Análise filogenética do gene de fusão de cepas brasileiras do vírus da cinomose canina em cães

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Freitas, Luana de Almeida
Data de Publicação: 2024
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UEL
Texto Completo: https://repositorio.uel.br/handle/123456789/16004
Resumo: Resumo: A cinomose canina é uma doença viral sistêmica altamente contagiosa, de distribuição mundial e que afeta uma grande variedade de carnívoros terrestres Este estudo teve como objetivo analisar o gene F completo de cepas de campo brasileiras do vírus da cinomose canina (CDV) e compará-las com outros isolados de CDV As amostras biológicas caninas (n=15) utilizadas neste estudo foram coletadas entre 23-24 (n=6) e 213-216 (n=9) e submetidas a ensaio de RT-PCR para amplificação do gene F completo do CDV A análise das sequências com 2426 bp de 14 cepas brasileiras de CDV foram classificadas na linhagem EU1 / SA1, com um agrupamento temporal entre amostras antigas (23-24) e contemporâneas (213-216), independentemente do status vacinal dos animais amostrados Uma cepa brasileira de CDV agrupou-se na linhagem Rockborn-like, apresentando alta similaridade (98,5%) com a cepa vacinal Rockborn Para todas as cepas brasileiras, a região Fsp apresentou a maior variação nas sequências de aminoácidos (67,4% - 96,2%) As cepas brasileiras apresentaram-se mais divergentes em relação às cepas vacinais classificadas como NA1 (24,5% - 36,3%) quando comparadas com a também cepa vacinal Rockborn (11,2% - 14,9%) Dezessete resíduos de cisteína foram encontrados no gene F completo e quatro sítios de glicosilação não conservados foram identificados na região Fsp das cepas brasileiras de CDV Os resultados sugerem a circulação da linhagem EU1 / SA1 por 25 anos no Brasil e a atual cocirculação de cepas antigas e contemporâneas de CDV A região Fsp demonstrou ser adequada para estudos evolutivos Este é o primeiro estudo que realizou a análise do gene F completo de cepas de camplo brasileiras de CDV contribuindo com informações relacionadas com a epidemiologia molecular do vírus
id UEL_0fb6f96d4efd35ff64b01b1f20864b50
oai_identifier_str oai:repositorio.uel.br:123456789/16004
network_acronym_str UEL
network_name_str Repositório Institucional da UEL
repository_id_str
spelling Análise filogenética do gene de fusão de cepas brasileiras do vírus da cinomose canina em cãesCãoDoençasCinomoseVírusFilogeniaDogCanine distemperVeterinary virologyDiseasesResumo: A cinomose canina é uma doença viral sistêmica altamente contagiosa, de distribuição mundial e que afeta uma grande variedade de carnívoros terrestres Este estudo teve como objetivo analisar o gene F completo de cepas de campo brasileiras do vírus da cinomose canina (CDV) e compará-las com outros isolados de CDV As amostras biológicas caninas (n=15) utilizadas neste estudo foram coletadas entre 23-24 (n=6) e 213-216 (n=9) e submetidas a ensaio de RT-PCR para amplificação do gene F completo do CDV A análise das sequências com 2426 bp de 14 cepas brasileiras de CDV foram classificadas na linhagem EU1 / SA1, com um agrupamento temporal entre amostras antigas (23-24) e contemporâneas (213-216), independentemente do status vacinal dos animais amostrados Uma cepa brasileira de CDV agrupou-se na linhagem Rockborn-like, apresentando alta similaridade (98,5%) com a cepa vacinal Rockborn Para todas as cepas brasileiras, a região Fsp apresentou a maior variação nas sequências de aminoácidos (67,4% - 96,2%) As cepas brasileiras apresentaram-se mais divergentes em relação às cepas vacinais classificadas como NA1 (24,5% - 36,3%) quando comparadas com a também cepa vacinal Rockborn (11,2% - 14,9%) Dezessete resíduos de cisteína foram encontrados no gene F completo e quatro sítios de glicosilação não conservados foram identificados na região Fsp das cepas brasileiras de CDV Os resultados sugerem a circulação da linhagem EU1 / SA1 por 25 anos no Brasil e a atual cocirculação de cepas antigas e contemporâneas de CDV A região Fsp demonstrou ser adequada para estudos evolutivos Este é o primeiro estudo que realizou a análise do gene F completo de cepas de camplo brasileiras de CDV contribuindo com informações relacionadas com a epidemiologia molecular do vírusDissertação (Mestrado em Ciência Animal) - Universidade Estadual de Londrina, Centro de Ciências Agrárias, Programa de Pós-Graduação em Ciência AnimalAbstract: Canine distemper is a highly contagious systemic viral disease of worldwide distribution and that affects a wide variety of terrestrial carnivores This study aimed to analyze the whole canine distemper virus (CDV) F gene of Brazilian field strains isolated in dogs and compared it with other CDV isolates Canine biological samples (n = 15) that were collected among 23-24 (n=6) and 213-216 (n=9) were subjected to RT-PCR assays for the amplification of full-length CDV F gene The sequence analysis of 2,426 bp length of 14 Brazilian CDV field strains were classified as EU1/SA1 lineage, with a temporal clustering into past (23-24) and contemporaneous (213-216) strains, regardless of the vaccination status of animals sampled One Brazilian strain clustered into the Rockborn-like lineage, showing high similarity (985%) with the Rockborn vaccine isolate For all the Brazilian strains, the Fsp region showed high aa variation (674% – 962%) The Brazilian strains were more Fsp-divergent of the NA1 (245% – 363%) than to the Rockborn (112% – 149%) vaccine strains Seventeen cysteine residues in the full-length F gene and four non-conserved glycosylation sites were found in the Fsp region of Brazilian CDV strains The results suggest a 25-year circulation of EU1/SA1 lineage in Brazil and reveal a currently co-circulation of past and contemporaneous CDV strains The Fsp-coding region of CDV genome was shown to be suitable for evolutionary studies This is the first study dedicated to the whole CDV F gene analysis from Brazilian field strains, complementing the knowledge on molecular epidemiology of the virusAlfieri, Alice Fernandes [Orientador]Vilas-Bôas, Laurival AntônioTakiuchi, ElisabeteFreitas, Luana de Almeida2024-05-01T14:59:22Z2024-05-01T14:59:22Z2017.0028.04.2017info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttps://repositorio.uel.br/handle/123456789/16004porMestradoCiência AnimalCentro de Ciências AgráriasPrograma de Pós-graduação em Ciência AnimalLondrinareponame:Repositório Institucional da UELinstname:Universidade Estadual de Londrina (UEL)instacron:UELinfo:eu-repo/semantics/openAccess2024-07-12T04:19:48Zoai:repositorio.uel.br:123456789/16004Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.bibliotecadigital.uel.br/PUBhttp://www.bibliotecadigital.uel.br/OAI/oai2.phpbcuel@uel.br||opendoar:2024-07-12T04:19:48Repositório Institucional da UEL - Universidade Estadual de Londrina (UEL)false
dc.title.none.fl_str_mv Análise filogenética do gene de fusão de cepas brasileiras do vírus da cinomose canina em cães
title Análise filogenética do gene de fusão de cepas brasileiras do vírus da cinomose canina em cães
spellingShingle Análise filogenética do gene de fusão de cepas brasileiras do vírus da cinomose canina em cães
Freitas, Luana de Almeida
Cão
Doenças
Cinomose
Vírus
Filogenia
Dog
Canine distemper
Veterinary virology
Diseases
title_short Análise filogenética do gene de fusão de cepas brasileiras do vírus da cinomose canina em cães
title_full Análise filogenética do gene de fusão de cepas brasileiras do vírus da cinomose canina em cães
title_fullStr Análise filogenética do gene de fusão de cepas brasileiras do vírus da cinomose canina em cães
title_full_unstemmed Análise filogenética do gene de fusão de cepas brasileiras do vírus da cinomose canina em cães
title_sort Análise filogenética do gene de fusão de cepas brasileiras do vírus da cinomose canina em cães
author Freitas, Luana de Almeida
author_facet Freitas, Luana de Almeida
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Alfieri, Alice Fernandes [Orientador]
Vilas-Bôas, Laurival Antônio
Takiuchi, Elisabete
dc.contributor.author.fl_str_mv Freitas, Luana de Almeida
dc.subject.por.fl_str_mv Cão
Doenças
Cinomose
Vírus
Filogenia
Dog
Canine distemper
Veterinary virology
Diseases
topic Cão
Doenças
Cinomose
Vírus
Filogenia
Dog
Canine distemper
Veterinary virology
Diseases
description Resumo: A cinomose canina é uma doença viral sistêmica altamente contagiosa, de distribuição mundial e que afeta uma grande variedade de carnívoros terrestres Este estudo teve como objetivo analisar o gene F completo de cepas de campo brasileiras do vírus da cinomose canina (CDV) e compará-las com outros isolados de CDV As amostras biológicas caninas (n=15) utilizadas neste estudo foram coletadas entre 23-24 (n=6) e 213-216 (n=9) e submetidas a ensaio de RT-PCR para amplificação do gene F completo do CDV A análise das sequências com 2426 bp de 14 cepas brasileiras de CDV foram classificadas na linhagem EU1 / SA1, com um agrupamento temporal entre amostras antigas (23-24) e contemporâneas (213-216), independentemente do status vacinal dos animais amostrados Uma cepa brasileira de CDV agrupou-se na linhagem Rockborn-like, apresentando alta similaridade (98,5%) com a cepa vacinal Rockborn Para todas as cepas brasileiras, a região Fsp apresentou a maior variação nas sequências de aminoácidos (67,4% - 96,2%) As cepas brasileiras apresentaram-se mais divergentes em relação às cepas vacinais classificadas como NA1 (24,5% - 36,3%) quando comparadas com a também cepa vacinal Rockborn (11,2% - 14,9%) Dezessete resíduos de cisteína foram encontrados no gene F completo e quatro sítios de glicosilação não conservados foram identificados na região Fsp das cepas brasileiras de CDV Os resultados sugerem a circulação da linhagem EU1 / SA1 por 25 anos no Brasil e a atual cocirculação de cepas antigas e contemporâneas de CDV A região Fsp demonstrou ser adequada para estudos evolutivos Este é o primeiro estudo que realizou a análise do gene F completo de cepas de camplo brasileiras de CDV contribuindo com informações relacionadas com a epidemiologia molecular do vírus
publishDate 2024
dc.date.none.fl_str_mv 2017.00
2024-05-01T14:59:22Z
2024-05-01T14:59:22Z
28.04.2017
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://repositorio.uel.br/handle/123456789/16004
url https://repositorio.uel.br/handle/123456789/16004
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.relation.none.fl_str_mv Mestrado
Ciência Animal
Centro de Ciências Agrárias
Programa de Pós-graduação em Ciência Animal
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.coverage.none.fl_str_mv Londrina
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da UEL
instname:Universidade Estadual de Londrina (UEL)
instacron:UEL
instname_str Universidade Estadual de Londrina (UEL)
instacron_str UEL
institution UEL
reponame_str Repositório Institucional da UEL
collection Repositório Institucional da UEL
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UEL - Universidade Estadual de Londrina (UEL)
repository.mail.fl_str_mv bcuel@uel.br||
_version_ 1809823257134628864