Medidas de distância e algoritmos de agrupamento na caracterização e avaliação de germoplasma de Capsicum spp

• Autor(a) principal: Aranha, Fabrizio Malaghini
• Data de Publicação: 2024
• Tipo de documento: Dissertação
• Idioma: por
• Título da fonte: Repositório Institucional da UEL
• Texto Completo: https://repositorio.uel.br/handle/123456789/10361
• topic: Pimenta; melhoramento genético; Germoplasma vegetal; Recursos; Genética vegetal; Peppers; Plant genetics; Germplasm resources, Plant-; Algorithms; Utilization; Breeding

Resumo: Com o aumento da perda da variabilidade genética, devido a queimadas, desmatamentos e a procura por genótipos mais adaptados e produtivos a caracterização e a avaliação dos genótipos conservados em um banco de germoplasma são de elevada importância A caracterização e a avaliação podem ser obtidas de várias formas, gerando, eventualmente, dados quantitativos e qualitativos Uma análise conjunta dessas variáveis pode ser considerada uma excelente estratégia para a avalição do germoplasma Dessa forma, esse trabalho foi desenvolvido com o objetivo de avaliar diferentes medidas de distância e agrupamentos para caracterização e avaliação de acessos de Capsicum spp Foram utilizados dados de caracterização de uma coleção de 54 acessos de Capsicum spp do banco de germoplasma da Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro (UENF) As distâncias utilizadas foram seis quantitativas (A1 – média das diferenças absoluta dos rank-padronizados, A2 – correlação de Pearson, A3 – Kulczynski, A4 – Canberra, A5 – Bray-Curtis, e A6 – Morisita) combinadas com a distância para dados qualitativos – Coincidência Simples (B1) Os agrupamentos foram realizados pelos métodos hierárquicos aglomerativos (UPGMA, e Ward) e não-hierárquicos (K-médias e PCAmix) Todas as distâncias combinadas foram altamente correlacionadas Pelo coeficiente de correlação cofenética entre as matrizes de agrupamentos hierárquicos e de distância combinada, o agrupamento UPGMA obteve os maiores valores, entretanto aplicando o coeficiente aglomerativo, o agrupamento Ward obteve os maiores valores em relação ao UPGMA Quando foi utilizado como metodologia a representação gráfica da área sob a função da densidade acumulativa na determinação do número ótimo de grupos com diferentes distâncias combinadas, três grupos foram considerados como número ideal para maioria dos agrupamentos Apenas para as distâncias A5B1 e A6B1 utilizando o Ward, e A5B1 utilizando K-médias não foi possível determinar o número ótimo de grupos Comparando os agrupamentos obtidos pelo método Ward e UPGMA, verifica-se que o método Ward obteve maior eficiência em maximizar as dessemelhanças entre os complexos C annuum e C baccatum nas distâncias combinadas A2B1, A3B1, A5B1 e A6B1 A análise do PCAmix permitiu a separação dos acessos em relação a espécies, utilizando simultaneamente dados quantitativos e qualitativos, demostrando ser uma alternativa para análise simultânea dos dados conjuntos, visando uma comparação entre diferentes agrupamentos