Avaliação de softwares para análises de citometria de fluxo em bananeira

• Autor(a) principal: Silva, Renata Alves Lara
• Data de Publicação: 2014
• Outros Autores: Pio, Leila Aparecida Salles, Pasqual, Moacir, Oliveira, Ana Catarina Lima de, Rodrigues, Filipe Almendagna, Silva, Sebastião de Oliveira e
• Tipo de documento: Artigo
• Idioma: eng
• Título da fonte: Semina. Ciências Agrárias (Online)
• Texto Completo: https://ojs.uel.br/revistas/uel/index.php/semagrarias/article/view/12360
• topic: Coeficiente de variação; Conteúdo de DNA; CellQuest™; WinMDI™; FlowJo™; FCS Express™.; Agronomia - 5.01.00.00-9; Coefficient of variation; DNA content; CellQuest™; WinMDI™; FlowJo™; FCS Express™.

A citometria de fluxo é uma técnica que apresenta resultados com extrema rapidez para análises de propriedades celulares como volume, complexidade morfológica e conteúdo de DNA, e é considerada mais conveniente que outras técnicas. Entretanto, as análises muitas vezes geram histogramas com variações que podem ser devidas a vários fatores, dentre os quais, as diferenças entre os softwares que realizam a aquisição dos dados gerados pelo citômetro de fluxo. Este trabalho foi realizado com o objetivo de avaliar o desempenho de quatro softwares comumente utilizados em análises de citometria de fluxo, por meio de quantificações do conteúdo de DNA e análises do coeficiente de variação gerados por eles. Foram realizadas leituras de 25 amostras foliares de bananeira ‘NBA’ (AA) utilizando o citômetro de fluxo modelo FACSCalibur (BD) e 25 histogramas de cada software (CellQuest™, WinMDI™, FlowJo™  e FCS Express™) foram analisados para obtenção do conteúdo de DNA estimado e do coeficiente de variação das estimativas. Não há diferença entre os softwares quanto aos valores de conteúdo de DNA. Entretanto, as análises do CV indicaram que a precisão do software WinMDI™ foi baixa e que os valores de CV foram subestimados, enquanto que os demais softwares apresentaram valores de CV mais condizentes com a literatura. O software CellQuest™ é recomendado por ser desenvolvido pela própria empresa fabricante do citômetro de fluxo utilizado nas análises do presente trabalho.