflammatory, antibacterial, antidiabetic, anticarcinogenic activity, among others. The curcumin molecular formula is C21H20O6, its molecular weight is 368,37 g/mol and its melting point is approximately 183 °C. Curcumin has two tautomeric isomers plans, which are the keto and enol forms. The enol form is more stable in solution and in solid state. It is also the predominant form in solution. We propose to study the geometric properties of Curcumin enol in solution with methanol making use of Car-Parrinello Molecular Dynamics. The Car-Parrinello method performs ab initio simulations using classical mechanics to describe the ionic motion, obtained from the solutions of the equations of Newton, and the Born-Oppenheimer approximation to separate the nuclear and electronic coordinates. The electronic motion is treated by quantum wave function obtained from the solution of the Schroedinger equation. A parameter of the fictitious mass that allows the wave function to adapt to changing nuclear positions so that the exchange of energy between electronic and ionic systems are considered to be avoided. Connecting the classical treatment for the ions and electrons to quantum is done by solving the Lagrange motion equations by Car-Parrinello extended Lagrangian. Curcumin was arranged in a rectangular box containing 29 molecules of methanol. We made the comparison with the theoretical results in CPMD for the molecule in vacuum. We analyze distances and angles with larger variations. We noticed that the presence of methanol shifts the mean values of lengths and bond angles of their values in vacuum. For interaction which showed larger variations, we analyzed the radial distribution function of pairs and residence time. Solvate formation observed in some places layer of Curcumin. The adiabatic separation remained constant throughout the simulation, ensuring that there were no exchange of energy between the ionic and electronic system. The results were compared with calculations for the isolated molecule and the difference suggests modifications to the geometry of the molecule.Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPESUniversidade Estadual de GoiásUEG ::Coordenação de Mestrado Ciências MolecularesBrasilUEGPrograma de Pós-Graduação Stricto sensu em Ciências MolecularesOliveira, Solemar Silvahttp://lattes.cnpq.br/0281797720989977Camargo, Ademir JoãoGargano, RicardoSantin, Lauriane Gomes2020-04-02T15:49:22Z2014-02-28info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfSANTIN, Lauriane Gomes. Estudo teórico das propriedades geométricas da curcumina em metanol usando dinâmica molecular de Car-parrinello. 2014. 105 f. Dissertação Câmpus Central - Sede: Anápolis - CET, (Mestrado em Ciências Moleculares) - Câmpus Central - Sede: Anápolis - CET, Universidade Estadual de Goiás, Anápolis.http://www.bdtd.ueg.br/handle/tede/264porinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Biblioteca Digital Brasileira de Teses e Dissertações da UEGinstname:Universidade Estadual de Goiás (UEG)instacron:UEG2020-12-02T19:00:19Zoai:tede2:tede/264Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttps://www.bdtd.ueg.br/PUBhttps://www.bdtd.ueg.br/oai/requestbibliotecaunucet@ueg.br||opendoar:2020-12-02T19:00:19Biblioteca Digital Brasileira de Teses e Dissertações da UEG - Universidade Estadual de Goiás (UEG)false
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